Mi chiedo cosa significhi questo diagramma di analisi del diagramma di bean


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Come si interpretano e si generano diagrammi di trama bean. Ecco un esempio tratto da Walkes et al. 2010 . Per quale tipo di dati è più utile?

trama di fagioli
(fonte: biomedcentral.com )


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"Un beanplot è un'alternativa al boxplot per il confronto visivo dei dati univariati tra i gruppi. In un beanplot, le singole osservazioni sono mostrate come piccole linee in un diagramma a dispersione unidimensionale. Accanto a questo, è visibile la densità stimata delle distribuzioni e viene mostrata la media ". Estratto preso da qui .

Per chi non lo sapesse: questo è un parente prossimo della trama del violino (vioplot).

Risposte:


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I grafici a scatole sono stati realmente progettati per dati normali o almeno unimodali. Il Beanplot mostra la curva di densità effettiva, che è più istruttiva.

La forma è la densità e le brevi linee orizzontali rappresentano ciascun punto dati. Questo combina il meglio di un diagramma a scatole, un diagramma di densità e un tappeto tutto in uno ed è molto leggibile.

Sfortunatamente, l'esempio che hai scelto ha deciso di aggiungere un mucchio di linee più lunghe che ingombrano il grafico oltre il riconoscimento (per me). [Omissis]

EDIT: dopo aver lavorato un po 'di più con il beanplot, le linee spesse più lunghe sono la media (o facoltativamente mediana) per ciascun bean. Le linee sottili più lunghe sono i dati, con una sorta di "impilamento" in cui le linee più larghe indicano più valori duplicati. (Puoi anche jitter, che preferisco, ma almeno la categoria "normale" ha già una discreta densità di punti che il jitter potrebbe peggiorare.)

Penso ancora che l'esempio che hai scelto sia piuttosto disordinato, che potrebbe forse essere chiarito usando il jittering anziché lo stacking.

Il documento che descrive il pacchetto R per la creazione di grafici di bean è una buona lettura.


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+1: leggi l'articolo sulla trama del bean ora. Vorrei anche suggerire un documento di lavoro di Hadley Wickham, 40 anni di schemi di scatole . Passa attraverso una descrizione di una varietà di grafici con più o meno gli stessi obiettivi dei grafici di fagioli.
Andy W,

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Senza aver letto l'intero documento, sembra essere essenzialmente una variante del diagramma a scatole. Come tale, potresti usarlo dove altrimenti avresti usato un boxplot, come confrontare le distribuzioni univariate di diversi gruppi. Visualizza una linea per ogni punto e sovrappone una stima della densità del kernel. A guardarlo, penso che potrebbe essere più informativo con piccole quantità di dati, ma essere troppo ingombro di più dati. A me non sembra tremare molto la Terra, a prima vista. Se vuoi sapere qualcosa di più, elabora la tua domanda.

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