matplotlib / seaborn: prima e ultima riga tagliate a metà del grafico della mappa termica

Quando si tracciano mappe di calore con seaborn (e matrici di correlazione con matplotlib) la prima e l'ultima riga vengono dimezzate. Ciò accade anche quando eseguo questo esempio di codice minimo che ho trovato online.

import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

data = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/resbaz/r-novice-gapminder-files/master/data/gapminder-FiveYearData.csv')
plt.figure(figsize=(10,5))
sns.heatmap(data.corr())
plt.show()

Le etichette sull'asse y sono nel punto corretto, ma le righe non sono completamente lì.

Pochi giorni fa, funziona come previsto. Da allora ho installato texlive-xetex, quindi l'ho rimosso di nuovo ma non ha risolto il mio problema.

Qualche idea su cosa potrei perdere?

Sfortunatamente matplotlib 3.1.1 ha rotto le mappe di calore di Seaborn ; e in generale assi invertiti con tacche fisse.
Questo problema è stato risolto nell'attuale versione di sviluppo; puoi quindi

• ripristinare matplotlib 3.1.0
• utilizzare matplotlib 3.1.2 o versioni successive
• imposta manualmente i limiti della mappa di calore ( ax.set_ylim(bottom, top) # set the ylim to bottom, top)

È un bug nella regressione matplotlib tra 3.1.0 e 3.1.1 Puoi correggere questo problema:

import seaborn as sns
df_corr = someDataFrame.corr()
ax = sns.heatmap(df_corr, annot=True) #notation: "annot" not "annote"
bottom, top = ax.get_ylim()
ax.set_ylim(bottom + 0.5, top - 0.5)

Risolto il problema con l'utilizzo di quanto sopra e l'impostazione manuale dei limiti della mappa termica.

Primo

ax = sns.heatmap(...

controllato gli assi correnti con

ax.get_ylim()
(5.5, 0.5)

Risolto con

ax.set_ylim(6.0, 0)

L'ho risolto aggiungendo questa riga nel mio codice, con matplotlib==3.1.1:

ax.set_ylim(sorted(ax.get_xlim(), reverse=True))

NB. L'unico motivo per cui funziona è perché l'asse x non è cambiato, quindi usalo a tuo rischio con le future versioni di mpl

matplotlib 3.1.2 è disponibile - È disponibile nel cloud Anaconda tramite conda-forge ma non sono stato in grado di installarlo tramite conda install. L'alternativa manuale ha funzionato: Scarica matplotlib 3.1.2 da GitHub e installa tramite pip

 % curl https://codeload.github.com/matplotlib/matplotlib/tar.gz/v3.1.2 --output matplotlib-3.1.2.tar.gz
 % pip install matplotlib-3.1.2.tar.gz

Succede con matplotlib versione 3.1.1 come suggerito da importantofbeingernest

In seguito ha risolto il mio problema

pip install matplotlib==3.1.0

rustyDev ha ragione su conda-forge, ma non avevo bisogno di eseguire un'installazione pip manuale da un download di github. Per me, su Windows, ha funzionato direttamente. E le trame sono di nuovo tutte belle.

https://anaconda.org/conda-forge/matplotlib

conda install -c conda-forge matplotlib

punti opzionali, non necessari per la risposta:

Successivamente, ho provato altri passaggi, ma non sono necessari: Nel prompt di conda: conda search matplotlib --info non ha mostrato informazioni sulla nuova versione, le informazioni più recenti erano per 3.1.1. Così ho provato a usare pippip install matplotlib==3.1.2 ma pip dice "Requisito già soddisfatto"

Quindi ottenere la versione secondo medium.com/@rakshithvasudev/… python - import matplotlib - matplotlib.__version__ mostra che la 3.1.2 è stata installata con successo

A proposito, ho riscontrato questo errore direttamente dopo l'aggiornamento di Spyder alla v4.0.0. L'errore era in una trama di una matrice di confusione. Questo è stato menzionato già alcuni mesi fa. stackoverflow.com/questions/57225685/… che è già collegato a questa domanda Seaborn.

conda install matplotlib = 3.1.0

Questo ha funzionato per me e ho effettuato il downgrade di matplotlib da 3.1.1 a 3.1.0 e le mappe di calore hanno iniziato a comportarsi correttamente

Ho risolto questo problema con il seguente codice: