File di esportazione di Anaconda

Come posso creare un file di ambiente anaconda che potrebbe essere utilizzato su altri computer?

Ho esportato il mio ambiente anaconda python in YML usando conda env export > environment.yml. L'esportato environment.ymlcontiene questa riga prefix: /home/superdev/miniconda3/envs/juicyenvche mappa alla posizione della mia anaconda che sarà diversa sui pc degli altri.

Non riesco a trovare nulla nelle condaspecifiche che ti consentano di esportare un file di ambiente senza la prefix: ...riga. Tuttavia, come ha sottolineato Alex nei commenti, a conda non sembra interessare la riga del prefisso durante la creazione di un ambiente da file.

Con questo in mente, se vuoi che l'altro utente non sia a conoscenza del tuo percorso di installazione predefinito, puoi rimuovere la riga del prefisso con grepprima di scrivere in environment.yml.

conda env export | grep -v "^prefix: " > environment.yml

In ogni caso, l'altro utente esegue quindi:

conda env create -f environment.yml

e l'ambiente verrà installato nel percorso dell'ambiente conda predefinito.

Se vuoi specificare un percorso di installazione diverso da quello predefinito per il tuo sistema (non correlato a 'prefix' in environment.yml), usa semplicemente il -pflag seguito dal percorso richiesto.

conda env create -f environment.yml -p /home/user/anaconda3/envs/env_name

Si noti che Conda consiglia di creare environment.ymlmanualmente, il che è particolarmente importante se si desidera condividere il proprio ambiente tra piattaforme (Windows / Linux / Mac). In questo caso, puoi semplicemente tralasciare la prefixlinea.

Il modo più semplice per salvare i pacchetti da un ambiente da installare in un altro computer è:

$ conda list -e > req.txt

quindi puoi installare l'ambiente usando

$ conda create -n new environment --file req.txt

se si utilizza pip, utilizzare i seguenti comandi: fare riferimento a https://pip.pypa.io/en/stable/reference/pip_freeze/

$ env1/bin/pip freeze > requirements.txt
$ env2/bin/pip install -r requirements.txt

• Linux

  conda env export --no-builds | grep -v "prefisso"> environment.yml

• finestre

  conda env export --no-builds | findstr -v "prefisso"> environment.yml

Motivazione: per impostazione predefinita, conda env exportinclude le informazioni sulla build:

$ conda env export
...
dependencies:
  - backcall=0.1.0=py37_0
  - blas=1.0=mkl
  - boto=2.49.0=py_0
...

Puoi invece esportare il tuo ambiente senza informazioni sulla build:

$ conda env export --no-builds
...
dependencies:
  - backcall=0.1.0
  - blas=1.0
  - boto=2.49.0
...

Ciò svincola l'ambiente dalla versione e dal sistema operativo di Python.

Trovo che esportare i pacchetti solo in formato stringa sia più portabile che esportare l'intero condaambiente. Come già suggerito dalla risposta precedente:

$ conda list -e > requirements.txt

Tuttavia, questo requirements.txtcontiene numeri di build che non sono portabili tra i sistemi operativi, ad esempio tra Mace Ubuntu. In conda env exportabbiamo l'opzione --no-buildsma non con conda list -e, quindi possiamo rimuovere il numero di build emettendo il seguente comando:

$ sed -i -E "s/^(.*\=.*)(\=.*)/\1/" requirements.txt 

E ricrea l'ambiente su un altro computer:

conda create -n recreated_env --file requirements.txt 

1. Per prima cosa attiva il tuo ambiente conda (quello che vuoi esportare / eseguire il backup)

conda activate myEnv

2. Esporta tutti i pacchetti in un file (myEnvBkp.txt)

conda list --explicit > myEnvBkp.txt

3. Ripristina / importa l'ambiente:

conda create --name myEnvRestored --file myEnvBkp.txt