Qual è il miglior libro di testo introduttivo per le statistiche bayesiane?
Un libro per risposta, per favore.
Qual è il miglior libro di testo introduttivo per le statistiche bayesiane?
Un libro per risposta, per favore.
Risposte:
John Kruschke ha pubblicato un libro a metà 2011 intitolato Doing Bayesian Data Analysis: A Tutorial with R and BUGS . (Una seconda edizione è stata rilasciata nel novembre 2014: Doing Bayesian Data Analysis, Seconda edizione: A Tutorial con R, JAGS e Stan .) È davvero introduttiva. Se vuoi passare dalle statistiche frequentiste a Bayes, specialmente con la modellazione multilivello, consiglio Gelman e Hill.
John Kruschke ha anche un sito Web per il libro che contiene tutti gli esempi del libro in BUGS e JAGS. Anche il suo blog sulle statistiche bayesiane si collega al libro.
Il mio preferito è "Bayesian Data Analysis" di Gelman, et al.
Il ripensamento statistico , è stato pubblicato solo poche settimane fa e quindi lo sto ancora leggendo, ma penso che sia un'aggiunta molto bella e fresca ai libri davvero introduttivi sulle statistiche bayesiane. L'autore usa un approccio simile a quello usato da John Kruschke nei suoi libri sui cuccioli ; spiegazioni molto dettagliate, dettagliate, bei esempi pedagogici, usa anche un approccio computazionale piuttosto che matematico.
Le lezioni su Youtube e altro materiale sono disponibili anche da qui .
Un altro voto per Gelman et al., Ma un secondo vicino per me - essendo della persuasione apprendendo - è il "calcolo bayesiano con R" di Jim Albert .
Sivia and Skilling, Analisi dei dati: un tutorial bayesiano (2ed) 2006 246p 0198568320 books.goo :
Le lezioni di statistica sono state fonte di grande stupore e frustrazione per generazioni di studenti. Questo libro tenta di porre rimedio alla situazione esponendo un approccio logico e unificato all'intero argomento dell'analisi dei dati. Questo testo è inteso come guida tutorial per studenti universitari senior e studenti di ricerca in scienze e ingegneria ...
Non conosco le altre raccomandazioni però.
Per un'introduzione, consiglierei la programmazione probabilistica e i metodi bayesiani per hacker di Cam Davidson-Pilon, disponibili gratuitamente online.
Dalla sua descrizione:
Un'introduzione ai metodi bayesiani e alla programmazione probabilistica dal punto di vista del calcolo / comprensione, prima matematica, secondo.
È altamente visivo, taglia direttamente al valore e riempie i dettagli più grossi in seguito, ha molti esempi, ha un codice interattivo (nel Notebook IPython).
Consiglio vivamente la divertente polemica "Probability Theory: The Logic of Science" di ET Jaynes.
Questo è un testo introduttivo nel senso di non richiedere (e in effetti preferire) nessuna precedente conoscenza della statistica, ma alla fine impiega matematica abbastanza sofisticata. Rispetto alla maggior parte delle altre risposte fornite, questo libro non è altrettanto pratico o facile da digerire, ma fornisce la base filosofica al perché si vorrebbe impiegare metodi bayesiani e perché non usare approcci frequentisti. È introduttivo in un modo storico e filosofico, ma non pedagogico.
Sono un ingegnere elettrico e non uno statistico. Ho passato un sacco di tempo a esaminare Gelman ma non credo che uno possa riferirsi a Gelman come introduttivo. Il mio professore di guru bayesiano di Carnegie Mellon è d'accordo con me su questo. avere la minima conoscenza di statistiche e R and Bugs (come il modo semplice per fare qualcosa con stat bayesiano) Fare analisi dei dati bayesiani: un tutorial con R e BUG è un inizio sorprendente. Puoi confrontare facilmente tutti i libri offerti dalla loro copertina!
Aggiornamento di 5 anni dopo: voglio aggiungere che forse un altro importante modo di apprendere in modo rapido (40 minuti) è quello di consultare la documentazione di uno strumento Bayesian Net GUI come Netica 2 . Inizia con le basi, ti guida attraverso le fasi di costruzione di una rete basata su una situazione e dei dati e su come eseguire le tue domande avanti e indietro per "ottenerlo!".
Il suo focus non è strettamente sulle statistiche bayesiane, quindi manca di metodologia, ma la teoria dell'informazione, l'inferenza e gli algoritmi di apprendimento di David MacKay mi hanno fatto comprendere intuitivamente le statistiche bayesiane meglio di altre - la maggior parte fa quanto abbastanza bene, ma ho sentito MacKay spiegare perché meglio.
I libri di Gelman sono tutti eccellenti ma non necessariamente introduttivi in quanto presumono che tu sappia già alcune statistiche. Pertanto sono un'introduzione al modo bayesiano di fare statistiche piuttosto che alle statistiche in generale. Vorrei comunque dare loro i pollici in su, comunque.
Come libro introduttivo di statistica / econometria che assume una prospettiva bayesiana, consiglierei l'econometria bayesiana di Gary Koop .
" Bayesian Core: A Practical Approach to Computational Bayesian Statistics " di Marin e Robert, Springer-Verlag (2007).
"Why?": L'autore spiega il perché della scelta bayesiana e quanto molto bene. È un libro pratico, ma scritto da uno dei migliori pensatori bayesiani in vita. Non è esaustivo. Altri libri hanno questo obiettivo. Raccoglie alcuni argomenti che sono pertinenti, utili e illuminanti le basi.
A proposito di "scelta": se vuoi davvero approfondire la fondazione bayesiana, "La scelta bayesiana" di Xi'an è chiara, profonda, essenziale.
Il mio primo testo di laurea preferito per le statistiche bayesiane è di Bolstad, Introduzione alle statistiche bayesiane . Se stai cercando qualcosa di livello universitario, questo sarà troppo elementare, ma per qualcuno che è nuovo nelle statistiche questo è l'ideale.
Non so perché nessuno abbia menzionato il libro introduttivo su Bayesian:
C'è una versione PDF gratuita per il libro. Il libro offre abbastanza materiale per chiunque abbia poca esperienza in bayesiano. Introduce il concetto di distribuzione precedente, distribuzione posteriore, distribuzione beta ecc.
Provalo, è gratis.
Ho letto alcune parti di A First Course in Bayesian Statistical Methods di Peter Hoff e l'ho trovato facile da seguire. (Esempio di codice R fornito in tutto il testo)
Ho trovato un'eccellente introduzione in Gelman and Hill (2007) Analisi dei dati usando modelli di regressione e multilivello / gerarchici . (Altri commenti lo menzionano, ma merita di essere votato da solo.)
Provenendo da un contesto non statistico, ho trovato l' introduzione alla statistica applicata bayesiana e la stima per gli scienziati sociali piuttosto istruttiva e facile da seguire.
Se stai cercando un testo elementare, cioè uno che non ha un prerequisito di calcolo, ci sono le statistiche di Don Berry : una prospettiva bayesiana .
Dai un'occhiata a "The Bayesian Choice" . Ha il pacchetto completo: basi, applicazioni e calcolo. Chiaramente scritto.
Ho almeno dato un'occhiata alla maggior parte di questi in questo elenco e nessuno è buono come le nuove idee bayesiane e l'analisi dei dati secondo me.
Modifica: è facile iniziare immediatamente a fare l'analisi bayesiana durante la lettura di questo libro. Non solo modellare la media da una distribuzione normale con varianza nota, ma l'analisi dei dati effettivi dopo i primi due capitoli. Tutti gli esempi di codice e i dati si trovano sul sito Web del libro. Copre una discreta quantità di teoria ma l'attenzione è rivolta alle applicazioni. Molti esempi su una vasta gamma di modelli. Bel capitolo sulla nonparametria bayesiana. Esempi di Winbugs, R e SAS. Lo preferisco a Do Bayesian Data Analysis (ne ho entrambi). La maggior parte dei libri qui (Gelman, Robert, ...) non sono introduttivi secondo me e, a meno che tu non abbia qualcuno con cui parlare, probabilmente rimarranno con più domande e risposte. Il libro di Albert non tratta abbastanza materiale per sentirsi a proprio agio nell'analizzare i dati diversi da quanto presentato nel libro (di nuovo la mia opinione).
Mi piace molto Markov Chain Monte Carlo: Simulazione stocastica per inferenza bayesiana di Gamerman e Lopes.
Per i principianti assoluti, prova William Briggs Breaking the Law of Averages: probabilità di vita reale e statistiche in inglese semplice
Devo semplicemente includere MCMC nella pratica . Fornisce un'eccellente introduzione a MCMC, forse non così generale come altri libri citati, ma eccellente per ottenere intuizioni e intuizioni. Lo consiglio leggerlo dopo (o in parallelo con) Bayesiano calcolo con R .
Se vieni dalle scienze fisiche (fisica / astronomia) ti consiglierei l'analisi dei dati logici bayesiani per le scienze fisiche: un approccio comparativo con il supporto Mathematica® di Gregory (2006).
Sebbene la parte del titolo "with Mathematica® Support" sia riservata esclusivamente a questioni commerciali (gli usi del codice Mathematica sono molto scarsi), la cosa positiva di questo libro è che si tratta davvero di un'introduzione all'argomento delle probabilità e delle statistiche. Ha anche alcuni capitoli sulle statistiche dei frequentisti. Tuttavia, una volta che ci provi, scegli il libro di Gelman et. al che molte persone ti hanno raccomandato. La maggior parte del materiale nel libro di Gregory è preso alla leggera (se no, non sarebbe un'introduzione): il libro di Gelman è stato per me un vero risveglio da quello di Gregory.
Leggo:
Gelman et al (2013). Analisi dei dati bayesiani. CRC Press LLC. 3a ed.
Hoff, Peter D (2009). Un primo corso in metodi statistici bayesiani. Testi Springer in Statistica.
Kruschke, Doing Bayesian Data Analysis: A Tutorial with R and Bugs, 2011. Academic Press / Elsevier.
e penso che il migliore per cominciare sia il libro di Kruschke. È perfetto per un primo approccio al pensiero bayesiano: i concetti sono spiegati in modo molto chiaro, non c'è troppa matematica e ci sono molti esempi carini!
Gelman et al. è un grande libro, ma è più avanzato e suggerisco di leggerlo dopo quello di Kruschke.
Al contrario, il libro di Hoff non mi è piaciuto perché è un libro introduttivo, ma i concetti (e il pensiero bayesiano) non sono spiegati in modo chiaro. Suggerisco di passare oltre.
Se dovessi scegliere un solo testo per un principiante, lo sarebbe
Sivia DS and Skilling J (2006) book (see below).
Di tutti i libri elencati di seguito si sforza di dare una comprensione intuitiva delle idee essenziali, ma richiede ancora un po 'di raffinatezza matematica dalla pagina 1.
Di seguito è riportato un elenco di ulteriori letture dal mio libro, con commenti su ogni pubblicazione.
Bernardo, JM e Smith, A, (2000) 4. Teoria bayesiana Un resoconto rigoroso dei metodi bayesiani, con molti esempi del mondo reale.
Bishop, C (2006) 5. Riconoscimento dei modelli e apprendimento automatico. Come suggerisce il titolo, si tratta principalmente di apprendimento automatico, ma fornisce un resoconto lucido e completo dei metodi bayesiani.
Cowan G (1998) 6. Analisi dei dati statistici. Un'eccellente introduzione non bayesiana all'analisi statistica.
Dienes, Z (2008) 8. Comprendere la psicologia come scienza: un'introduzione all'inferenza scientifica e statistica. Fornisce materiale tutorial sulla regola di Bayes e un'analisi lucida della distinzione tra statistiche bayesiane e statistiche frequentiste.
Gelman A, Carlin J, Stern H e Rubin D. (2003) 14. Analisi dei dati bayesiani. Un resoconto rigoroso e completo dell'analisi bayesiana, con molti esempi del mondo reale.
Jaynes E e Bretthorst G (2003) 18. Teoria della probabilità: la logica della scienza. Il classico moderno dell'analisi bayesiana. È completo e saggio. Il suo stile discorsivo lo rende lungo (600 pagine) ma mai noioso, ed è pieno di intuizioni.
Khan, S, 2012, Introduzione al teorema di Bayes. I video di matematica online di Salman Khan rappresentano una buona introduzione a vari argomenti, inclusa la regola di Bayes.
Lee PM (2004) 27. Statistiche bayesiane: un'introduzione. Un testo rigoroso e completo con uno stile bayesiano rigoroso.
MacKay DJC (2003) 28. Teoria dell'informazione, inferenza e algoritmi di apprendimento. Il classico moderno sulla teoria dell'informazione. Un testo molto leggibile che vaga in lungo e in largo su molti argomenti, quasi tutti sfruttando la regola di Bayes.
Migon, HS e Gamerman, D (1999) 30. Inferenza statistica: un approccio integrato. Un resoconto semplice (e chiaramente definito) dell'inferenza, che mette a confronto approcci bayesiani e non bayesiani. Nonostante sia abbastanza avanzato, lo stile di scrittura è un tutorial in natura.
Pierce JR (1980) 34 2nd Edition. Un'introduzione alla teoria dell'informazione: simboli, segnali e rumore. Pierce scrive con uno stile di scrittura informale e tutorial, ma non si presenta dal presentare i teoremi fondamentali della teoria dell'informazione.
Reza, FM (1961) 35. Un'introduzione alla teoria dell'informazione. Un libro più completo e matematico è rigoroso rispetto al precedente libro di Pierce e dovrebbe idealmente essere letto solo dopo aver letto il testo più informale di Pierce.
Sivia DS e Skilling J (2006) 38. Analisi dei dati: un tutorial bayesiano. Questa è un'eccellente introduzione in stile tutorial ai metodi bayesiani.
Spiegelhalter, D e Rice, K (2009) 36. Statistiche bayesiane. Scholarpedia, 4 (8): 5230. http://www.scholarpedia.org/article/Bayesian_statistics Un riassunto affidabile e completo dello stato attuale delle statistiche bayesiane.
Ed ecco il mio libro, pubblicato a giugno 2013.
La regola di Bayes: un'esercitazione introduttiva all'analisi bayesiana, Dr James V Stone, ISBN 978-0956372840
Il capitolo 1 può essere scaricato da: http://jim-stone.staff.shef.ac.uk/BookBayes2012/BayesRuleBookMain.html
Descrizione: Scoperta da un matematico e predicatore del XVIII secolo, la regola di Bayes è una pietra miliare della moderna teoria della probabilità. In questo libro riccamente illustrato, viene usata una serie di esempi accessibili per mostrare come la regola di Bayes sia in realtà una conseguenza naturale del ragionamento di buon senso. La regola di Bayes viene derivata utilizzando rappresentazioni grafiche intuitive della probabilità e l'analisi bayesiana viene applicata alla stima dei parametri utilizzando i programmi MatLab forniti. Lo stile tutorial di scrittura, combinato con un glossario completo, rende questo un primer ideale per il principiante che desidera acquisire familiarità con i principi di base dell'analisi bayesiana.
Non strettamente le statistiche bayesiane in quanto tali, ma posso consigliare vivamente "Un primo corso sull'apprendimento automatico" di Rogers e Girolami, che è essenzialmente un'introduzione agli approcci bayesiani all'apprendimento automatico. È molto ben strutturato, chiaro e rivolto agli studenti senza un forte background matematico. Ciò significa che è una buona prima introduzione alle idee bayesiane. C'è anche il codice MATLAB / OCTAVE che è una bella caratteristica.
Questo libro suggerisce che si rivolge a livello universitario entry level
Biostatistica: un'introduzione bayesiana. Di George G Woodsworth.
Pubblicato da John Wiley & Sons
Gill, J. (2014). Metodi bayesiani: un approccio alle scienze sociali e comportamentali. 3a edizione.
Scritto da un professore di scienze politiche, con in mente scienziati sociali come target di riferimento. Viene fornito il codice R.
http://www.amazon.com/Bayesian-Methods-Behavioral-Sciences-Statistics/dp/1439862486/
Poiché il tipo di principiante non è specificato nella domanda, ecco il mio consiglio per gli esperti di statistica:
Andrew B. Lawson ed Emmanuel Lesaffre (2012): Bayesian Biostatistics
Questo libro è stato usato nel primo anno del nostro maestro di scienze statistiche e l'ho trovato relativamente facile da capire per un argomento così difficile. Come per la maggior parte dei libri di "biostatistica", gli esempi sono principalmente di biologia clinica, ma i metodi non si limitano a quelli utili nella scienza clinica. Prima di questo avevamo avuto circa mezzo anno di educazione statistica e oltre al teorema di Bayes, le statistiche bayesiane non erano ancora state introdotte.
La cosa interessante è che le 649 diapositive delle presentazioni di accompagnamento sono disponibili online .