Libri introduttivi sulle scienze della natura dietro la bioinformatica


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La mia domanda va a coloro che si occupano di algoritmi di biologia computazionale. Farò un corso di bioinformatica questo autunno; il problema, tuttavia, è che ho un background troppo scarso in biologia e chimica per sentirmi preparato per quel ciclo di lezioni (ero piuttosto debole con queste materie a scuola).

Potresti consigliare qualche libro che fornisca una buona introduzione alle domande di scienze naturali su cui si concentra la bioinformatica?


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In altre parole, stai cercando libri di biologia? In tal caso, la domanda dovrebbe essere su biology.SE . Votare per chiudere come offtopico.
Raffaello

Dalla mia esperienza in bioinformatica, non avrai bisogno di molta biologia, se i corsi sono tenuti da informatici. Dovresti chiedere al professore che terrà le lezioni quanta conoscenza preliminare si presume.
Raffaello

È una domanda totalmente valida per CS.
Gigili

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Questo era il nostro libro di consultazione in corso bioinformatico, è quello che stai cercando? Potresti dirci di più sul contenuto del corso?
Gigili,

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@Gigili - davvero ?! Un libro su Neural Networks sembra a prima vista avere poco a che fare con la bioinformatica quotidiana. La biologia computazionale / bioinformatica normalmente non prende idee biologiche e le applica nelle scienze informatiche, è più comunemente l'applicazione dell'informatica per risolvere i problemi biologici.
iandotkelly,

Risposte:


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Come affermato in precedenza, non è assolutamente necessario studiare biologia per fare bioinformatica. Tuttavia, se desideri avere una conoscenza di base dei concetti di base come geni, RNA, DNA, ecc., Un buon libro introduttivo sulla biologia dovrebbe fornire tutto ciò di cui hai bisogno.

Tuttavia, la biologia molecolare non è il tipo di argomento su cui ci si può semplicemente immergere. Pertanto, per capirlo, devi fare alcune letture introduttive. Il miglior libro è quello che ha abbastanza dettagli senza dare per scontato che desideri diventare un biologo.

Ti suggerisco di guardare Collins Outline of College Biology. La lettura dei capitoli 2-5 e 12-15 dovrebbe darti le informazioni di base che desideri. Un'altra scelta è Schaum's Outline of Biology, Third Edition, capitoli 2-4 e 7-10. Entrambi i libri costano meno di $ 20,00 e sono facili da capire. Spero che questo ti aiuti.


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Come qualcuno che proviene da un background informatico e ha guidato un team nello sviluppo di un prodotto che coinvolge la bioinformatica, posso simpatizzare con la sfida di acquisire il dominio, ma è un'area affascinante in cui lavorare.

Come ha sottolineato @JCEHR, non è un requisito assoluto studiare biologia, ma è utile iniziare a raccogliere alcuni dei principi. La bioinformatica non riguarda solo la biologia molecolare, il sequenziamento genomico, l'espressione proteica e la struttura proteica (non preoccuparti se non capisci questi termini ora) ma sono abbastanza fiducioso che questa è l'area che la stragrande maggioranza della "bioinformatica tradizionale" viene applicato e sarebbe il cuore di qualsiasi corso sull'argomento. Una delle caratteristiche misurabili più importanti di DNA, RNA e proteine ​​è che sono una serie di molecole che possono essere rappresentate da una stringa di software: l'annotazione, la memorizzazione e la ricerca (sfocata) di tali stringhe sono tecniche chiave.

Oltre a un corso di biologia generale, potresti anche considerare di guardare un libro che discute della genomica. Quanto segue sembra buono ma è piuttosto costoso:

A Primer of Genome Science , di Greg Gibson e Spencer V. Muse


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Come scienziato informatico che ha fatto il loro minore in biochimica, la mia raccomandazione sarebbe la guida alla genetica dei cartoni di Larry Gonick .

Questo non è uno scherzo. Conosco diversi rispettabili bioinformatici che hanno imparato la genetica in questo modo. Il libro spiega la maggior parte di ciò che, se non di tutto, dovrai conoscere e fornisce gli elementi visivi più intuitivi per avvolgere la tua mente attorno ai concetti sottostanti. Ed è una lettura divertente.


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