R gstat krige () - Matrice di covarianza singolare nella posizione [5.88,47.4,0]: salto


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Quando voglio eseguire il kriging funziona solo qualche volta, a seconda dei valori che uso nel mio datatable. Come risultato della funzione Krige ricevo per var1.pred: NA NA NA ...e var1.var: NA NA NA ...(ma solo quando uso i valori "sbagliati" nel mio datatable.)

Per esempio:

  • esso funziona sempre (finora) quando uso solo 10 valori
  • esso funziona quando uso 50 valori, ma solo con quelle determinate
  • non funziona quando uso 50 valori e i valori "sbagliati"
  • esso funziona quando uso 25 valori ed i valori "sbagliati" prima menzionati

Non capisco perché a volte funziona e talvolta no. La cosa strana è che quando aggiungo Zwiesel;49.02999878;13.22999954;2.2al datatable funziona quando uso meno di ~ 20 valori, ma non funziona quando uso più di 50 valori ...

Dov'è il mio errore?

myWeatherTable.csv:

Place;Latitude;Longitude;Temperature
Aachen;50.77999878;6.09999990;3
Abbikenhausen;53.52999878;8.00000000;7.9
Adelbach;49.04000092;9.76000023;3.1
Adendorf;51.61999893;11.69999981;1.9
Alberzell;48.45999908;11.34000015;4.6
...
...

Il mio codice per eseguire l'interpolazione kriging

WeatherData <- read.csv(file="myWeatherTable", header = TRUE, sep ";")

coordinates(WeatherData) = ~Longitude + Latitude

vario <-  variogram(log(Temperature) ~1, WeatherData)
vario.fit <- fit.variogram(vario, vgm("Sph"))

min_lon <- min(WeatherData$Longitude)
max_lon <- max(WeatherData$Longitude)
min_lat <- min(WeatherData$Latitude)
max_lat <- max(WeatherData$Latitude)
Longitude.range <- as.numeric(c(min_lon,max_lon))
Latitude.range <- as.numeric(c(min_lat,max_lat))
grd <- expand.grid(Longitude = seq(from = Longitude.range[1], to = Longitude.range[2], by = 0.1),
  Latitude = seq(from = Latitude.range[1],to = Latitude.range[2], by = 0.1))
coordinates(grd) <- ~Longitude + Latitude
gridded(grd) <- TRUE

plot1 <- WU_data_spatial %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points with measurements")

plot2 <- grd %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points at which to estimate")

grid.arrange(plot1, plot2, ncol = 2)

kriged <- krige(Temperature~ 1, WeatherData, grd, model=variogram_fit)

Avvertenze :

1: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.88,47.4,0]: skipping...
2: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.98,47.4,0]: skipping...
3: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.08,47.4,0]: skipping...
4: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.18,47.4,0]: skipping...
...
...

Risposte:


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Questo errore viene comunemente restituito perché sono presenti posizioni duplicate. Puoi verificarlo usando la sp::zerodistfunzione.

Per rimuovere posizioni duplicate chiamate sp::zerodistin un indice parentesi.

WeatherData <- WeatherData[-zerodist(WeatherData)[,1],] 
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