Ho usato Knitr tramite R-Studio e penso che sia abbastanza pulito. Ho un piccolo problema però. Quando sorgente un file in un R-Chunk, l'output di knitr include commenti esterni come segue:
+ FALSE Loading required package: ggplot2
+ FALSE Loading required package: gridExtra
+ FALSE Loading required package: grid
+ FALSE Loading required package: VGAM
+ FALSE Loading required package: splines
+ FALSE Loading required package: stats4
+ FALSE Attaching package: 'VGAM'
+ FALSE The following object(s) are masked from 'package:stats4':
Ho provato a impostare le opzioni R-chunk in vari modi, ma ancora non sembra evitare il problema:
```{r echo=FALSE, cache=FALSE, results=FALSE, warning=FALSE, comment=FALSE, warning=FALSE}
source("C:/Rscripts/source.R");
```
C'è un modo per commentare questi messaggi?
options(warn=-1)
e tornare aoptions(warn=0)
alla fine del Rmd. Si occupa di tutti i messaggi del pacchetto di avvio. Tieni presente che disattiveresti gli avvisi, ma solo durante il rendering di Rmd.