"RuntimeError: assicurarsi che gli eseguibili Graphviz siano sul percorso del sistema" dopo l'installazione di Graphviz 2.38

Ho scaricato la Graphviz 2.38versione MSI e installato nella cartella C:\Python34, quindi eseguo pip install Graphviz, tutto è andato bene. Nel percorso del sistema ho aggiunto C:\Python34\bin. Quando ho provato a eseguire uno script di test, in linea filename=dot.render(filename='test'), ho ricevuto un messaggio

 RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

Ho provato a inserire "C:\Python34\bin\dot.exe"il percorso del sistema, ma non ha funzionato e ho persino creato una nuova variabile d'ambiente "GRAPHVIZ_DOT"con valore "C:\Python34\bin\dot.exe", ancora non funzionante. Ho provato a disinstallare Graphviz e pip uninstall graphviz, quindi, reinstallarlo e installarlo nuovamente, ma non funziona nulla.

L'intero messaggio di traceback è:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 220, in render
    proc = subprocess.Popen(cmd, startupinfo=STARTUPINFO)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 859, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 1112, in _execute_child
    startupinfo)
FileNotFoundError: [WinError 2] The system cannot find the file specified

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\Documents\Kissmetrics\curves and lines\eventNodes.py", line 56, in <module>
    filename=dot.render(filename='test')
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 225, in render
    'are on your systems\' path' % cmd)
RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

Qualcuno ha qualche esperienza con esso?

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

In Windows basta aggiungere queste 2 righe all'inizio, dove 'D: / Programmi (x86) /Graphviz2.38/bin/' è sostituito dall'indirizzo di dove si trova il tuo file bin.

Questo risolve il problema.

Dovresti installare il pacchetto graphviz nel tuo sistema (non solo il pacchetto python). Su Ubuntu dovresti provare:

sudo apt-get install graphviz

Questo ha risolto il problema per me su MAC :

  brew install graphviz

Per Windows:

1. Installa il pacchetto Windows da: https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html
2. Installa Python graphviz pacchetto
3. Inserisci C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin al percorso utente
4. Aggiungi C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exeal percorso di sistema

Questo ha funzionato per me!

Prova a usare:

conda install python-graphviz

L'eseguibile graphviz si trova su un percorso diverso dalla directory conda, se si utilizza pip install graphviz.

OSX Sierra, Python 2.7, Graphviz 2.38

L'utilizzo pip install graphvize conda install graphvizENTRAMBE risolve il problema.

pipottiene solo un problema di percorso uguale al tuo e condaottiene solo un errore di importazione.

Aggiungi qui sotto il PERCORSO Variabile ambientale (sistema) su Windows

C: \ Programmi (x86) \ Graphviz2.38 \ bin

lì puoi trovare file .exe

Se non funziona

Trova la cartella Graphviz2.38 / bin nel tuo Program Files non in python lib

Quindi, aggiungi al tuo PERCORSO

È importante trovare una cartella in cui sono presenti file .exe

Passaggio 1: installare il file binario Graphviz

Finestre:

1. Scarica Graphviz da http://www.graphviz.org/download/
2. Aggiungi sotto alla variabile d'ambiente PATH (menziona la versione di graphviz installata):
   • C: \ Programmi (x86) \ Graphviz2.38 \ bin
   • C: \ Programmi (x86) \ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe
3. Chiudere qualsiasi taccuino Juypter aperto e il prompt dei comandi
4. Riavvia il prompt di Jupyter / cmd e verifica

Linux:

1. sudo apt-get update
2. sudo apt-get install graphviz
3. o compilalo manualmente da http://www.graphviz.org/download/

Passaggio 2: installare il modulo graphviz per Python

pip:

• pip installa graphviz

Conda:

• conda install graphviz

Prova conda install graphviz. Ho avuto lo stesso problema, l'ho risolto con il comando citato in MacOS.

Utilizzando conda install graphvize conda install python-graphvizper installare GraphViz su Windows10 il percorso necessario era C: / ProgramData / Anaconda3 / Library / bin / graphviz / per me. Cioè aggiungendo

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/ProgramData/Anaconda3/Library/bin/graphviz/'

risolto il problema per me.

conda install python-graphviz

Per Windows, installa Python Graphviz che includerà gli eseguibili nel percorso.

Su Ubuntu Linux questo mi ha risolto:

pip install graphviz
sudo apt-get install graphviz

Puoi anche provare conda install -c conda-forge graphvizinvece di pip se usi Anaconda.

Quando ho risolto questo problema da solo, ho usato questo tutorial di GitHub , che ha analizzato la causa di questo problema. Se leggiamo tra le righe, dice che ha bisogno del sistema e del grafico python vale a dire. Inoltre conda install, dovremmo eseguire:

conda install -c conda-forge python-graphviz

Quindi riavviare il kernel; Esso funziona magicamente.

1) Graphviz: scarica decomprimere in un determinato punto del sistema (pip non funziona in Windows) e includere la cartella bin nel percorso ('imposta variabili di ambiente in Windows' OPPURE) impostata manualmente in ciascun programma

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/GraphViz/bin'

2) Quindi metti il ​​modello in trama

clf = xgb.train(params, d_train, 1000, evals=evallist, early_stopping_rounds=10)
xgb.plot_tree(clf)
plt.rcParams['figure.figsize'] = [50, 10]
plt.show()

Dopo aver installato il pacchetto ( collegamento se non lo hai fatto), aggiungi il percorso a dot.exe come nuova variabile di sistema.

Il percorso predefinito è:

C: \ Programmi (x86) \ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe

Ho avuto lo stesso problema su Linux con Jupyter.

Per risolverlo ho aggiunto la libreria di punti a python sys.path

Primo: controlla se dotè installato,

Quindi:
trova il suo percorso whereis dot-> / local / notebook / miniconda2 / envs / ik2 / bin / dot

Finalmente nello script python: sys.path.append ("/ local / notebook / miniconda2 / envs / ik2 / bin / dot")

Innanzitutto, dovresti usare pip install, quindi scaricare un altro pacchetto in http://www.graphviz.org/Download_windows.php e aggiungere il percorso di installazione nel percorso ambientale, quindi funziona.

Ho avuto lo stesso messaggio di errore su Mac OS (El Capitan), utilizzando l'IDE PyCharm. Avevo installato Graphviz usando brew, come raccomandato nella risposta di RZK, e installato il pacchetto python graphviz usando PyCharm (potevo verificare che Graphviz fosse installato correttamente provando dot -Vin un terminale e ottenendo:dot - graphviz version 2.40.1 (20161225.0304) . Tuttavia stavo ancora ricevendo il messaggio di errore quando provavo a chiamare Graphviz da PyCharm.

Ho dovuto aggiungere il percorso / usr / local / bin nelle opzioni di PyCharm, come raccomandato nella risposta a questa domanda per risolvere il problema.

Questo sta mostrando alcuni problemi relativi al percorso:

pip install graphviz

Quindi questo ha funzionato per me:

sudo apt-get install graphviz

Sono su macOS Catalina 10.15.3 e ho avuto un errore simile: ExecutableNotFound: failed to execute ['dot', '-Tsvg'], make sure the Graphviz executables are on your systems' PATH

Risolto con:

pip3 install graphviz E brew install graphviz

Nota pip3 installche restituirà solo il messaggio di successo, Successfully installed graphviz-0.13.2quindi dobbiamo ancora eseguire brew installper ottenere graphviz 2.42.3 (a partire dal 10 marzo 2020, alle 18:00).

Per utenti Linux che non hanno accesso come root e quindi non possono usarli sudo comando come suggerito in altre risposte ...

Innanzitutto, attiva il tuo ambiente virtuale conda (se vuoi usarne uno):

source activate virtual-env-name

Quindi installa graphviz, anche se l'hai già fatto usando pip:

conda install graphviz

quindi copia il risultato del seguente comando:

whereis dot

Nel mio caso, il suo output è:

/home/nader/anaconda2/bin/dot

e aggiungilo alla tua variabile PATH. Basta eseguire il comando di seguito

nano ~/.bashrc

e aggiungi queste righe alla fine del file aperto:

PATH="/home/username/anaconda2/bin/dot:$PATH"
export PATH

ora premi Ctrl+ Oe poi Ctrl+ Xper salvare ed uscire.

Ormai il problema dovrebbe essere risolto.

Utenti Pycharm, si prega di notare: Pycharm non vede sempre la variabile PATH come il proprio terminale. Questa soluzione non funziona per Pycharm e forse per altri IDE. Ma puoi risolverlo aggiungendo questa riga di codice:

os.environ["PATH"] += os.pathsep + '/home/nader/anaconda2/bin'

al tuo programma Python. Non dimenticare di

import os

primo :)

Modifica: se non si desidera utilizzare conda, è comunque possibile installare graphviz da qui senza alcuna autorizzazione di root e aggiungere la cartella bin alla variabile PATH. Non l'ho provato.

1.installare il pacchetto windows da: https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html e scaricare il file msi

Aggiungi in variabili ambientali 2. Aggiungi C: \ Programmi (x86) \ Graphviz2.38 \ bin al percorso dell'utente

3. Aggiungi C: \ Programmi (x86) \ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe al percorso di sistema

4. Riavvia il tuo notebook Python.

Funzionerà.

Aggiungi graphviz al percorso di sistema

1. Windows: modifica le variabili di ambiente di sistema.
2. Scegli Variabili d'ambiente.
3. Seleziona percorso - Nuovo
4. Aggiungi il percorso di graphviz

Es: C: \ Users \ AppData \ Local \ Continuum \ anaconda3 \ Library \ bin \ graphviz

Sistema operativo Mojave 10.14., Python 3.6

L'utilizzo ha pip install graphvizavuto un buon feedback nel terminale, ma ha portato a questo errore quando ho provato a creare un grafico in un notebook Jupyter. Ho quindi eseguito brew install graphviz, che ha dato un errore nel terminale. Poi ho corso conda install graphvize il grafico ha funzionato.

Dal commento di @ Leighton: pip ha solo un problema di percorso uguale al tuo e conda ha solo un errore di importazione.

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + "/Macintosh HD⁩/anaconda3⁩/lib⁩/⁨python3.7⁩/site-packages⁩/sphinx⁩/templates⁩/graphviz"

Questo ha risolto il problema PATH su MAC per me!

Se non stai usando Conda ma Vanilla Python, funziona 'brew install graphviz'.

#Write this on anaconda prompt in admin mode
conda install -c anaconda graphviz
conda install -c conda-forge python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/broken python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf201901 python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf202003 python-graphviz

#check dot -v in window's cmd prompt
C:\WINDOWS\system32>dot -V
dot - graphviz version 2.38.0 (20140413.2041)
(this means graphviz installed successfully)

#Add path to sys and user eve variables
PATH
C:\Anaconda3\pkgs\graphviz-2.38-hfd603c8_2\Library\bin
(search bin folder of graphviz and then copy n paste path in env variables)

#Re-run all cmds in jyupter notebook
#if error occurs (less chances)
#then 
#Restart anaconda and again run all cmds in jyupter notebook
eg.
import graphviz as gp
with open("tree.dot") as f:
    dot_read=f.read()
display(gp.Source(dot_read))

prova a digitare il seguente codice nel prompt di anaconda uno alla volta.

questo ha funzionato per me.

Fonte: https://anaconda.org/conda-forge/python-graphviz

conda install -c conda-forge python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/broken python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf201901 python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf202003 python-graphviz 

provare a farlo con Python import sys! conda install --yes --prefix {sys.prefix} graphviz import graphviz