Errore in plot.new (): margini della figura troppo grandi in R

Sono nuovo in R ma ho creato numerosi grafici di correlazione con set di dati più piccoli. Tuttavia, quando provo a tracciare un set di dati di grandi dimensioni (2 GB +), riesco a produrre il grafico senza problemi, ma la legenda non viene visualizzata. Qualche consiglio? o alternative?

library(gplots)
r.cor <- cor(r)
layout(matrix(c(1,1,1,1,1,1,1,1,2,2), 5, 2, byrow = TRUE))
par(oma=c(5,7,1,1))
cx <- rev(colorpanel(25,"yellow","black","blue"))
leg <- seq(min(r.cor,na.rm=T),max(r.cor,na.rm=T),length=10)
image(r.cor,main="Correlation plot Normal/Tumor data",axes=F,col=cx)
axis(1, at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]], 
    cex.axis=0.9,las=2)
axis(2,at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]],
     cex.axis=0.9,las=2)
image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)     

Errore in plot.new(): margini della figura troppo grandi

tmp <- round(leg,2)
axis(1,at=seq(0,1,length=length(leg)), labels=tmp,cex.axis=1)

Sospetto che il problema sia che la piccola regione 2 creata dalla tua layout()chiamata non è sufficientemente grande da contenere solo i margini predefiniti, per non parlare di un grafico.

Prima della linea che causa il problema, prova:

par(mar = rep(2, 4))

quindi traccia la seconda immagine

image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)

Avrai bisogno di giocare con la dimensione dei margini sulla par()chiamata che mostro per farlo bene. Potrebbe anche essere necessario aumentare le dimensioni del dispositivo effettivo su cui si sta stampando.

Un ultimo consiglio, salva le par()impostazioni predefinite prima di modificarle, quindi modifica la par()chiamata esistente in:

op <- par(oma=c(5,7,1,1))

poi alla fine della trama fare

par(op)

Questo errore può verificarsi in Rstudio semplicemente perché il riquadro "Plots" è appena troppo piccolo. Prova a ingrandire "File, grafici, pacchetti, guida, visualizzatore" e vedi se aiuta!

Se viene visualizzato questo messaggio in RStudio, fare clic sulla figura "manico di scopa" "Cancella tutti i grafici" nella scheda Grafici e provare di nuovo a plot () potrebbe funzionare.

Questo a volte accade in RStudio. Per risolverlo puoi provare a tracciare su una finestra esterna (solo Windows):

windows() ## create window to plot your file
## ... your plotting code here ...
dev.off() 

Ho ricevuto questo errore in R Studio ed è stato risolto semplicemente ingrandendo la barra laterale facendo clic e trascinando sul bordo da destra a sinistra.

Controlla se il tuo oggetto è un elenco o un vettore. Per fare ciò, digita is.list(yourobject). Se questo è vero, prova a rinominarlo x<-unlist(yourobject). Questo lo trasformerà in un vettore che puoi tracciare.

Basta ingrandire quest'area se usi RStudio.

Ho trovato questo errore oggi. Inizialmente, stavo cercando di esportarlo in un .jpegfile con larghezza e altezza ridotte.

jpeg("method1_test.jpg", width=900, height=900, res=40)

Successivamente ho aumentato la larghezza e l'altezza a:

jpeg("method1_test.jpg", width=1900, height=1900, res=40)

L'errore non c'era. :)

Puoi anche giocare con la risoluzione, se la risoluzione è alta, hai bisogno di più larghezza e altezza.

Ho riscontrato questo errore quando stavo cercando di tracciare dati ad alta dimensione. Se è quello che sta succedendo con te, prova il ridimensionamento multidimensionale: http://www.statmethods.net/advstats/mds.html

Ho lottato con questo errore per settimane (usando RStudio). Ho provato a spostare la finestra della trama sempre più grande, ma non è stato sempre di aiuto. Quando ho spostato (trascinato) l'applicazione sul mio monitor più grande, il problema è scomparso! Ero sbalordito ... così tante ore sprecate ... sapevo che il mio codice era corretto ...

Il canvas di RStudio Plots limita la larghezza e l'altezza del grafico. Tuttavia, se si crea la trama da un blocco di codice Rmarkdown , funziona senza limitazioni del campo della tela perché l'area di stampa è impostata in base alle dimensioni del foglio.

Per esempio:

    ```{r}
#inside of code chunk in Rmarkdown
        grid <- par(mfrow=c(4, 5))
        plot(faithful, main="Faithful eruptions")
        plot(large.islands, main="Islands", ylab="Area")
        ...
        par(grid)
    ```

Oggi ho riscontrato lo stesso errore. Ho provato il pulsante "Cancella tutti i grafici", ma mi dava lo stesso errore. Quindi questo trucco ha funzionato per me, prova ad aumentare l'area della trama trascinando. Ti aiuterà di sicuro.

Ho appena usato Cancella tutti i grafici, quindi ho dato di nuovo il comando della trama ed è stato utile

Se il margine è basso, è sempre meglio iniziare con un nuovo dispositivo di stampa:

dev.new()
# plot()
# save your plot
dev.off()

Non riceverai mai un errore di margine, a meno che non tracci qualcosa di grande che non può essere sistemato.