Inoltre, se si desidera calcolare l'intervallo di confidenza di Fieller non utilizzando mratios
(in genere perché non si desidera un adattamento semplice ma ad esempio un adattamento glmer o glmer.nb), è possibile utilizzare la seguente FiellerRatioCI
funzione, con modello l'output del modello, aname il nome del parametro numeratore, bname il nome del parametro denomiator. È inoltre possibile utilizzare direttamente la funzione FiellerRatioCI_basic dando, a, b e la matrice di covarianza tra aeb.
Nota, l'alfa qui è 0,05 e "hardcoded" negli 1,96 del codice. Puoi sostituirli con qualsiasi livello di Studente che preferisci.
FiellerRatioCI <- function (x, ...) { # generic Biomass Equilibrium Level
UseMethod("FiellerRatioCI", x)
}
FiellerRatioCI_basic <- function(a,b,V,alpha=0.05){
theta <- a/b
v11 <- V[1,1]
v12 <- V[1,2]
v22 <- V[2,2]
z <- qnorm(1-alpha/2)
g <- z*v22/b^2
C <- sqrt(v11 - 2*theta*v12 + theta^2 * v22 - g*(v11-v12^2/v22))
minS <- (1/(1-g))*(theta- g*v12/v22 - z/b * C)
maxS <- (1/(1-g))*(theta- g*v12/v22 + z/b * C)
return(c(ratio=theta,min=minS,max=maxS))
}
FiellerRatioCI.glmerMod <- function(model,aname,bname){
V <- vcov(model)
a<-as.numeric(unique(coef(model)$culture[aname]))
b<-as.numeric(unique(coef(model)$culture[bname]))
return(FiellerRatioCI_basic(a,b,V[c(aname,bname),c(aname,bname)]))
}
FiellerRatioCI.glm <- function(model,aname,bname){
V <- vcov(model)
a <- coef(model)[aname]
b <- coef(model)[bname]
return(FiellerRatioCI_basic(a,b,V[c(aname,bname),c(aname,bname)]))
}
Esempio (basato sull'esempio di base glm standard):
counts <- c(18,17,15,20,10,20,25,13,12)
outcome <- gl(3,1,9)
treatment <- gl(3,3)
glm.D93 <- glm(counts ~ outcome + treatment, family = poisson())
FiellerRatioCI(glm.D93,"outcome2","outcome3")
ratio.outcome2 min max
1.550427 -2.226870 17.880574