Se ho capito correttamente la domanda, hai addestrato un algoritmo che divide i tuoi dati in cluster disgiunti. Ora si desidera assegnare la previsione 1 ad alcuni sottogruppi dei cluster e 0 al resto di essi. E tra quei sottoinsiemi, vuoi trovare quelli pareto-ottimali, cioè quelli che massimizzano il vero tasso positivo dato il numero fisso di previsioni positive (questo equivale a fissare il PPV). È corretto?N10
Sembra molto un problema con lo zaino ! Le dimensioni del cluster sono "pesi" e il numero di campioni positivi in un cluster sono "valori" e si desidera riempire lo zaino di capacità fissa con il maggior valore possibile.
v a l u ew e i gh tKK0N
1k - 1p ∈ [ 0 , 1 ]K
Ecco un esempio di Python:
import numpy as np
from itertools import combinations, chain
import matplotlib.pyplot as plt
np.random.seed(1)
n_obs = 1000
n = 10
# generate clusters as indices of tree leaves
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.model_selection import cross_val_predict
X, target = make_classification(n_samples=n_obs)
raw_clusters = DecisionTreeClassifier(max_leaf_nodes=n).fit(X, target).apply(X)
recoding = {x:i for i, x in enumerate(np.unique(raw_clusters))}
clusters = np.array([recoding[x] for x in raw_clusters])
def powerset(xs):
""" Get set of all subsets """
return chain.from_iterable(combinations(xs,n) for n in range(len(xs)+1))
def subset_to_metrics(subset, clusters, target):
""" Calculate TPR and FPR for a subset of clusters """
prediction = np.zeros(n_obs)
prediction[np.isin(clusters, subset)] = 1
tpr = sum(target*prediction) / sum(target) if sum(target) > 0 else 1
fpr = sum((1-target)*prediction) / sum(1-target) if sum(1-target) > 0 else 1
return fpr, tpr
# evaluate all subsets
all_tpr = []
all_fpr = []
for subset in powerset(range(n)):
tpr, fpr = subset_to_metrics(subset, clusters, target)
all_tpr.append(tpr)
all_fpr.append(fpr)
# evaluate only the upper bound, using knapsack greedy solution
ratios = [target[clusters==i].mean() for i in range(n)]
order = np.argsort(ratios)[::-1]
new_tpr = []
new_fpr = []
for i in range(n):
subset = order[0:(i+1)]
tpr, fpr = subset_to_metrics(subset, clusters, target)
new_tpr.append(tpr)
new_fpr.append(fpr)
plt.figure(figsize=(5,5))
plt.scatter(all_tpr, all_fpr, s=3)
plt.plot(new_tpr, new_fpr, c='red', lw=1)
plt.xlabel('TPR')
plt.ylabel('FPR')
plt.title('All and Pareto-optimal subsets')
plt.show();
Questo codice disegnerà una bella foto per te:
210
E ora un po 'di sale: non dovevi preoccuparti affatto dei sottoinsiemi ! Quello che ho fatto è stato ordinato le foglie degli alberi in base alla frazione di campioni positivi in ciascuno. Ma quello che ho ottenuto è esattamente la curva ROC per la previsione probabilistica dell'albero. Ciò significa che non è possibile sovraperformare l'albero selezionando a mano le sue foglie in base alle frequenze target nel set di allenamento.
Puoi rilassarti e continuare a usare la normale previsione probabilistica :)