Rilascia le righe con tutti zeri nel frame di dati dei panda


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Posso utilizzare la pandas dropna()funzionalità per rimuovere le righe con alcune o tutte le colonne impostate come NA. Esiste una funzione equivalente per eliminare righe con tutte le colonne aventi valore 0?

P   kt  b   tt  mky depth
1   0   0   0   0   0
2   0   0   0   0   0
3   0   0   0   0   0
4   0   0   0   0   0
5   1.1 3   4.5 2.3 9.0

In questo esempio, vorremmo eliminare le prime 4 righe dal frame di dati.

Grazie!


Giusto per chiarire, queste sono due domande. Uno, eliminare le colonne con tutti i valori come 0. Ma anche, per una funzione equivalente a dropna () che eliminerebbe le colonne con qualsiasi valore come 0.
— alchemy

Risposte:


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Si scopre che questo può essere ben espresso in modo vettorializzato:

> df = pd.DataFrame({'a':[0,0,1,1], 'b':[0,1,0,1]})
> df = df[(df.T != 0).any()]
> df
   a  b
1  0  1
2  1  0
3  1  1

6
Bello, ma penso che tu possa evitare la negazione condf = df[(df.T != 0).any()]
— Akavall

1
@ Akavall Molto meglio!
— U2EF1

1
Solo una nota: OP voleva eliminare rows with all columns having value 0, ma si può dedurre il allmetodo.
— paulochf

1
Tutte queste risposte spiegano come possiamo rilasciare righe con tutti zeri, tuttavia, volevo eliminare righe, con 0 nella prima colonna. Con l'aiuto di tutte le discussioni e risposte in questo post, l'ho fatto facendo df.loc [df.iloc [:, 0]! = 0]. Volevo solo condividere perché questo problema è legato a questa domanda !!
— hemanta

2
La trasposizione non è necessaria, any () può prendere un asse come parametro. Quindi funziona: df = df [df.any (axis = 1)]
— Rahul Jha

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One-liner. Nessuna trasposizione necessaria:

df.loc[~(df==0).all(axis=1)]

E per chi ama la simmetria, funziona anche ...

df.loc[(df!=0).any(axis=1)]

1
Per brevità (e, a mio parere, chiarezza di intenti) combinano questo e commentare di Akavall: df.loc[(df != 0).any(1)]. Lavoro di squadra!
— Dan Allan

1
+1, 30% più veloce che trasporre - da 491 a 614 microsec, e mi piace axis=1per essere esplicito; più pitonico secondo me
— gt6989b

Si dovrebbe fare qualche accenno alla differenza tra l'utilizzo di .all e .any poiché la domanda originale menzionava l'equivalenza di dropna. Se vuoi eliminare tutte le righe con qualsiasi colonna contenente uno zero, devi invertire .all e .any nella risposta precedente. Mi ci è voluto un po 'per rendermene conto mentre stavo cercando quella funzionalità.
— Zak Keirn

Questo non funziona per me, ma mi restituisce esattamente lo stessodf
— Robvh

Esiste una versione "inplace" di questo? Vedo che per rilasciare righe in un df come richiesto dall'OP, questo dovrebbe essere df = df.loc[(df!=0).all(axis=1)]e df = df.loc[(df!=0).any(axis=1)]per eliminare righe con zeri come sarebbe l'equivalente effettivo di dropna ().
— alchimia

19

Cerco questa domanda circa una volta al mese e devo sempre trovare la risposta migliore dai commenti:

df.loc[(df!=0).any(1)]

Grazie Dan Allan!


2
Non è necessario scavare. @ 8one6 ha incluso questo nella sua risposta nel 2014 stesso, la parte che dice: "E per chi ama la simmetria ...".
— Rahul Murmuria

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Sostituisci gli zeri con nane quindi rilascia le righe con tutte le voci come nan. Dopodiché sostituisci nancon zeri.

import numpy as np
df = df.replace(0, np.nan)
df = df.dropna(how='all', axis=0)
df = df.replace(np.nan, 0)

3
Questo fallirà se hai NaN-s preesistenti nei dati.
— OmerB


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Un paio di soluzioni che ho trovato utili durante la ricerca, soprattutto per set di dati più grandi:

df[(df.sum(axis=1) != 0)]       # 30% faster 
df[df.values.sum(axis=1) != 0]  # 3X faster 

Continuando con l'esempio di @ U2EF1:

In [88]: df = pd.DataFrame({'a':[0,0,1,1], 'b':[0,1,0,1]})

In [91]: %timeit df[(df.T != 0).any()]
1000 loops, best of 3: 686 µs per loop

In [92]: df[(df.sum(axis=1) != 0)]
Out[92]: 
   a  b
1  0  1
2  1  0
3  1  1

In [95]: %timeit df[(df.sum(axis=1) != 0)]
1000 loops, best of 3: 495 µs per loop

In [96]: %timeit df[df.values.sum(axis=1) != 0]
1000 loops, best of 3: 217 µs per loop

Su un set di dati più ampio:

In [119]: bdf = pd.DataFrame(np.random.randint(0,2,size=(10000,4)))

In [120]: %timeit bdf[(bdf.T != 0).any()]
1000 loops, best of 3: 1.63 ms per loop

In [121]: %timeit bdf[(bdf.sum(axis=1) != 0)]
1000 loops, best of 3: 1.09 ms per loop

In [122]: %timeit bdf[bdf.values.sum(axis=1) != 0]
1000 loops, best of 3: 517 µs per loop

Succedono cose brutte se la tua riga contiene -1 e 1?
— Rhys Ulerich

Ovviamente, la somma non funzionerebbe se avessi righe uguali che sommano fino a 0. Ecco una soluzione rapida per quella che è solo leggermente più lenta: df[~(df.values.prod(axis=1) == 0) | ~(df.values.sum(axis=1)==0)]
— clocker

La funzione prod () non risolve nulla. Se hai uno 0 nella riga che restituirà 0. Se devi gestire una riga come questa: [-1, -0.5, 0, 0.5, 1], nessuna delle tue soluzioni funzionerà.
— Rahul Murmuria

Ecco una versione corretta che funziona 3 volte più velocemente della risposta accettata:bdf[np.square(bdf.values).sum(axis=1) != 0]
— Rahul Murmuria

5
import pandas as pd

df = pd.DataFrame({'a' : [0,0,1], 'b' : [0,0,-1]})

temp = df.abs().sum(axis=1) == 0      
df = df.drop(temp)

Risultato:

>>> df
   a  b
2  1 -1

Non ha funzionato per me con un dataframe a 1 colonna. GotValueError: labels [True ... ] not contained in matrix
— The Unfun Cat

invece di df = df.drop(temp)usaredf = df.drop(df[temp].index)
— Douglas Ferreira

3

È possibile utilizzare una lambdafunzione rapida per verificare se tutti i valori in una determinata riga lo sono 0. Quindi puoi utilizzare il risultato dell'applicazione lambdacome un modo per scegliere solo le righe che corrispondono o non corrispondono a quella condizione:

import pandas as pd
import numpy as np

np.random.seed(0)

df = pd.DataFrame(np.random.randn(5,3), 
                  index=['one', 'two', 'three', 'four', 'five'],
                  columns=list('abc'))

df.loc[['one', 'three']] = 0

print df
print df.loc[~df.apply(lambda row: (row==0).all(), axis=1)]

Rendimenti:

              a         b         c
one    0.000000  0.000000  0.000000
two    2.240893  1.867558 -0.977278
three  0.000000  0.000000  0.000000
four   0.410599  0.144044  1.454274
five   0.761038  0.121675  0.443863

[5 rows x 3 columns]
             a         b         c
two   2.240893  1.867558 -0.977278
four  0.410599  0.144044  1.454274
five  0.761038  0.121675  0.443863

[3 rows x 3 columns]

1

Un'altra alternativa:

# Is there anything in this row non-zero?
# df != 0 --> which entries are non-zero? T/F
# (df != 0).any(axis=1) --> are there 'any' entries non-zero row-wise? T/F of rows that return true to this statement.
# df.loc[all_zero_mask,:] --> mask your rows to only show the rows which contained a non-zero entry.
# df.shape to confirm a subset.

all_zero_mask=(df != 0).any(axis=1) # Is there anything in this row non-zero?
df.loc[all_zero_mask,:].shape

0

Per me questo codice: df.loc[(df!=0).any(axis=0)] non ha funzionato. Ha restituito il set di dati esatto.

Invece, ho usato df.loc[:, (df!=0).any(axis=0)]e rilasciato tutte le colonne con valori 0 nel set di dati

La funzione ha .all()eliminato tutte le colonne in cui sono presenti valori zero nel mio set di dati.


-1
df = df [~( df [ ['kt'  'b'   'tt'  'mky' 'depth', ] ] == 0).all(axis=1) ]

Prova questo comando è perfettamente funzionante.


-2

Per eliminare tutte le colonne con valori 0 in qualsiasi riga:

new_df = df[df.loc[:]!=0].dropna()
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