Nota, trova difflib.SequenceMatcher
solo la sottosequenza di corrispondenza contigua più lunga, spesso non è ciò che desideri, ad esempio:
>>> a1 = "Apple"
>>> a2 = "Appel"
>>> a1 *= 50
>>> a2 *= 50
>>> SequenceMatcher(None, a1, a2).ratio()
0.012 # very low
>>> SequenceMatcher(None, a1, a2).get_matching_blocks()
[Match(a=0, b=0, size=3), Match(a=250, b=250, size=0)] # only the first block is recorded
Trovare la somiglianza tra due stringhe è strettamente correlato al concetto di allineamento della sequenza a coppie in bioinformatica. Ci sono molte librerie dedicate per questo incluso biopython . Questo esempio implementa l' algoritmo Needleman Wunsch :
>>> from Bio.Align import PairwiseAligner
>>> aligner = PairwiseAligner()
>>> aligner.score(a1, a2)
200.0
>>> aligner.algorithm
'Needleman-Wunsch'
L'uso di biopython o di un altro pacchetto bioinformatico è più flessibile di qualsiasi parte della libreria standard di Python poiché sono disponibili molti schemi e algoritmi di punteggio diversi. Inoltre, puoi effettivamente ottenere le sequenze corrispondenti per visualizzare ciò che sta accadendo:
>>> alignment = next(aligner.align(a1, a2))
>>> alignment.score
200.0
>>> print(alignment)
Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-
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App-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-el