Visualizzazione di immagini DICOM con GIMP

Ho l'ultima versione se GIMP è in grado di aprire le immagini DICOM, ma le immagini non sono chiare e non ricostruite correttamente. Esiste un plug-in specifico che mi può aiutare?

window gimp

— Sarat
fonte

Hai un file di esempio che potresti caricare su un servizio di condivisione file? (pubblica un link qui). Puoi pubblicare piccoli estratti di schermate che illustrano chiaramente come GIMP lo mostra e come dovrebbe essere?

— RedGrittyBrick il

Questa potrebbe essere una buona fonte di immagini di esempio per gli screenshot , dal momento che sospetto che le immagini dicom effettivamente in uso dovrebbero e saranno in qualche modo confidenziali. Ricordo MOLTO vagamente di aver usato questo visualizzatore dicom anni fa - a causa della mia ruvidezza nell'argomento, lo lascerò come esercizio all'OP per aggiungere schermate

— Journeyman Geek

Hai una voce "file-dicom" quando apri GIMP e vai su File / Preferenza / Cartella / plugin? Dovrebbe essere integrato, ma se non lo è, puoi trovare il plugin "file-dicom" qui .

— amiregelz,

Anch'io ho questo problema. Penso che parte del problema sia che i valori dei pixel consentiti da DICOM sono troppo grandi per essere gestiti da GIMP. Ad esempio, quando carico un'immagine dicom in OpenCV, ogni pixel richiede un U16int, mentre l'immagine tipica richiede solo un U8int. Non sono ancora sicuro di quale soluzione sarebbe ...

— Selah,

Risposte:

Potresti voler usare MicroDicom , esegue correttamente la ricostruzione. Hai anche una funzione di windowing.

— Michael S.
fonte

Di solito vado per MicroDicom ma questa volta ho scoperto che GIMP ha un'opzione integrata per visualizzare immagini DICOM ma non perfetta però

— sarat

Sospetto che GIMP supporti solo un sottoinsieme limitato delle specifiche DICOM. Ecco cosa vorrei provare:

$ gdcmconv --raw --force input.dcm output.dcm

Ciò convertirà l'input input.dcmDICOM con possibilmente una rappresentazione della sintassi del trasferimento incapsulato in un elemento Pixel Data grezzo più convenzionale .

Se non ti fidi di GDCM per eseguire la conversione, puoi invece provare:

$ gdcminfo input.dcm

Questo ti fornirà le informazioni importanti sulla tua istanza DICOM. Una volta che sei sicuro che questo stia utilizzando una delle sintassi di trasferimento compresse, puoi utilizzare DCMTK per eseguire la decompressione. Per la famiglia JPEG dovresti usare:

$ dcmdjpeg input.dcm output.dcm

E così via e così via per JPEG-LS e RLE (ovvero: dcmdjpls e dcmdrle).

— Malat
fonte