Sto creando un database locale per l'annotazione genica seguendo le istruzioni in questa pagina . Forniscono un file .sql per creare alcune strutture di tabelle MySQL (passaggio 4) e diversi file di dati per popolare le tabelle (passaggi 5-7). Ho completato il processo di installazione attraverso il passaggio 5, ma sto ricevendo errori al passaggio 6. Ciò che è snervante è che l'errore che ottengo è diverso in base alla directory da cui eseguo il mysqlimport
comando.
standage@farnsworth:~$ mysqlimport -u wendel2go -p --fields-terminated-by='\t' b2g Desktop/gene2accession
Enter password:
mysqlimport: Error: 13, Can't get stat of '/var/lib/mysql/Desktop/gene2accession' (Errcode: 2), when using table: gene2accession
standage@farnsworth:~$ cd Desktop/
standage@farnsworth:~/Desktop$ mysqlimport -u wendel2go -p --fields-terminated-by='\t' b2g gene2accession
Enter password:
mysqlimport: Error: 29, File '/var/lib/mysql/b2g/gene2accession' not found (Errcode: 2), when using table: gene2accession
Non ottengo risultati molto istruttivi quando cerco su Google questo errore. Qualche idea?