Perché yum non installa gli aggiornamenti?


9

Ricevo errori, penso con coreutils, dove yum non si aggiorna. Ecco un output ridotto di quello che vedo quando corro yum update:

Resolving Dependencies
There are unfinished transactions remaining. You might consider running yum-complete-transaction first to finish them.
The program yum-complete-transaction is found in the yum-utils package.
--> Running transaction check
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.el6 will be updated
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.1.el6 will be an update
... more of the same, and then:
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
... then more of the same    --> Finished Dependency Resolution
--> Running transaction check
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64
---> Package kernel.x86_64 0:2.6.32-431.17.1.el6 will be erased
--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
           Requires: coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Removing: coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
               coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Updated By: coreutils-8.4-37.el6.x86_64 (base)
               coreutils = 8.4-37.el6
 You could try using --skip-broken to work around the problem
** Found 71 pre-existing rpmdb problem(s), 'yum check' output follows:
audit-libs-2.3.7-5.el6.x86_64 is a duplicate with audit-libs-2.2-4.el6_5.x86_64
audit-libs-python-2.3.7-5.el6.x86_64 is a duplicate with audit-libs-python-2.2-4.el6_5.x86_64
... then lots more like the above duplicate

Ho un altro server che è (quasi) identico a questo (sono bilanciati in base al carico e funzionano dalla stessa immagine) e quello non ha questo stesso problema. Quale potrebbe essere il problema e come devo procedere al meglio?

Aggiornare:

Ho anche eseguito yum-complete-transactionquesto errore e ho detto che aveva rinominato i file delle transazioni. Dice ancora che c'è una transazione incompleta ma ora questo succede quando lo eseguo:

[root@nico ~]# yum-complete-transaction
Loaded plugins: fastestmirror
Loading mirror speeds from cached hostfile
 * webtatic: uk.repo.webtatic.com
drivesrvr                                                                                                                                                                                                                                |  951 B     00:00
There are 1 outstanding transactions to complete. Finishing the most recent one
The remaining transaction had 252 elements left to run
... lots of:
Package name-1.23.x8x_64 already installed and latest version
...
--> Running transaction check
... lots of entries like this:
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.el6 will be updated
... and this:
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.1.el6 will be an update
... and this:
---> Package audit-libs.x86_64 0:2.2-4.el6_5 will be erased
Killed

Quindi si interrompe improvvisamente con la Killedlinea.

Ho provato a correre yum update --skip-brokendopo:

[root@nico ~]# yum update --skip-broken
Freeing read locks for locker 0x7d: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x7f: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x80: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x81: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x82: 28940/139976145426176
Loaded plugins: downloadonly, fastestmirror, replace
Setting up Update Process
Loading mirror speeds from cached hostfile
 * webtatic: uk.repo.webtatic.com
drivesrvr                                                                                                                                                                                                                                |  951 B     00:00
Resolving Dependencies
There are unfinished transactions remaining. You might consider running yum-complete-transaction first to finish them.
--> Running transaction check
... lots of will be updated/will be an update/etc, then:
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64

Quindi diverse altre Running transaction check:e Processing Dependency: coreutils =...voci tra più willy be updated/willbe an updatevoci. Poi:

Packages skipped because of dependency problems:
    coreutils-8.4-37.el6.x86_64 from base

Dependencies Resolved

Quindi mi viene mostrata una tabella con un elenco di Installing:e Updating:pacchetti, con un riepilogo alla fine:

Install       2 Package(s)
Upgrade      79 Package(s)
Remove        1 Package(s)

Quindi scarica tutti i pacchetti (81/81 correttamente) e infine mostra questo:

Total                                                                                                                                                                                                                           3.0 MB/s | 115 MB     00:37
Running rpm_check_debug
Killed

Aggiornamento 2:

Ho anche corso yum clean alle ho avuto dei problemi anche lì. Ho trovato alcuni consigli per rimuovere i __db*file e riprovare:

[root@nico ~]# yum clean all
rpmdb: Thread/process 29404/139880514733824 failed: Thread died in Berkeley DB library
error: db3 error(-30974) from dbenv->failchk: DB_RUNRECOVERY: Fatal error, run database recovery
error: cannot open Packages index using db3 -  (-30974)
error: cannot open Packages database in /var/lib/rpm
CRITICAL:yum.main:

Error: rpmdb open failed
[root@nico ~]# rm -f /var/lib/rpm/__db*
[root@nico ~]# yum clean all
Loaded plugins: downloadonly, fastestmirror, replace
Cleaning repos: base drivesrvr epel extras ius newrelic percona-release-noarch percona-release-x86_64 rackspace updates webtatic
Cleaning up Everything
Cleaning up list of fastest mirrors
[root@nico ~]# yum clean all
Loaded plugins: downloadonly, fastestmirror, replace
Cleaning repos: base drivesrvr epel extras ius newrelic percona-release-noarch percona-release-x86_64 rackspace updates webtatic
Cleaning up Everything
[root@nico ~]#

Aggiornamento 3:

Ho /var/log/messageseseguito yum-complete-transactionla coda e ho visto un sacco di output mentre correvo , le ultime due righe erano:

Nov 14 08:19:47 nico kernel: Out of memory: Kill process 30995 (yum-complete-tr) score 149 or sacrifice child
Nov 14 08:19:47 nico kernel: Killed process 30995, UID 0, (yum-complete-tr) total-vm:641952kB, anon-rss:181420kB, file-rss:4kB

Quindi presumibilmente questo suggerisce che è legato alla memoria. In tal caso, si tratta di un caso in cui è necessaria più RAM o potrebbe esserci un altro problema che devo esaminare?


2
Hai controllato i log di sistema? La memoria potrebbe essere esaurita.
— Michael Hampton,

Sì, ho appena aggiornato la domanda (aggiornamento 3) con le informazioni sulla memoria, penso che tu abbia ragione.
— Leonard Challis,

Risposte:


6

Problema simile - e la mia correzione. Ho avuto anche un problema con la memoria, quindi ho dovuto aggiornare la memoria del VPS. Ho quindi fatto un aggiornamento yum - ovviamente ho ricevuto gli errori come sopra. Quindi ho guardato al fallimento e ho notato che cosa è successo è stato che Yum ha installato (beh, ha iniziato a installare) gli ultimi coreutils - versione 37, mentre avevo ancora pezzi di 31. Quindi prima ho rimosso la versione 37, quindi pulito e poi eseguito l'aggiornamento yum ancora.

Ciò ha reso la versione "31" disponibile per essere "aggiornata" in modo pulito. Vedi i lavori di seguito:

--> Running transaction check
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
           Requires: coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Removing: coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
               coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Updated By: coreutils-8.4-37.el6.x86_64 (base)
               coreutils = 8.4-37.el6
 You could try using --skip-broken to work around the problem

In esecuzione yum remove coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64:

Loaded plugins: fastestmirror
Setting up Remove Process
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6 will be erased
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved
==============================
========================================================================================

Package                         Arch                    Version                    Repository                  Size
======================================================================================================================
Removing:
 coreutils-libs                  x86_64                  8.4-37.el6                  installed                  5.4 k

Transaction Summary
======================================================================================================================
Remove        1 Package(s)

Installed size: 5.4 k
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
  Erasing    : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   1/1 
  Verifying  : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   1/1 

Removed:
  coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6                                                                                  

Complete!

Pulendo usando yum clean all:

Loaded plugins: fastestmirror
Cleaning repos: base extras updates
Cleaning up Everything
Cleaning up list of fastest mirrors

Fare l'aggiornamento dell'elenco dei pacchetti yum update:

Loaded plugins: fastestmirror
Setting up Update Process
Determining fastest mirrors
 * base: mirrors.lga7.us.voxel.net
 * extras: mirrors.lga7.us.voxel.net
 * updates: mirror.cc.columbia.edu
base                                                                                           | 3.7 kB     00:00     
base/primary_db                                                                                | 4.6 MB     00:00     
extras                                                                                         | 3.4 kB     00:00     
extras/primary_db                                                                              |  30 kB     00:00     
updates                                                                                        | 3.4 kB     00:00     
updates/primary_db                                                                             | 1.5 MB     00:00     
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
---> Package coreutils-libs.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
---> Package coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved

======================================================================================================================
 Package                          Arch                     Version                       Repository              Size
======================================================================================================================
Updating:
 coreutils                        x86_64                   8.4-37.el6                    base                   3.0 M
 coreutils-libs                   x86_64                   8.4-37.el6                    base                    50 k

Transaction Summary
======================================================================================================================
Upgrade       2 Package(s)

Total download size: 3.1 M
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
(1/2): coreutils-8.4-37.el6.x86_64.rpm                                                         | 3.0 MB     00:00     
(2/2): coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64.rpm                                                    |  50 kB     00:00     
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Total                                                                                  44 MB/s | 3.1 MB     00:00     
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
  Updating   : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   1/4 
  Updating   : coreutils-8.4-37.el6.x86_64                                                                        2/4 
  Cleanup    : coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                               3/4 
  Cleanup    : coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                                    4/4 
  Verifying  : coreutils-8.4-37.el6.x86_64                                                                        1/4 
  Verifying  : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   2/4 
  Verifying  : coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                               3/4 
  Verifying  : coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                                    4/4 

Updated:
  coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6                           coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6                          

Complete!

-Sup.


10

Il solito motivo per yummorire Killedè che il sistema ha esaurito la memoria.

Dai tuoi registri sembra che tu abbia un'istanza di Amazon t1.micro, o qualcosa di simile, e senza spazio di scambio. Questa quantità limitata di memoria spesso non è sufficiente per completare un gran numero di installazioni / aggiornamenti di pacchetti.

Per risolvere il problema:

  1. Chiudere i servizi in esecuzione fino a quando non si dispone di memoria sufficiente per completare la transazione yum.

    O...

  2. Aggiungi un file di scambio o scambia su memoria temporanea alla tua istanza.

Quindi dovresti essere in grado di completare le tue transazioni yum.


Infine, per eliminare i problemi del pacchetto dai precedenti aggiornamenti non riusciti, provare

package-cleanup --cleandupes

prima di eseguire altri aggiornamenti.


1
Potresti anche cogliere l'occasione per passare a un'istanza t2.micro, che ha più memoria, di solito è più veloce ed è più economica.
— Michael Hampton,

Grazie. È stato necessario arrestare httpd, ma ha funzionato e dopo aver ripulito.
— Leonard Challis,

2

Prova you update --skip-brokenche salterà i pacchetti rotti (puoi gestirli in seguito), probabilmente è una buona idea eseguire yum clean allprima di fare qualsiasi cosa.


1

Filtrare le informazioni estranee che hai citato e a metà strada yumgià prova ad aiutarti:

Rimangono transazioni non finite. Potresti considerare di correre yum-complete-transactionprima per finirli. Il programma yum-complete-transazione si trova nel pacchetto yum-utils.

Ci hai già provato?


Sì, in realtà l'ho fatto. Mi disse che non poteva essere completato e aveva rinominato i file delle transazioni
— Leonard Challis,

Ho aggiunto ulteriori dettagli alla domanda con esempi di quando le cose non vanno a buon fine.
— Leonard Challis,

0

Prova a

yum downgrade nomepacchetto

Non so perché ma si aggiorna, o almeno lo ha fatto per me con il pacchetto tcpdump. Sono passato dalla versione tcpdump-4.5.1-2.el7.x86_64 a tcpdump-4.7.4-1_ESG_ring.x86_64 che è quello che volevo.

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