Stima della probabilità di sopravvivenza in R


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Sulla base di un campione di tempi di sopravvivenza, vorrei stimare la probabilità di sopravvivere al tempo , per alcuni specifici , usando lo stimatore Kaplan-Meier. È possibile farlo in ? Si prega di notare che non è necessariamente l'ora di un evento.t t tnttRt


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Ovviamente: vedi la funzione survfit () del pacchetto di sopravvivenza [type help (package = "survival")]
— Stéphane Laurent

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@Stephane Laurent: la funzione surfit () genera la sopravvivenza stimata durante gli eventi. Ma mi piacerebbe avere una procedura automatica per calcolare quella sopravvivenza in qualsiasi momento t. Grazie ...
— user7064

Quindi usa approxfun ()
— Stéphane Laurent l'

posso avere un esempio?
— user7064

Risposte:


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Puoi usare l'output della survfitfunzione dal survivalpacchetto e darlo a stepfun.

km <- survfit(Surv(time, status)~1, data=veteran)
survest <- stepfun(km$time, c(1, km$surv))

Ora survestè una funzione che può essere valutata in qualsiasi momento.

> survest(0:100)
  [1] 1.0000000 0.9854015 0.9781022 0.9708029 0.9635036 0.9635036 0.9635036
  [8] 0.9416058 0.9124088 0.9124088 0.8978102 0.8905109 0.8759124 0.8613139
 [15] 0.8613139 0.8467153 0.8394161 0.8394161 0.8175182 0.8029197 0.7883212
 [22] 0.7737226 0.7664234 0.7664234 0.7518248 0.7299270 0.7299270 0.7225540
 [29] 0.7225540 0.7151810 0.7004350 0.6856890 0.6856890 0.6783160 0.6783160
 [36] 0.6709430 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700
 [43] 0.6561970 0.6488240 0.6414510 0.6340780 0.6340780 0.6340780 0.6267050
 [50] 0.6193320 0.6193320 0.5972130 0.5750940 0.5677210 0.5529750 0.5529750
 [57] 0.5456020 0.5456020 0.5456020 0.5382290 0.5382290 0.5308560 0.5308560
 [64] 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830
 [71] 0.5234830 0.5234830 0.5161100 0.5087370 0.5087370 0.5087370 0.5087370
 [78] 0.5087370 0.5087370 0.5087370 0.4939910 0.4939910 0.4866180 0.4866180
 [85] 0.4791316 0.4791316 0.4791316 0.4716451 0.4716451 0.4716451 0.4640380
 [92] 0.4640380 0.4564308 0.4564308 0.4564308 0.4412164 0.4412164 0.4412164
 [99] 0.4412164 0.4257351 0.4179945

Surreal sta riscontrando un problema, sta cercando una risposta su StackExchange, trova la stessa domanda e si rende conto che sei stato tu a rispondere quasi 7 anni fa ...
— Brian Diggs,

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Un parametro time può essere passato alla funzione di riepilogo dell'oggetto survfit:

summary(km, times=100)

Un vettore può anche essere passato:

summary(km, times=0:100)
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