Risposte:
Probabilmente la guida più importante all'algoritmo sperimentale è l'articolo di David Johnson su come farlo, che ha anche molti riferimenti.
http://www2.research.att.com/~dsj/papers/experguide.pdf
Catherine McGeoch ha un bel documento in cui ha cercato di divulgare il campo: algoritmi sperimentali . Un altro sforzo simile è di Peter Sanders: Algorithm Engineering - An Attempt at a Definition (http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-03456-5_22).
Comunque IMO la migliore introduzione al campo è la programmazione Pearl di Jon Bentley. Mostra diversi casi reali di applicazione di algoritmi sperimentali con grandi connessioni a diverse aree della sienza.