Idee per il software "notebook da laboratorio"?

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Quindi questa è una scelta strana, anche se in realtà penso che sia una strana misura per qualsiasi sito, quindi ho pensato di provarlo qui, tra i miei fratelli scricchiolanti di dati.

Sono venuto all'epidemiologia e alla biostatistica dalla biologia, e sicuramente ho ancora alcune abitudini da quel campo. Uno di questi è tenere un quaderno di laboratorio. È utile per documentare pensieri, decisioni, riflessioni sull'analisi, ecc. Tutto in un unico posto, tutto impegnato in modo da poter guardare indietro all'analisi in seguito e avere qualche idea di cosa ho fatto.

Ma sarebbe bello spostarlo nel 21 ° secolo. Soprattutto perché anche se il sistema del notebook da laboratorio è abbastanza decente per una persona e per documentare le decisioni, sarebbe bello poter allegare grafici dall'EDA, e-mail dai responsabili dei dati che discutono di un particolare set di dati, ecc.

Immagino che questo comporterà il rigging del mio sistema da un'unione empia di molti bit diversi, ma qualcuno sta attualmente usando un sistema e ha qualche consiglio?

references software eda

— Fomite
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Penso che potrebbe essere OK nonno (cioè lasciare aperto) questo thread.

— gung - Ripristina Monica

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Questi sono chiamati quaderni di laboratorio elettronici (ELN).

Ecco alcune delle opzioni open source che ho visto:

The Sage Notebook .
Il nuovo Notebook IPython , che ora può essere eseguito come webapp su EC2 e Azure.
Leo, che può essere utilizzato con IPython e in molti altri modi.
Varie soluzioni wiki, blog e CMS.

— Ed Hagen
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Ho finito per usare un wiki gratuito di Wikispaces come sostituto del mio attuale laboratorio sperimentale.

— Fomite,

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Il mio preferito: Evernote . Puoi taggare le voci (ad es. "Analisi", "idea", ecc.), Puoi incollare immagini e grafica e puoi condividere i taccuini con i collaboratori. E: è sostanzialmente gratuito (beh, freemium). Ma l'edizione gratuita è assolutamente sufficiente per me.

— Felix S
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Inoltre, ci sono app gratuite per Android e iOS.

— Jose Zubcoff,

+1 Trovo l'app mobile per Evernote particolarmente utile quando corri tra i laboratori o annoti un pensiero quando sei lontano da un computer.

— jthetzel,

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Non l'ho mai usato personalmente, ma Microsoft ha un software nella suite Office chiamato OneNote che raggiunge un obiettivo simile alle specifiche del tuo notebook e-lab. Fare riferimento al loro sito Web per ulteriori informazioni. Offrono anche una prova gratuita in bundle con MS Office qui .

— Christopher Aden
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@mbq hai trovato un sostituto Linux decente per Onenote?

— andreas-h,

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Ho trovato utile Xmind . Puoi attaccare qualsiasi cosa e la struttura ad albero è davvero utile per l'organizzazione. Mi piace soprattutto la funzionalità in cui è possibile eseguire il drill down nel nodo (argomento). Esistono altri prodotti software simili che sfruttano lo stesso concetto.

— mpiktas
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Freeplane e Freemind sono due alternative gratuite che ho usato per vari progetti. Un nuovo fork di FreeMind è MindPapp di SciPlore, che include il supporto per riferimenti BibTeX e l'importazione di segnalibri da un PDF.

— Wayne,

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Personalmente ho trovato il Livescribe 'smartpen' un dio inviare.

fonde il fidato "fascino del vecchio mondo" di un tradizionale quaderno a penna e carta ma include la capacità di registrare suoni (che si sincronizza con i tratti della penna) pronti per una successiva revisione. NB: c'è un rovescio della medaglia e cioè devi comprare carta speciale che funziona con la penna ..... altalene e round-a-attacchi davvero

L'audio / penna alimenta e può essere caricato sul web e quindi collegato a molti degli altri programmi già menzionati sopra.

Gli studenti a cui insegno (biomeccanica) adorano assolutamente questo e trovano che studiare in seguito concetti difficili molto più facile di prima (pre-livescribe)

— Andrew V
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Potresti voler dare un'occhiata all'ultima versione di Zotero beta , che ora è autonoma e non richiede Firefox.

— Wayne
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Zotero è un responsabile della bibliografia, non un ELN.

— nico,

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@nico: credo che tu possa archiviare tutto ciò che vuoi in Zotero, compresi i tuoi documenti. Non è esattamente un ELN, ma è gratuito e renderebbe facile includere (e indicizzare) anche altri materiali.

— Wayne,

certo, ed è bello che tu l'abbia menzionato (lo uso molto ed è fantastico), ma esistono altre alternative open source pensate specificamente come ELN, quindi perché non usarle?

— nico,

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Dai un'occhiata a questo articolo, Abbellire i dati nel mondo reale , dai precedenti di Nature per alcune idee.

— Charlie
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è un bell'articolo, ma aiuterebbe a sintetizzare alcune delle informazioni nella tua risposta

— Abe,

Ciao @Abe, Sì, sarebbe più utile. Non ho letto l'articolo da solo, trovandolo solo ieri e non essendo particolarmente interessato all'argomento da solo. Ho pensato che avrei condiviso comunque.

— Charlie,

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Che ne dici di una boogie board? Puoi scrivere i tuoi appunti su una lavagna e registrarli come la stessa idea della penna LiveScribe ma puoi salvarli come file PDF ... Non è ancora uscito, ma sarà tra meno di un mese.

— Berk U.
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Download gratuiti firefox 57.0 Download gratuiti.

— NomanJaved il