Risposte:
Avevo l'impressione che InnoDB potesse disabilitare e abilitare le chiavi. Ho appena scavato. Non si può fare. Quindi mi sbagliavo.
I vincoli chiave, tuttavia, possono essere attivati e disattivati per una sessione specifica:
SET unique_checks = 0;
SET foreign_key_checks = 0;