Ho valori di p da molti test e vorrei sapere se in realtà c'è qualcosa di significativo dopo aver corretto per più test. La complicazione: i miei test non sono indipendenti. Il metodo a cui sto pensando (una variante del metodo del prodotto di Fisher, Zaykin et al., Genet Epidemiol , 2002) necessita della correlazione tra i valori di p.
Al fine di stimare questa correlazione, sto attualmente pensando ai casi di bootstrap, eseguendo le analisi e correlando i vettori risultanti dei valori di p. Qualcuno ha un'idea migliore? O anche un'idea migliore per il mio problema originale (correzione per test multipli in test correlati)?
Contesto: sto logisticamente regredendo se i miei soggetti soffrono o meno di una particolare malattia nell'interazione tra il loro genotipo (AA, Aa o aa) e una covariata. Tuttavia, il genotipo è in realtà un sacco (30-250) di polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), che non sono certamente indipendenti ma in Linkage Disequilibrium.