TL; DR: arresta correttamente il sistema.
L'ibernazione non ha nulla a che fare con lo spegnimento, è strettamente correlato alla sospensione su RAM (sleep) tranne che con il contenuto della RAM spinto sul disco per poterlo rileggere e riprendere l'operazione esattamente da dove era stato interrotto il sistema .
Se si desidera che le modifiche persistano, è necessario disabilitare l'ibernazione e Windows Fastboot (che è un sottoinsieme dell'ibernazione). In alternativa, è possibile riavviare anziché ibernare e riavviare.
Il motivo per cui le modifiche non sono persistenti è perché non sono ancora state scritte sul disco, tranne nel file di ibernazione. Che stai eliminando, il che significa che potrebbe essere necessario che il filesystem si ripari da solo e torni allo stato "ultimo bene noto".
Mentre il sistema è ibernato, ci saranno diverse strutture chiave del filesystem che potrebbero non essere state scritte su disco e che invece si trovano nella RAM. Al momento della ripresa dalla modalità di sospensione, il sistema si aspetta che il disco si trovi in uno stato molto particolare ed è possibile che le cache del disco e i file di sistema importanti vengano salvati nel file di sospensione piuttosto che sul disco effettivo.
Se si esegue un arresto corretto, Windows scaricherà correttamente la memoria di lavoro su disco, quindi smonterà il disco in modo pulito prima di spegnerlo.
Per forzare un arresto corretto, aprire un prompt dei comandi e digitare
shutdown /s /f /t 0
/s
è "spegnimento", /f
per forzare e /t 0
per indicare "ora" (tempo = 0 secondi)
Oppure puoi semplicemente disabilitare l'avvio rapido e l'ibernazione.
Maggiori informazioni su HowtoGeek: lo spegnimento non arresta completamente Windows 10 (ma il riavvio sì)
Relativamente a te che stai facendo un arresto forzato, il problema è che Windows non è sicuro di scrivere alcuna modifica sul disco nello stesso millisecondo (o persino minuto) in cui apporti la modifica. Quasi sicuramente sarà scritto entro pochi minuti, ma la probabilità che sia stato effettivamente scritto aumenterà nel tempo. È improbabile che venga scritto immediatamente, quindi vicino al momento in cui si apporta la modifica la probabilità aumenta nettamente e sarà quasi sicuramente scritta entro un'ora.
Il fatto è che forzando un arresto forzato non si dà al sistema la possibilità di scrivere in modo sicuro le modifiche sul disco.
I filesystem più moderni sono scritti per apportare modifiche nel modo più sicuro possibile. In passato sono stati definiti "atomici", come nel caso del cambiamento o è avvenuto o no.
Oggi noi li conosciamo come file system imperniata perché tengono un registro delle operazioni che si accadere che può essere sia ritornato o laminati in avanti in caso di guasto del sistema e riavviare. All'avvio da un'interruzione di corrente, il sistema controlla il journal e per ogni transazione verifica se i dati del file effettivo vengono scritti sul disco ed è "buono". Se è allora la transazione rotola in avanti e viene completata, altrimenti torna ai vecchi dati.
Usando questo ordine il disco è quasi sempre in uno stato facile da riparare.
Ma costringendo il tuo sistema a spegnersi inaspettatamente non puoi garantire se la transazione è progredita abbastanza lontano da andare avanti al momento della riparazione, e ci sono possibilità che un sistema operativo come Linux non si preoccupi tanto di Windows della cronologia delle transazioni ed è più probabile piuttosto che apportare modifiche che ruotano tutto all'indietro anziché in avanti.
Se hai riavviato Windows, potrebbe provare o essere in grado di riparare correttamente il disco in quanto ha una conoscenza più intima del filesystem.