Trova l'indice intero delle righe con NaN nel dataframe pandas


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Ho un DataFrame panda come questo:

                    a         b
2011-01-01 00:00:00 1.883381  -0.416629
2011-01-01 01:00:00 0.149948  -1.782170
2011-01-01 02:00:00 -0.407604 0.314168
2011-01-01 03:00:00 1.452354  NaN
2011-01-01 04:00:00 -1.224869 -0.947457
2011-01-01 05:00:00 0.498326  0.070416
2011-01-01 06:00:00 0.401665  NaN
2011-01-01 07:00:00 -0.019766 0.533641
2011-01-01 08:00:00 -1.101303 -1.408561
2011-01-01 09:00:00 1.671795  -0.764629

Esiste un modo efficiente per trovare l'indice "intero" di righe con NaN? In questo caso l'output desiderato dovrebbe essere [3, 6].


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Se vuoi solo selezionare le righe con nan, puoi farlodf[np.isnan(df['b'])]
lazy1

4
In seguito da @ lazy1 - invece di utilizzare numpy'il isnanè anche possibile utilizzaredf['b'].isnull()
jmetz

Risposte:


46

Per DataFrame df:

import numpy as np
index = df['b'].index[df['b'].apply(np.isnan)]

ti restituirà MultiIndexciò che puoi utilizzare per indicizzare df, ad esempio:

df['a'].ix[index[0]]
>>> 1.452354

Per l'indice intero:

df_index = df.index.values.tolist()
[df_index.index(i) for i in index]
>>> [3, 6]

1
Per quanto intuitivo come ixsuoni, per alcuni motivi sembra che sia stato deprecato a favore diiloc
cardamomo

145

Ecco una soluzione più semplice:

inds = pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]

In [9]: df
Out[9]: 
          0         1
0  0.450319  0.062595
1 -0.673058  0.156073
2 -0.871179 -0.118575
3  0.594188       NaN
4 -1.017903 -0.484744
5  0.860375  0.239265
6 -0.640070       NaN
7 -0.535802  1.632932
8  0.876523 -0.153634
9 -0.686914  0.131185

In [10]: pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]
Out[10]: array([3, 6])

29
Ho finito per usare questo:np.where(df['b'].notnull())[0]

grazie, .nonzero()[0]è meglio di [i for i, k in enumerate(mask) if k].)
Winand

2
Probabilmente potresti semplificarlo ulteriormente:r, _ = np.where(df.isna())
cs95

2
aggiungi .to_numpy()per convertire prima in array numpy -pd.isnull(df).any(1).to_numpy().nonzero()
7bStan

13

Una soluzione in linea. Tuttavia funziona solo per una colonna.

df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index

Questo è quello che stavo cercando. L'ho inserito in un elenco avvolgendolo in un modo list(...)simile:list(df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index)
Daniel Butler il

10

E per ogni evenienza, se vuoi trovare invece le coordinate di 'nan' per tutte le colonne (supponendo che siano tutte numeriche), ecco qui:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

df
   0  1  2    3    4  5
0  0  1  3  4.0  NaN  2
1  3  5  6  NaN  3.0  3

np.where(np.asanyarray(np.isnan(df)))
(array([0, 1]), array([4, 3]))

9

Non so se è troppo tardi ma puoi usare np.where per trovare gli indici dei non valori in quanto tali:

indices = list(np.where(df['b'].isna()[0]))

4

Ecco i test per alcuni metodi:

%timeit np.where(np.isnan(df['b']))[0]
%timeit pd.isnull(df['b']).nonzero()[0]
%timeit np.where(df['b'].isna())[0]
%timeit df.loc[pd.isna(df['b']), :].index

E i tempi corrispondenti:

333 µs ± 9.95 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
280 µs ± 220 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
313 µs ± 128 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
6.84 ms ± 1.59 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

Sembrerebbe che pd.isnull(df['DRGWeight']).nonzero()[0]vinca la giornata in termini di tempistica, ma che uno dei primi tre metodi abbia prestazioni comparabili.


3

nel caso tu abbia un indice datetime e desideri avere i valori:

df.loc[pd.isnull(df).any(1), :].index.values

2

Un'altra semplice soluzione è list(np.where(df['b'].isnull())[0])


1

Ecco un'altra versione più semplice:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

inds = np.asarray(df.isnull()).nonzero()

(array([0, 1], dtype=int64), array([4, 3], dtype=int64))

1

Stavo cercando tutti gli indici di righe con valori NaN.
La mia soluzione di lavoro:

def get_nan_indexes(data_frame):
    indexes = []
    print(data_frame)
    for column in data_frame:
        index = data_frame[column].index[data_frame[column].apply(np.isnan)]
        if len(index):
            indexes.append(index[0])
    df_index = data_frame.index.values.tolist()
    return [df_index.index(i) for i in set(indexes)]

0

Lascia che il dataframe sia denominato df e la colonna di interesse (cioè la colonna in cui stiamo cercando di trovare i null ) è "b" . Quindi il seguente frammento fornisce l'indice desiderato di null nel dataframe:

   for i in range(df.shape[0]):
       if df['b'].isnull().iloc[i]:
           print(i)
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