Quando correggere i valori di p in più confronti?


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Temo che le domande correlate non abbiano risposto alle mie. Valutiamo le prestazioni di> 2 classificatori (apprendimento automatico). La nostra ipotesi nulla è che le prestazioni non differiscano. Eseguiamo test parametrici (ANOVA) e non parametrici (Friedman) per valutare questa ipotesi. Se sono significativi, vogliamo scoprire quali classificatori differiscono in una ricerca post-hoc.

La mia domanda è duplice:

1) È necessaria una correzione dei valori di p dopo test comparativi multipli? Il sito Wikipedia tedesco su "Alphafehler Kumulierung" afferma che il problema si verifica solo se vengono verificate più ipotesi sugli stessi dati. Quando si confrontano i classificatori (1,2), (1,3), (2,3), i dati si sovrappongono solo parzialmente. È ancora necessario correggere i valori p?

2) La correzione del valore P viene spesso utilizzata dopo il test a coppie con un test t. È necessario anche quando si eseguono test specialistici post-hoc, come il test Nemenyi (non parametrico) o HSD di Tukey? Questa risposta dice "no" per l'HSD di Tukey: il test HSD di Tukey è corretto per confronti multipli? . Esiste una regola o devo cercarla per ogni potenziale test post-hoc?

Grazie!


Perché stai eseguendo entrambi i test ANOVA e Friedman?
— Alexis,

Si tratta di un framework di test automatizzato che dovrebbe fornire al revisore un'alternativa sia parametrica che non parametrica, se le ipotesi parametriche non sono soddisfatte.
— Chris,

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Informazioni sui test omnibus che hai citato: (A) se i tuoi gruppi di dati sono indipendenti, dovresti usare il test ANOVA (parametrico) o Kruskal-Wallis (non parametrico); (B) se i tuoi gruppi sono dipendenti (ad es. Misure ripetute), dovresti usare il test ANOVA (parametrico) o Friedman (non parametrico) su misure ripetute. (Classica) ANOVA e Friedman test in quanto la sua alternativa non sembra corretta.
— GegznaV,

Risposte:


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Risposta alla domanda 1
È necessario adeguarsi a confronti multipli se si tiene conto della probabilità con cui si commetterà un errore di tipo I. Una semplice combinazione di esperimento metafora / pensiero può aiutare:

Immagina di voler vincere alla lotteria. Questa lotteria, stranamente, ti dà una probabilità 0,05 di vincere (cioè 1 su 20). M è il costo del biglietto in questa lotteria, il che significa che il tuo ritorno previsto per una singola chiamata alla lotteria è M / 20. Ora ancora più strano, immagina che per ragioni sconosciute, questo costo, M , ti permetta di avere tutti i biglietti della lotteria che vuoi (o almeno più di due). Pensando a te stesso "più giochi, più vinci" prendi un sacco di biglietti. Il rendimento atteso per una chiamata alla lotteria non è più M / 20, ma qualcosa di leggermente più grande. Ora sostituisci "vincere alla lotteria" con "commettere un errore di tipo I."

Se non ti preoccupi degli errori e non ti preoccupi delle persone che indirizzano ripetutamente e beffardamente la tua attenzione su un determinato cartone animato di jellybeans , vai avanti e non adattarti a confronti multipli.

La questione degli "stessi dati" si pone nei metodi di correzione degli errori a livello familiare (ad esempio Bonferroni, Holm-Sidák, ecc.), Poiché il concetto di "famiglia" è piuttosto vago. Tuttavia, i metodi del tasso di scoperta falsa (ad esempio Benjamini e Hochberg, Benjamini e Yeuketeli, ecc.) Hanno una proprietà che i loro risultati sono solidi in diversi gruppi di inferenze.



α


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+1 per una risposta completa e divertente (e per fare riferimento a xkcd). In particolare, hai anche affrontato la mia domanda ancora non equilibrata se c'è una differenza tra "test di Bonferroni" e "correzione di Bonferroni". Tuttavia, ti dispiacerebbe spiegare il problema dei confronti multipli in termini di descrizione del mio problema? Capisco che un classificatore è come un gruppo di trattamento con nessun / jelly bean blu / verde / ... nel fumetto.
— Chris,

pp

Penso che vada bene, grazie mille! Potrebbe volerci un po 'più di tempo per applicare l'esempio della lotteria al mio caso d'uso, ma ho avuto l'idea.
— Chris,

@Chris capisce che la lotteria era solo una metafora. Se hai bisogno di aiuto per applicare i metodi FWER o FDR, dai un'occhiata alle voci di Wikipedia, cerca qui le domande correlate o, forse, fai una nuova domanda a riguardo. :)
— Alexis,
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