InnoDB - I / O di scrittura su disco alto su file ibdata1 e ib_logfile0


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Specifiche del server: VPS con le seguenti informazioni

model name  : Intel(R) Xeon(R) CPU           E5649  @ 2.53GHz
MemTotal:      2058776 kB
MemFree:        244436 kB

Stiamo eseguendo IP.Board di Invision Power Services, stiamo usando innodb_file_per_tablee abbiamo ricaricato il database per ridurre le dimensioni di ibdata1. Tuttavia, abbiamo ancora problemi di utilizzo elevato di CPU e I / O negli ultimi tempi, nonostante le ibdata1dimensioni ridotte .

Dalla mia ispezione, credo che causi da un elevato utilizzo I / O su ibdata1. Di seguito sono riportati i dati che ho ottenuto utilizzando pt-ioprofile -cell sizes(in Percona ToolKit). Fondamentalmente, è la quantità di I / O totale raccolta nel periodo di 30 secondi.

# pt-ioprofile -cell sizes
Fri Jul 20 10:22:23 ICT 2012
Tracing process ID 8581
     total      pread       read     pwrite      fsync       open      close   getdents      lseek      fcntl filename
   6995968          0          0    6995968          0          0          0          0          0          0 /db/mysql/ibdata1
   1019904          0          0    1019904          0          0          0          0          0          0 /db/mysql/ib_logfile0
    204800     204800          0          0          0          0          0          0          0          0 /db/mysql/admin_phpbb3forum/phpbb_posts.ibd
     49152      49152          0          0          0          0          0          0          0          0 /db/mysql/admin_ips/ips_reputation_cache.ibd
     32768      32768          0          0          0          0          0          0          0          0 /db/mysql/admin_ips/ips_reputation_totals.ibd
     29808          0          0          0          0          0          0      29808          0          0 /db/mysql/admin_ips/
... (other trivial I/O records truncated)

Correre iotope vedo DISK WRITE:va su e giù intorno 2M/se200K/s

La mia domanda è, perché abbiamo O di scrittura ad alta I / su ibdata1e ib_logfileXmentre noi abbiamo solo circa 5-10 piccolo aggiornamento al secondo nelle nostre tavole sessioni, che sono anche MEMORYtavolo (solo circa 300K di dimensione)? Mi sconcerta perché non esiste un I / O di scrittura equivalente su nessun altro file di tabella, il che indica che l'I / O di scrittura non è causato da UPDATE/INSERT/DELETE.

Nota che sono solo un programmatore che per caso ha il dovere di mantenerlo, quindi non esitare a chiedere maggiori informazioni. Ho fatto molte cose su questo server, ma per favore non dare per scontato che avrei fatto qualsiasi cosa che avrei dovuto fare già.

Informazioni addizionali:

# ls -l /db/mysql/ib*
-rw-rw---- 1 mysql mysql  18874368 Jul 21 01:26 /db/mysql/ibdata1
-rw-rw---- 1 mysql mysql 134217728 Jul 21 01:26 /db/mysql/ib_logfile0
-rw-rw---- 1 mysql mysql 134217728 Jul 21 01:26 /db/mysql/ib_logfile1

e

mysql> SHOW VARIABLES LIKE 'innodb%';
+-------------------------------------------+------------------------+
| Variable_name                             | Value                  |
+-------------------------------------------+------------------------+
| innodb_adaptive_flushing                  | ON                     |
| innodb_adaptive_flushing_method           | estimate               |
| innodb_adaptive_hash_index                | ON                     |
| innodb_adaptive_hash_index_partitions     | 1                      |
| innodb_additional_mem_pool_size           | 20971520               |
| innodb_autoextend_increment               | 8                      |
| innodb_autoinc_lock_mode                  | 1                      |
| innodb_blocking_buffer_pool_restore       | OFF                    |
| innodb_buffer_pool_instances              | 1                      |
| innodb_buffer_pool_restore_at_startup     | 0                      |
| innodb_buffer_pool_shm_checksum           | ON                     |
| innodb_buffer_pool_shm_key                | 0                      |
| innodb_buffer_pool_size                   | 402653184              |
| innodb_change_buffering                   | all                    |
| innodb_checkpoint_age_target              | 0                      |
| innodb_checksums                          | ON                     |
| innodb_commit_concurrency                 | 0                      |
| innodb_concurrency_tickets                | 500                    |
| innodb_corrupt_table_action               | assert                 |
| innodb_data_file_path                     | ibdata1:10M:autoextend |
| innodb_data_home_dir                      |                        |
| innodb_dict_size_limit                    | 0                      |
| innodb_doublewrite                        | ON                     |
| innodb_doublewrite_file                   |                        |
| innodb_fake_changes                       | OFF                    |
| innodb_fast_checksum                      | OFF                    |
| innodb_fast_shutdown                      | 1                      |
| innodb_file_format                        | Barracuda              |
| innodb_file_format_check                  | ON                     |
| innodb_file_format_max                    | Barracuda              |
| innodb_file_per_table                     | ON                     |
| innodb_flush_log_at_trx_commit            | 2                      |
| innodb_flush_method                       | O_DIRECT               |
| innodb_flush_neighbor_pages               | 0                      |
| innodb_force_load_corrupted               | OFF                    |
| innodb_force_recovery                     | 0                      |
| innodb_ibuf_accel_rate                    | 100                    |
| innodb_ibuf_active_contract               | 1                      |
| innodb_ibuf_max_size                      | 201310208              |
| innodb_import_table_from_xtrabackup       | 0                      |
| innodb_io_capacity                        | 4000                   |
| innodb_kill_idle_transaction              | 0                      |
| innodb_large_prefix                       | OFF                    |
| innodb_lazy_drop_table                    | 0                      |
| innodb_lock_wait_timeout                  | 50                     |
| innodb_locks_unsafe_for_binlog            | OFF                    |
| innodb_log_block_size                     | 4096                   |
| innodb_log_buffer_size                    | 4194304                |
| innodb_log_file_size                      | 134217728              |
| innodb_log_files_in_group                 | 2                      |
| innodb_log_group_home_dir                 | ./                     |
| innodb_max_dirty_pages_pct                | 75                     |
| innodb_max_purge_lag                      | 0                      |
| innodb_mirrored_log_groups                | 1                      |
| innodb_old_blocks_pct                     | 37                     |
| innodb_old_blocks_time                    | 0                      |
| innodb_open_files                         | 300                    |
| innodb_page_size                          | 16384                  |
| innodb_purge_batch_size                   | 20                     |
| innodb_purge_threads                      | 1                      |
| innodb_random_read_ahead                  | OFF                    |
| innodb_read_ahead                         | linear                 |
| innodb_read_ahead_threshold               | 56                     |
| innodb_read_io_threads                    | 24                     |
| innodb_recovery_stats                     | OFF                    |
| innodb_recovery_update_relay_log          | OFF                    |
| innodb_replication_delay                  | 0                      |
| innodb_rollback_on_timeout                | OFF                    |
| innodb_rollback_segments                  | 128                    |
| innodb_show_locks_held                    | 10                     |
| innodb_show_verbose_locks                 | 0                      |
| innodb_spin_wait_delay                    | 6                      |
| innodb_stats_auto_update                  | 0                      |
| innodb_stats_method                       | nulls_equal            |
| innodb_stats_on_metadata                  | OFF                    |
| innodb_stats_sample_pages                 | 8                      |
| innodb_stats_update_need_lock             | 1                      |
| innodb_strict_mode                        | OFF                    |
| innodb_support_xa                         | ON                     |
| innodb_sync_spin_loops                    | 30                     |
| innodb_table_locks                        | ON                     |
| innodb_thread_concurrency                 | 0                      |
| innodb_thread_concurrency_timer_based     | OFF                    |
| innodb_thread_sleep_delay                 | 10000                  |
| innodb_use_global_flush_log_at_trx_commit | ON                     |
| innodb_use_native_aio                     | ON                     |
| innodb_use_sys_malloc                     | ON                     |
| innodb_use_sys_stats_table                | OFF                    |
| innodb_version                            | 1.1.8-rel27.1          |
| innodb_write_io_threads                   | 24                     |
+-------------------------------------------+------------------------+
90 rows in set (0.00 sec)

Da @RolandoMySQLDBA: eseguire questo

SET @TimeInterval = 300;
SELECT variable_value INTO @num1 FROM information_schema.global_status
WHERE variable_name = 'Innodb_os_log_written';
SELECT SLEEP(@TimeInterval);
SELECT variable_value INTO @num2 FROM information_schema.global_status
WHERE variable_name = 'Innodb_os_log_written';
SET @ByteWrittenToLog = @num2 - @num1;
SET @KB_WL = @ByteWrittenToLog / POWER(1024,1) * 3600 / @TimeInterval;
SET @MB_WL = @ByteWrittenToLog / POWER(1024,2) * 3600 / @TimeInterval;
SET @GB_WL = @ByteWrittenToLog / POWER(1024,3) * 3600 / @TimeInterval;
SELECT @KB_WL,@MB_WL,@GB_WL;

e mostra l'output. Questo ti dirà quanti byte all'ora vengono scritti in ib_logfile0 / ib_logfile1 in base ai prossimi 5 minuti.

Sopra il risultato della query SQL (alle 8 ora locale, mentre i membri online rappresentano circa il 25% delle statistiche durante il giorno):

mysql> SELECT @KB_WL,@MB_WL,@GB_WL;
+--------+----------+-------------------+
| @KB_WL | @MB_WL   | @GB_WL            |
+--------+----------+-------------------+
|  95328 | 93.09375 | 0.090911865234375 |
+--------+----------+-------------------+
1 row in set (0.00 sec)

Si prega di eseguire il seguente ls -l /var/lib/mysql/ib*voglio vedere le dimensioni del file. Devo anche sapere quale versione di MySQL stai utilizzando e se tutti i tuoi dati sono InnoDB.
RolandoMySQLDBA,

Esegui questo: SHOW VARIABLES LIKE 'innodb%';e mostralo nella tua domanda !!!
RolandoMySQLDBA

@RolandoMySQLDBA Grazie per l'interesse. La domanda ora viene aggiornata con le dimensioni del file e le variabili innodb.
tia

Quanta RAM sul DB Server ???
RolandoMySQLDBA

@RolandoMySQLDBA Ha ottenuto 2 GB. Ho aggiornato la domanda di conseguenza.
tia,

Risposte:


7

Ecco alcune cose che potresti cambiare

  • innodb_log_buffer_size : hai 4M. L'impostazione predefinita è 8M. Prova a portarlo a 8M.
  • innodb_log_file_size : hai 128M. Date le seguenti informazioni fornite
    • si scrive su 93 MB all'ora nei file di registro innodb, in base al 25% delle statistiche
    • l'ora di punta sarebbe di circa 372 MB all'ora
    • la metà è di 186 MB arrotondati a 192 MB
    • impostare innodb_log_file_size su 192M
  • innodb_io_capacity sembra un po 'alto, rendilo 200 o 300 (a seconda dell'hardware)
  • innodb_read_io_threads e innodb_write_io_threads dovrebbero essere al massimo a 64. A volte, meno è meglio in un ambiente pesante per la scrittura. Usa 8 o 16 in questi casi.

Per modificare innodb_log_file_size in 192M, aggiungilo a /etc/my.cnf

[mysqld]
innodb_log_buffer_size=8M
innodb_log_file_size=192M
innodb_open_files=300
innodb_read_io_threads=64
innodb_write_io_threads=64

quindi procedi come segue

mysql -u... -p... -e"FLUSH TABLES;"
service mysql stop
mv /var/lib/mysql/ib_logfile0 /var/lib/mysql/ib_logfile0000
mv /var/lib/mysql/ib_logfile1 /var/lib/mysql/ib_logfile0001
service mysql start

Prova questo durante i tempi lenti e vedi se questo migliora le cose

AGGIORNAMENTO 2012-10-19 12:31 EDT

Per mettere in prospettiva la tua situazione, pensa a quali sono gli scopi di ibdata1 e ib_logfile0 / 1. Invece di riscrivere tutto, leggi il mio post più recente sui file di registro ibdata1 e InnoDB: Cosa sono esattamente i file iblog in mysql

Dopo aver letto l'altro mio post, ora considera questo: cosa aumenterebbe l'I / O su questi file?

  • Aggiornamento degli indici secondari nel buffer di inserimento di ibdata1
  • Pulizia dei segmenti di rollback / Annulla spazio

IMHO Vorrei aumentare il pool di buffer InnoDB da 384M a 1G.

Vorrei anche raccomandare l'aggiornamento della RAM a 8G

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