No, il BIOS non può funzionare senza CPU.
La prima cosa che fa il tuo computer quando lo accendi è controllare che le connessioni tra CPU e RAM siano buone. Questo è un semplice controllo elettrico che tutte le uscite della linea bus sono collegate agli ingressi corretti. Se questo semplice controllo non viene superato, viene visualizzato un codice bip (o eventualmente un display a LED su alcune schede madri). Questo controllo non richiede la CPU, tuttavia senza la CPU presente, è possibile che non si ottengano nemmeno dei segnali acustici, poiché anche questo richiede una certa misura di elaborazione (dipende dalla scheda madre).
Una volta verificate queste cose, tuttavia, la CPU inizia l'esecuzione del programma contenuto nella ROM del BIOS che esegue alcuni controlli di livello superiore (come ad esempio se i tempi di memoria funzionano, se è possibile caricare correttamente firmware aggiuntivo per i dispositivi di bordo, ecc.). Questo programma ROM è scritto in linguaggio assembly x86 e non richiede la CPU per eseguirlo.
Quello che è successo nel tuo caso è che la CPU è elettricamente compatibile con la scheda madre e funziona, ma manca un supporto di funzionalità di basso livello da cui dipende la scheda madre. Forse hai usato una CPU che ha un TDP più alto (genera più calore) di quello che la scheda madre è in grado di gestire, ha più core di quanti il BIOS sappia inizializzare o forse non supporta uno stato di alimentazione che il BIOS sta tentando di impostare. Non hai menzionato quale combo CPU / scheda madre stai usando.
In ogni caso, tuttavia, la CPU fornisce un supporto sufficiente al BIOS da poter eseguire i programmi memorizzati nella sua ROM (incluso lo spostamento dei byte dentro e fuori dalla memoria video). Non può andare oltre.
Probabilmente sta solo controllando la famiglia e facendo passare gli ID dal processore a un elenco interno di tipi di CPU supportati. In molti casi, questo può essere corretto con un aggiornamento del BIOS. Ma prima devi inserire una CPU supportata per farla lampeggiare.