problema con l'installazione RODBC in Ubuntu

Ho un problema con alcune intestazioni mancanti quando provo ad installare RODBC in R sul mio Linux. Qualcuno può aiutarmi con questo problema?

> install.packages("RODBC")

Installing package(s) into ‘/home/administrator/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12’
(as ‘lib’ is unspecified)

trying URL 'http://cran.cnr.Berkeley.edu/src/contrib/RODBC_1.3-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1108358 bytes (1.1 Mb)

opened URL
==================================================
downloaded 1.1 Mb

* installing *source* package ‘RODBC’ ...
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables... 
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ANSI C... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for egrep... grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking sql.h usability... no
checking sql.h presence... no
checking for sql.h... no
checking sqlext.h usability... no
checking sqlext.h presence... no
checking for sqlext.h... no
configure: error: "ODBC headers sql.h and sqlext.h not found"
ERROR: configuration failed for package ‘RODBC’
* removing ‘/home/administrator/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/RODBC’
Warning in install.packages :
  installation of package 'RODBC' had non-zero exit status

The downloaded packages are in
    ‘/tmp/RtmpqfNYpD/downloaded_packages’

Come ha detto Dirk nei commenti, se hai già installato r-cran-rodbc, non è necessario eseguire install.packages () dall'interno di R. "library (RODBC)" dovrebbe caricare il pacchetto.

Più in generale, quando vengono visualizzati errori relativi alle intestazioni, è perché non è installata una libreria di sviluppo richiesta. La soluzione è cercare nel Web usando i nomi dei file di intestazione mancanti ( ad es. Google per "sqlext.h ubuntu"), per identificare il pacchetto richiesto. In questo caso, è necessario libiodbc2-dev. Così:

sudo apt-get install libiodbc2-dev

Quindi l'installazione all'interno di R dovrebbe funzionare.

Hai davvero bisogno di costruire dalla fonte? Perché non usi il pacchetto binario?

Quindi forse prova questo invece:

  sudo apt-get install r-cran-rodbc

o utilizzare uno qualsiasi dei frontend GUI per il sistema di gestione dei pacchetti.

Dopo aver tentato di installare pacchetti da tutte le soluzioni su questo sito e altri, sono riuscito a creare il RODBCpacchetto usando:

sudo apt-get install unixodbc unixodbc-dev

Ho anche installato:

• libiodbc2-dev
• libmyodbc
• ODBC postgresql

FWIW, ho avuto lo stesso problema ("intestazioni ODBC sql.h e sqlext.h non trovate") su OS X e risolto installando unixodbc ( brew install unixodbc)

RODBC dipende da R (> = 3.0.0 (vedere ad esempio https://cran.r-project.org/web/packages/RODBC/RODBC.pdf )

La tua libreria di pacchetti locale ...

Installing package(s) into '/home/administrator/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12'

... suggerisce che potresti avere una versione precedente di R installata (2.12). In questo caso, prova a passare a una versione recente di R.

Ho avuto anche questo problema. Per me la soluzione era che mi mancavano alcune dipendenze di Ubuntu come

• unixodbc (> = 2.2.11)
• libmyodbc
• ODBC postgresql

E 'degno di nota che install.packages("RODBC", dependencies=TRUE)fa non raccogliere queste pacchetti. Giacciono fuori di Rsé.