Installazione di SciPy e NumPy tramite pip

Sto cercando di creare le librerie richieste in un pacchetto che sto distribuendo. Richiede entrambe le librerie SciPy e NumPy . Durante lo sviluppo, ho installato entrambi usando

apt-get install scipy

che ha installato SciPy 0.9.0 e NumPy 1.5.1 e ha funzionato bene.

Vorrei fare lo stesso usando pip install- per poter specificare le dipendenze in un setup.py del mio pacchetto.

Il problema è, quando provo:

pip install 'numpy==1.5.1'

funziona benissimo.

Ma allora

pip install 'scipy==0.9.0'

fallisce miseramente, con

raise self.notfounderror(self.notfounderror.__doc__)

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError:

Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.

Directories to search for the libraries can be specified in the

numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting

the BLAS environment variable.

Come faccio a farlo funzionare?

Sto assumendo l'esperienza di Linux nella mia risposta; Ho scoperto che ci sono tre prerequisiti pip install scipyper procedere bene.

Vai qui: installazione di SciPY

Seguire le istruzioni per scaricare, compilare ed esportare la variabile env per BLAS e quindi LAPACK . Fai attenzione a non solo tagliare alla cieca i comandi della shell: ci saranno alcune linee che devi selezionare a seconda della tua architettura, ecc. E dovrai correggere / aggiungere le directory corrette che assume erroneamente come bene.

La terza cosa di cui potresti aver bisogno è installare yum numpy-f2py o equivalente.

Oh, sì e, infine, potresti aver bisogno di installare gcc-gfortran poiché le librerie sopra sono fonte di Fortran .

Questo ha funzionato per me su Ubuntu 14.04:

sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev gfortran
pip install scipy

hai bisogno dei pacchetti dev di libblas e liblapack se stai usando Ubuntu.

aptitude install libblas-dev liblapack-dev
pip install scipy

Poiché le istruzioni precedenti per l'installazione con yum sono state interrotte, ecco le istruzioni aggiornate per l'installazione su qualcosa come Fedora. Ho provato questo su "Amazon Linux AMI 2016.03"

sudo yum install atlas-devel lapack-devel blas-devel libgfortran
pip install scipy

Stavo lavorando a un progetto che dipendeva da intorpidimento e scipy. In un'installazione pulita di Fedora 23, usando un ambiente virtuale Python per Python 3.4 (funzionava anche con Python 2.7) e con quanto segue nel mio setup.py (nel setup()metodo)

setup_requires=[
    'numpy',
],
install_requires=[
    'numpy',
    'scipy',
],

Ho scoperto di dover eseguire quanto segue per mettermi pip install -e .al lavoro:

pip install --upgrade pip

e

sudo dnf install atlas-devel gcc-{c++,gfortran} subversion redhat-rpm-config

L' redhat-rpm-configè per uso di SciPy di redhat-hardened-cc1rispetto al normalecc1

Su Windows python 3.5 , sono riuscito a installare scipyutilizzando conda non pip :

conda install scipy

Che sistema operativo è questo? La risposta potrebbe dipendere dal sistema operativo in questione. Tuttavia, sembra che sia necessario trovare questa libreria BLAS e installarla. Non sembra essere in PIP (dovrete farlo a mano così), ma se lo installate, dovrebbe farvi procedere con l'installazione di SciPy.

nel mio caso, aggiornare pip ha fatto il trucco. Inoltre, ho installato scipy con il parametro -U (aggiorna tutti i pacchetti all'ultima versione disponibile)