Come fare un diagramma a dispersione con cerchi vuoti in Python?

In Python, con Matplotlib, come si può tracciare un diagramma a dispersione con cerchi vuoti ? L'obiettivo è disegnare dei cerchi vuoti attorno ad alcuni dei dischi colorati già tracciati da scatter(), in modo da evidenziarli, idealmente senza dover ridisegnare i cerchi colorati.

Ho provato facecolors=None, inutilmente.

Dalla documentazione per scatter:

Optional kwargs control the Collection properties; in particular:

    edgecolors:
        The string ‘none’ to plot faces with no outlines
    facecolors:
        The string ‘none’ to plot unfilled outlines

Prova quanto segue:

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 

x = np.random.randn(60) 
y = np.random.randn(60)

plt.scatter(x, y, s=80, facecolors='none', edgecolors='r')
plt.show()

Nota: per altri tipi di grafici, vedere questo post sull'uso di markeredgecolore markerfacecolor.

Funzionerebbero?

plt.scatter(np.random.randn(100), np.random.randn(100), facecolors='none')

o usando plot ()

plt.plot(np.random.randn(100), np.random.randn(100), 'o', mfc='none')

Ecco un altro modo: questo aggiunge un cerchio agli assi, alla trama o all'immagine attuali o altro:

from matplotlib.patches import Circle  # $matplotlib/patches.py

def circle( xy, radius, color="lightsteelblue", facecolor="none", alpha=1, ax=None ):
    """ add a circle to ax= or current axes
    """
        # from .../pylab_examples/ellipse_demo.py
    e = Circle( xy=xy, radius=radius )
    if ax is None:
        ax = pl.gca()  # ax = subplot( 1,1,1 )
    ax.add_artist(e)
    e.set_clip_box(ax.bbox)
    e.set_edgecolor( color )
    e.set_facecolor( facecolor )  # "none" not None
    e.set_alpha( alpha )

(I cerchi nella foto vengono schiacciati a ellissi perché imshow aspect="auto").

In matplotlib 2.0 è presente un parametro chiamato fillstyle che consente un migliore controllo sulla modalità di riempimento dei marker. Nel mio caso l'ho usato con errorbars ma funziona per i marcatori in generale http://matplotlib.org/api/_as_gen/matplotlib.axes.Axes.errorbar.html

fillstyleaccetta i seguenti valori: ['pieno' | 'sinistra' | "giusto" | 'fondo' | 'top' | 'nessuna']

Ci sono due cose importanti da tenere a mente quando si utilizza fillstyle,

1) Se mfc è impostato su qualsiasi tipo di valore, avrà priorità, quindi, se hai impostato fillstyle su 'none', non avrebbe effetto. Quindi evita di usare mfc in congiunzione con fillstyle

2) Potresti voler controllare la larghezza del bordo del marker (usando markeredgewidtho mew) perché se il marker è relativamente piccolo e la larghezza del bordo è spessa, i marker sembreranno riempiti anche se non lo sono.

Di seguito è riportato un esempio usando errorbars:

myplot.errorbar(x=myXval, y=myYval, yerr=myYerrVal, fmt='o', fillstyle='none', ecolor='blue',  mec='blue')

Basati sull'esempio di Gary Kerr e come proposto qui si possono creare cerchi vuoti relativi a valori specificati con il seguente codice:

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 
from matplotlib.markers import MarkerStyle

x = np.random.randn(60) 
y = np.random.randn(60)
z = np.random.randn(60)

g=plt.scatter(x, y, s=80, c=z)
g.set_facecolor('none')
plt.colorbar()
plt.show()

Quindi presumo che tu voglia evidenziare alcuni punti che soddisfano determinati criteri. Puoi usare il comando Prelude per fare un secondo diagramma a dispersione dei punti evidenziati con un cerchio vuoto e una prima chiamata per tracciare tutti i punti. Assicurarsi che il parametro s sia sufficientemente piccolo per consentire ai cerchi vuoti più grandi di racchiudere quelli pieni più piccoli.

L'altra opzione è quella di non usare scatter e disegnare i patch singolarmente usando il comando circle / ellipse. Questi sono in matplotlib.patches, ecco alcuni esempi di codice su come disegnare cerchi rettangoli ecc.