Attualmente sto scrivendo la mia proposta di dottorato, che riguarda la ricerca di modi per applicare la teoria dalla complessità parametrizzata, principalmente le decomposizioni degli alberi, a problemi realistici di ottimizzazione della rete. Ma ho principalmente intenzione di lavorare con Steiner Tree, non all'ultimo posto perché è semplice e ci sono molti documenti / benchmark disponibili.
Sono incappato in questa domanda perché anche io ho qualche problema a trovare motivazioni pratiche per studiarla. Penso che la sua rilevanza pratica sia più facilmente motivata dall'enorme quantità di problemi di ottimizzazione che sono generalizzazioni della STP vaniglia ma sono più flessibili. C'è una bella lista qui: http://theory.cs.uni-bonn.de/info5/steinerkompendium/netcompendium.pdf
Penso che alcuni dei problemi menzionati con gli alberi filogenetici possano essere formulati direttamente come STP ma non ho letto attentamente i documenti.
Anche questo algoritmo per l'ubicazione della struttura connessa e l'affitto o l'acquisto a fonte singola è interessante: http://sma.epfl.ch/~eisenbra/Publications/jcss08cfl_final.pdf
Sebbene non modellati direttamente come STP, le soluzioni a questi problemi hanno un core che è un albero di Steiner e l'algoritmo utilizza direttamente un algoritmo di approssimazione STP per risolvere quella parte.
Anche per quanto riguarda l'euristica dell'STP potresti essere interessato a questa pagina: http://dimacs11.cs.princeton.edu/workshop.html
Ci sono alcuni nuovi algoritmi competitivi che sono stati presentati lì.
Modifica: potresti anche dare un'occhiata a questo libro di William Cook:
Alla ricerca del commesso viaggiatore
Riguarda il TSP, ma quello è similmente teorico. Il capitolo 3 contiene davvero un sacco di usi pratici concreti, non solo il banale tour alla ricerca di cose, ma problemi inaspettati che possono essere risolti risolvendo un TSP, inclusi alcuni problemi di biologia come ho già detto. Parte del motivo dell'applicabilità sembra essere il fatto che esiste un risolutore TSP molto potente e accessibile là fuori, il che rende conveniente riformulare i problemi di progettazione come TSP. L'ho trovato davvero stimolante in quanto lo stesso tipo di applicazioni potrebbe essere trovato per l'STP, penso (ma non esiste un risolutore "standard di settore", quindi non succede nella realtà). Alcuni dei capitoli sono gratuiti su Google Libri, anche se ti consiglio di metterti le mani sulla versione completa perché alcuni dei migliori esempi vengono lasciati fuori.