Il modo migliore per visualizzare l'attrito usando R?

Attraverso questo sito ho scoperto di recente Sankey Diagrams, un ottimo modo per visualizzare ciò che sta accadendo in un diagramma di flusso tradizionale .

Ecco un buon esempio di un diagramma di Sankey di George M. Whitesides e George W. Crabtree , Fonte; Non dimenticare la ricerca fondamentale a lungo termine in energia , scienza 9 febbraio 2007: vol. 315. no. 5813, pagg. 796 - 798.

Dopo essermi reso conto che non esisteva un pacchetto R di Sankey, ho trovato uno script R online , sfortunatamente questo script è piuttosto grezzo e piuttosto limitato. Con grandi speranze ho chiesto un pacchetto R Sankey o una funzione più matura su StackOverflow , ma con mia grande sorpresa sembra che non abbiamo una funzione matura per la creazione di diagrammi Sankey in R.

Dopo aver pubblicato una taglia Geek On Acid è stato così gentile da suggerire un piccolo trucco sullo script esistente che lo ha fatto funzionare più o meno per il mio scopo specifico.

Lo script R migliorato ha prodotto questo diagramma, Fonte; stackoverflow.com .

Ma la mancanza di un pacchetto R indica che Sankey Diagrams non è un modo così straordinario per visualizzare l'attrito usando R in un flusso di dati come quello presentato nel diagramma sopra (vedi domanda stackoverflow iniziale per dati e codice R. Forse c'è un modo migliore per visualizzare l'attrito.

Quale pensi sia il modo migliore per visualizzare l'attrito in un flusso di dati usando R?

Sono d'accordo con @gung. Il diagramma di Sankey che hai pubblicato è, credo, un ottimo esempio di dove la tecnica può aiutare. Sebbene sia complicato, anche il contesto (input e output di energia) è complesso ed è difficile pensare a un modo migliore di visualizzare i percorsi degli input-to-output-come-nuovi-input in più categorie di utilizzo.

Ora, per l'esempio di logoramento che hai pubblicato, come altri hanno notato, non è utile utilizzare un diagramma di Sankey. Penso che devi pubblicare il tuo set completo di variabili se vuoi una buona raccomandazione su visualizzazioni alternative. Se vuoi semplicemente mostrare differenze nelle fonti di logoramento tra siti e clinici, una serie di piccoli grafici di dot plot potrebbe essere la più facile da comprendere per il tuo pubblico e da implementare ( vedi questo esempio , dove nel tuo caso potrebbero essere i gruppi i siti, gli elementi all'interno dei gruppi sarebbero le cause di attrito e l'asse orizzontale sarebbe 0-100%).

Se il diagramma di Sankey è qualcosa che vuoi usare e sei disposto a dilettarti in un altro linguaggio di alto livello, c'è un bell'esempio (con codice) sulla galleria per il pacchetto di tracciamento di Python, matplotlib.

Non presumo necessariamente che la mancanza di un metodo implichi che il metodo non è importante o non è utile. Dopotutto, per tutti i metodi che esistono attualmente in R, c'è stato un tempo (molto probabilmente recente - R ha solo ~ 10 anni) in cui non c'era un pacchetto per esso.

Tuttavia, dovrei pensare che ci siano molti modi per visualizzare dati come l'attrito. Il mio primo pensiero, guardando il tuo grafico, è che potrebbe essere rappresentato con un diagramma a punti . Esistono anche altre possibilità. La funzionalità extra del diagramma di Sankey entrerà in gioco quando hai un po 'di attrito a causa di una causa particolare in un punto, e poi più a causa della stessa causa in seguito con altri ingressi e uscite in mezzo. Sarebbe più complicato rappresentare con grafici standard (è anche più difficile da seguire anche con un diagramma di Sankey - ad esempio, quello in cima alla pagina richiede parecchio lavoro da leggere). Dal momento che non sembra che tu lo abbia, il diagramma di Sankey sembra essere carino, ma eccessivo.

Che ne dici di usare il codice R per scrivere un file SVG con le larghezze delle frecce impostate in base ai tuoi dati e un layout semplice. Quindi carica in Inkscape e piega le frecce intorno, aggiungi etichette ecc. Ecc. Al contenuto del tuo cuore per rendere qualcosa di carino.

Problema evidente: è necessario ripetere tutte le impostazioni in Inkscape se i dati cambiano (anche se potresti essere in grado di utilizzare il tuo grazioso SVG da Inkscape come modello e sostituire semplicemente le nuove larghezze delle frecce).

Ma onestamente, se quel pasticcio multicolore di scarabocchi tremolanti in cima è un buon diagramma di Sankey, odio vederne uno cattivo a stomaco pieno [anche se fissarlo per qualche altro minuto mi ha dato un indizio su di cosa si tratta, una buona grafica non dovrebbe averne bisogno].