Perdita di memoria invisibile su Linux - Ubuntu Server (non cache / buffer del disco!)

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Riepilogo agosto 2015

Si prega di notare, questo sta ancora accadendo. Questo non è correlato a linuxatemyram.com - la memoria non viene utilizzata per cache / buffer del disco. Ecco come appare in NewRelic: il sistema perde tutta la memoria, utilizza tutto lo spazio di scambio e quindi si arresta in modo anomalo. In questa schermata ho riavviato il server prima che si arrestasse in modo anomalo:

inserisci qui la descrizione dell'immagine

È impossibile identificare l'origine della perdita utilizzando gli strumenti comuni dello spazio utente. Ora c'è una chat room per discutere di questo problema: http://chat.stackexchange.com/rooms/27309/invisible-memory-leak-on-linux

L'unico modo per recuperare la memoria "mancante" sembra essere il riavvio del server. Questo è stato un problema di vecchia data riprodotto in Ubuntu Server 14.04, 14.10 e 15.04.

Superiore

L'uso della memoria non viene visualizzato in alto e non può essere recuperato nemmeno dopo aver ucciso quasi tutti i processi (esclusi elementi come i processi del kernel e ssh). Guarda i campi "Memoria cache", "buffer" e "liberi" in alto, non stanno esaurendo la memoria, la memoria utilizzata è "mancante" e irrecuperabile senza riavvio.

Il tentativo di utilizzare questa memoria "mancante" provoca lo scambio del server, il rallentamento della scansione e infine il blocco.

root@XanBox:~# top -o +%MEM
top - 12:12:13 up 15 days, 20:39,  3 users,  load average: 0.00, 0.06, 0.77
Tasks: 126 total,   1 running, 125 sleeping,   0 stopped,   0 zombie
%Cpu(s):  0.1 us,  0.2 sy,  0.0 ni, 99.7 id,  0.0 wa,  0.1 hi,  0.0 si,  0.0 st
KiB Mem:   2,040,256 total,  1,881,228 used,    159,028 free,     1,348 buffers
KiB Swap:  1,999,868 total,     27,436 used,  1,972,432 free.    67,228 cached Mem

  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
11502 root      20   0  107692   4252   3240 S   0.0  0.2   0:00.06 sshd: deployer [priv]
11336 root      20   0  107692   4248   3240 S   0.0  0.2   0:00.06 sshd: deployer [priv]
11841 root      20   0  107692   4248   3240 S   0.0  0.2   0:00.06 sshd: deployer [priv]
11301 root      20   0   26772   3436   2688 S   0.7  0.2   0:01.30 /usr/sbin/openvpn --writepid /var/run/openvpn.zanview.com.pid --status /var/run/openvpn.zanview.com.status 10 --cd /etc/openvpn --config /etc/openvpn/z+
11385 deployer  20   0   19972   2392   1708 S   0.0  0.1   0:00.03 -bash
11553 deployer  20   0   19972   2388   1708 S   0.0  0.1   0:00.03 -bash
11890 deployer  20   0   19972   2388   1708 S   0.0  0.1   0:00.02 -bash
11889 deployer  20   0  108008   2280    944 S   0.0  0.1   0:00.25 sshd: deployer@pts/3
12009 root      20   0   18308   2228   1608 S   0.0  0.1   0:00.09 -su
12114 root      20   0   18308   2192   1564 S   0.0  0.1   0:00.04 -su
12007 root      20   0   67796   2136   1644 S   0.0  0.1   0:00.01 sudo su -
12112 root      20   0   67796   2136   1644 S   0.0  0.1   0:00.01 sudo su -
12008 root      20   0   67376   2016   1528 S   0.0  0.1   0:00.01 su -
12113 root      20   0   67376   2012   1528 S   0.0  0.1   0:00.01 su -
    1 root      20   0   33644   1988    764 S   0.0  0.1   2:29.77 /sbin/init
11552 deployer  20   0  107692   1952    936 S   0.0  0.1   0:00.07 sshd: deployer@pts/2
11384 deployer  20   0  107692   1948    936 S   0.0  0.1   0:00.06 sshd: deployer@pts/0
12182 root      20   0   20012   1516   1012 R   0.7  0.1   0:00.08 top -o +%MEM
 1152 message+  20   0   39508   1448    920 S   0.0  0.1   1:40.01 dbus-daemon --system --fork
 1791 root      20   0  279832   1312    816 S   0.0  0.1   1:16.18 /usr/lib/policykit-1/polkitd --no-debug
 1186 root      20   0   43736    984    796 S   0.0  0.0   1:13.07 /lib/systemd/systemd-logind
 1212 syslog    20   0  256228    688    184 S   0.0  0.0   1:41.29 rsyslogd
 5077 root      20   0   25324    648    520 S   0.0  0.0   0:34.35 /usr/sbin/hostapd -B -P /var/run/hostapd.pid /etc/hostapd/hostapd.conf
  336 root      20   0   19476    512    376 S   0.0  0.0   0:07.40 upstart-udev-bridge --daemon
  342 root      20   0   51228    468    344 S   0.0  0.0   0:00.85 /lib/systemd/systemd-udevd --daemon
 1097 root      20   0   15276    364    256 S   0.0  0.0   0:06.39 upstart-file-bridge --daemon
 4921 root      20   0   61364    364    240 S   0.0  0.0   0:00.05 /usr/sbin/sshd -D
  745 root      20   0   15364    252    180 S   0.0  0.0   0:06.51 upstart-socket-bridge --daemon
 4947 root      20   0   23656    168    100 S   0.0  0.0   0:14.70 cron
11290 daemon    20   0   19140    164      0 S   0.0  0.0   0:00.00 atd
  850 root      20   0   23420     80     16 S   0.0  0.0   0:11.00 rpcbind
  872 statd     20   0   21544      8      4 S   0.0  0.0   0:00.00 rpc.statd -L
 4880 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty4
 4883 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty5
 4890 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty2
 4891 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty3
 4894 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty6
 4919 root      20   0    4368      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 acpid -c /etc/acpi/events -s /var/run/acpid.socket
 5224 root      20   0   24048      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /usr/sbin/rpc.mountd --manage-gids
 6160 root      20   0   14540      4      0 S   0.0  0.0   0:00.00 /sbin/getty -8 38400 tty1
    2 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   0:03.44 [kthreadd]
    3 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   1:04.63 [ksoftirqd/0]
    5 root       0 -20       0      0      0 S   0.0  0.0   0:00.00 [kworker/0:0H]
    7 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0  16:03.32 [rcu_sched]
    8 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   4:08.79 [rcuos/0]
    9 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   4:10.42 [rcuos/1]
   10 root      20   0       0      0      0 S   0.0  0.0   4:30.71 [rcuos/2]

Hardware

Finora l'ho osservato su 3 server su circa 100 (anche se altri potrebbero essere interessati). Uno è un Intel Atom D525 a 1,8 Ghz e l'altro 2 sono Core2Duo E4600 e Q6600. Uno utilizza un controller JMicron Technology Corp. JMC250 PCI Express Gigabit Ethernet, gli altri utilizzano Qualcomm Atheros Attansic L1 Gigabit Ethernet (rev b0).

Ho eseguito lshw sui server dei problemi e su un server OK di esempio. Server problematici: http://pastie.org/10370534 http://pastie.org/10370537 e http://pastie.org/10370541 - OK Server: http://pastie.org/10370544

Applicazione

Questa è un'applicazione completamente senza testa. Non è collegato alcun monitor e in effetti non è installato alcun XServer. Questo dovrebbe escludere i driver / problemi di grafica.

Il server viene utilizzato per eseguire il proxy e analizzare i video RTSP utilizzando live555ProxyServer, ffmpeg e openCV. Questi server eseguono un traffico intenso perché si tratta di un'applicazione TVCC: http://pastie.org/9558324

Ho provato entrambe le versioni trunk più vecchie e più recenti di live555, ffmpeg e openCV senza modifiche. Ho anche provato a usare opencv attraverso i moduli python2 e python3, nessuna modifica.

Lo stesso software / configurazione esatta è stato caricato su quasi 100 server, fino ad ora 3 sono confermati per la perdita di memoria. I server perdono lentamente e furtivamente attorno a xMB (uno che perde 8 MB, uno è più lento, uno è più veloce) all'ora fino a quando tutti i ram sono spariti, i server iniziano a scambiarsi pesantemente, rallentano a una ricerca per indicizzazione e richiedono un riavvio.

meminfo

Ancora una volta, puoi vedere la cache e i buffer che non consumano molta memoria. Anche le HugePage sono disabilitate, quindi non è questo il colpevole.

root@XanBox:~# cat /proc/meminfo
MemTotal:          2,040,256 kB
MemFree:             159,004 kB
Buffers:               1,348 kB
Cached:               67,228 kB
SwapCached:            9,940 kB
Active:               10,788 kB
Inactive:             81,120 kB
Active(anon):          1,900 kB
Inactive(anon):       21,512 kB
Active(file):          8,888 kB
Inactive(file):       59,608 kB
Unevictable:               0 kB
Mlocked:                   0 kB
SwapTotal:         1,999,868 kB
SwapFree:          1,972,432 kB
Dirty:                     0 kB
Writeback:                 0 kB
AnonPages:            14,496 kB
Mapped:                8,160 kB
Shmem:                    80 kB
Slab:                 33,472 kB
SReclaimable:         17,660 kB
SUnreclaim:           15,812 kB
KernelStack:           1,064 kB
PageTables:            3,992 kB
NFS_Unstable:              0 kB
Bounce:                    0 kB
WritebackTmp:              0 kB
CommitLimit:       3,019,996 kB
Committed_AS:         94,520 kB
VmallocTotal: 34,359,738,367 kB
VmallocUsed:         535,936 kB
VmallocChunk: 34,359,147,772 kB
HardwareCorrupted:         0 kB
AnonHugePages:             0 kB
HugePages_Total:           0
HugePages_Free:            0
HugePages_Rsvd:            0
HugePages_Surp:            0
Hugepagesize:          2,048 kB
DirectMap4k:          62,144 kB
DirectMap2M:       2,025,472 kB

Uscita libera

Free mostra quanto segue (nota che la cache e i buffer sono entrambi bassi, quindi non si tratta di cache del disco o buffer!) - la memoria non è recuperabile senza un riavvio: 

root@XanBox:~# free -m
             total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:         1,992      1,838        153          0          1         66

Se sottraggiamo / aggiungiamo i buffer / cache a Usato e Gratuito, vediamo:

  • 1.772 MB realmente utilizzati (- buffer / cache) = 1.838 MB utilizzati - buffer da 1 MB - cache da 66 MB
  • 220 MB davvero gratuiti (+ buffer / cache) = 154 MB gratuiti + buffer da 1 MB + 66 MB di cache

Esattamente come ci aspettiamo:

-/+ buffers/cache:      1,772        220

Quindi circa 1,7 GB non sono utilizzati dallo spazio utente e in effetti vengono utilizzati dal kernel poiché il sistema attualmente utilizza 53,7 MB (vedere l'output PS Mem di seguito).

Sono sorpreso dalla quantità di commenti che pensano che vengano utilizzati 1,7 GB per la memorizzazione nella cache / buffer - questo è fondamentalmente la lettura errata dell'output! - questa riga indica la memoria utilizzata esclusi buffer / cache , vedere linuxatemyram.com per i dettagli.

Uscita PS

Ecco un elenco completo dei processi in esecuzione ordinati per memoria:

# ps -e -o pid,vsz,comm= | sort -n -k 2
    2      0 kthreadd
    3      0 ksoftirqd/0
    5      0 kworker/0:0H
    7      0 rcu_sched
    8      0 rcuos/0
    9      0 rcuos/1
   10      0 rcuos/2
   11      0 rcuos/3
   12      0 rcu_bh
   13      0 rcuob/0
   14      0 rcuob/1
   15      0 rcuob/2
   16      0 rcuob/3
   17      0 migration/0
   18      0 watchdog/0
   19      0 watchdog/1
   20      0 migration/1
   21      0 ksoftirqd/1
   23      0 kworker/1:0H
   24      0 watchdog/2
   25      0 migration/2
   26      0 ksoftirqd/2
   28      0 kworker/2:0H
   29      0 watchdog/3
   30      0 migration/3
   31      0 ksoftirqd/3
   32      0 kworker/3:0
   33      0 kworker/3:0H
   34      0 khelper
   35      0 kdevtmpfs
   36      0 netns
   37      0 writeback
   38      0 kintegrityd
   39      0 bioset
   41      0 kblockd
   42      0 ata_sff
   43      0 khubd
   44      0 md
   45      0 devfreq_wq
   46      0 kworker/0:1
   47      0 kworker/1:1
   48      0 kworker/2:1
   50      0 khungtaskd
   51      0 kswapd0
   52      0 ksmd
   53      0 khugepaged
   54      0 fsnotify_mark
   55      0 ecryptfs-kthrea
   56      0 crypto
   68      0 kthrotld
   70      0 scsi_eh_0
   71      0 scsi_eh_1
   92      0 deferwq
   93      0 charger_manager
   94      0 kworker/1:2
   95      0 kworker/3:2
  149      0 kpsmoused
  155      0 jbd2/sda1-8
  156      0 ext4-rsv-conver
  316      0 jbd2/sda3-8
  317      0 ext4-rsv-conver
  565      0 kmemstick
  770      0 cfg80211
  818      0 hd-audio0
  853      0 kworker/2:2
  953      0 rpciod
  PID    VSZ
 1714      0 kauditd
11335      0 kworker/0:2
12202      0 kworker/u8:2
20228      0 kworker/u8:0
25529      0 kworker/u9:1
28305      0 kworker/u9:2
29822      0 lockd
 4919   4368 acpid
 4074   7136 ps
 6681  10232 dhclient
 4880  14540 getty
 4883  14540 getty
 4890  14540 getty
 4891  14540 getty
 4894  14540 getty
 6160  14540 getty
14486  15260 upstart-socket-
14489  15276 upstart-file-br
12009  18308 bash
12114  18308 bash
12289  18308 bash
 4075  19008 sort
11290  19140 atd
14483  19476 upstart-udev-br
11385  19972 bash
11553  19972 bash
11890  19972 bash
29503  21544 rpc.statd
 2847  23384 htop
  850  23420 rpcbind
29588  23480 rpc.idmapd
 4947  23656 cron
29833  24048 rpc.mountd
 5077  25324 hostapd
11301  26912 openvpn
    1  37356 init
 1152  39508 dbus-daemon
14673  43452 systemd-logind
14450  51204 systemd-udevd
 4921  61364 sshd
12008  67376 su
12113  67376 su
12288  67376 su
12007  67796 sudo
12112  67796 sudo
12287  67796 sudo
11336 107692 sshd
11384 107692 sshd
11502 107692 sshd
11841 107692 sshd
11552 108008 sshd
11889 108008 sshd
 1212 256228 rsyslogd
 1791 279832 polkitd
 4064 335684 whoopsie

Ecco un elenco completo di tutti i processi in esecuzione:

root@XanBox:~# ps aux
USER       PID %CPU %MEM    VSZ   RSS TTY      STAT START   TIME COMMAND
root         1  0.0  0.0  33644  1988 ?        Ss   Jul21   2:29 /sbin/init
root         2  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:03 [kthreadd]
root         3  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:04 [ksoftirqd/0]
root         5  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kworker/0:0H]
root         7  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21  16:03 [rcu_sched]
root         8  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   4:08 [rcuos/0]
root         9  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   4:10 [rcuos/1]
root        10  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   4:30 [rcuos/2]
root        11  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   4:28 [rcuos/3]
root        12  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcu_bh]
root        13  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcuob/0]
root        14  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcuob/1]
root        15  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcuob/2]
root        16  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [rcuob/3]
root        17  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:13 [migration/0]
root        18  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:08 [watchdog/0]
root        19  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:07 [watchdog/1]
root        20  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:13 [migration/1]
root        21  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:03 [ksoftirqd/1]
root        23  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kworker/1:0H]
root        24  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:07 [watchdog/2]
root        25  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:23 [migration/2]
root        26  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:01 [ksoftirqd/2]
root        28  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kworker/2:0H]
root        29  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:07 [watchdog/3]
root        30  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:23 [migration/3]
root        31  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:03 [ksoftirqd/3]
root        32  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kworker/3:0]
root        33  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kworker/3:0H]
root        34  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [khelper]
root        35  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kdevtmpfs]
root        36  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [netns]
root        37  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [writeback]
root        38  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kintegrityd]
root        39  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [bioset]
root        41  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kblockd]
root        42  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [ata_sff]
root        43  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [khubd]
root        44  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [md]
root        45  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [devfreq_wq]
root        46  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21  18:51 [kworker/0:1]
root        47  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kworker/1:1]
root        48  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:14 [kworker/2:1]
root        50  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:01 [khungtaskd]
root        51  0.4  0.0      0     0 ?        S    Jul21  95:51 [kswapd0]
root        52  0.0  0.0      0     0 ?        SN   Jul21   0:00 [ksmd]
root        53  0.0  0.0      0     0 ?        SN   Jul21   0:28 [khugepaged]
root        54  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [fsnotify_mark]
root        55  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [ecryptfs-kthrea]
root        56  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [crypto]
root        68  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kthrotld]
root        70  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [scsi_eh_0]
root        71  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [scsi_eh_1]
root        92  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [deferwq]
root        93  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [charger_manager]
root        94  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:05 [kworker/1:2]
root        95  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:08 [kworker/3:2]
root       149  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kpsmoused]
root       155  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   3:39 [jbd2/sda1-8]
root       156  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [ext4-rsv-conver]
root       316  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   1:28 [jbd2/sda3-8]
root       317  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [ext4-rsv-conver]
root       336  0.0  0.0  19476   512 ?        S    Jul21   0:07 upstart-udev-bridge --daemon
root       342  0.0  0.0  51228   468 ?        Ss   Jul21   0:00 /lib/systemd/systemd-udevd --daemon
root       565  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [kmemstick]
root       745  0.0  0.0  15364   252 ?        S    Jul21   0:06 upstart-socket-bridge --daemon
root       770  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [cfg80211]
root       818  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [hd-audio0]
root       850  0.0  0.0  23420    80 ?        Ss   Jul21   0:11 rpcbind
root       853  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kworker/2:2]
statd      872  0.0  0.0  21544     8 ?        Ss   Jul21   0:00 rpc.statd -L
root       953  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul21   0:00 [rpciod]
root      1097  0.0  0.0  15276   364 ?        S    Jul21   0:06 upstart-file-bridge --daemon
message+  1152  0.0  0.0  39508  1448 ?        Ss   Jul21   1:40 dbus-daemon --system --fork
root      1157  0.0  0.0  23480     0 ?        Ss   Jul21   0:00 rpc.idmapd
root      1186  0.0  0.0  43736   984 ?        Ss   Jul21   1:13 /lib/systemd/systemd-logind
syslog    1212  0.0  0.0 256228   688 ?        Ssl  Jul21   1:41 rsyslogd
root      1714  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [kauditd]
root      1791  0.0  0.0 279832  1312 ?        Sl   Jul21   1:16 /usr/lib/policykit-1/polkitd --no-debug
root      4880  0.0  0.0  14540     4 tty4     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty4
root      4883  0.0  0.0  14540     4 tty5     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty5
root      4890  0.0  0.0  14540     4 tty2     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty2
root      4891  0.0  0.0  14540     4 tty3     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty3
root      4894  0.0  0.0  14540     4 tty6     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty6
root      4919  0.0  0.0   4368     4 ?        Ss   Jul21   0:00 acpid -c /etc/acpi/events -s /var/run/acpid.socket
root      4921  0.0  0.0  61364   364 ?        Ss   Jul21   0:00 /usr/sbin/sshd -D
root      4947  0.0  0.0  23656   168 ?        Ss   Jul21   0:14 cron
root      5077  0.0  0.0  25324   648 ?        Ss   Jul21   0:34 /usr/sbin/hostapd -B -P /var/run/hostapd.pid /etc/hostapd/hostapd.conf
root      5192  0.0  0.0      0     0 ?        S    Jul21   0:00 [lockd]
root      5224  0.0  0.0  24048     4 ?        Ss   Jul21   0:00 /usr/sbin/rpc.mountd --manage-gids
root      6160  0.0  0.0  14540     4 tty1     Ss+  Jul21   0:00 /sbin/getty -8 38400 tty1
root      6681  0.0  0.0  10232     0 ?        Ss   11:07   0:00 dhclient -1 -v -pf /run/dhclient.eth0.pid -lf /var/lib/dhcp/dhclient.eth0.leases eth0
root      9452  0.0  0.0      0     0 ?        S    11:28   0:00 [kworker/u8:1]
root      9943  0.0  0.0      0     0 ?        S    11:42   0:00 [kworker/u8:0]
daemon   11290  0.0  0.0  19140   164 ?        Ss   11:59   0:00 atd
root     11301  0.2  0.1  26772  3436 ?        Ss   12:00   0:01 /usr/sbin/openvpn --writepid /var/run/openvpn.zanview.com.pid --status /var/run/openvpn.zanview.com.status 10 --cd /etc/openvpn --config /etc/openvpn/zanvie
root     11335  0.0  0.0      0     0 ?        S    12:01   0:00 [kworker/0:2]
root     11336  0.0  0.2 107692  4248 ?        Ss   12:01   0:00 sshd: deployer [priv]
deployer 11384  0.0  0.0 107692  1948 ?        S    12:01   0:00 sshd: deployer@pts/0
deployer 11385  0.0  0.1  19972  2392 pts/0    Ss+  12:01   0:00 -bash
root     11502  0.0  0.2 107692  4252 ?        Ss   12:01   0:00 sshd: deployer [priv]
deployer 11552  0.0  0.0 107692  1952 ?        S    12:01   0:00 sshd: deployer@pts/2
deployer 11553  0.0  0.1  19972  2388 pts/2    Ss   12:01   0:00 -bash
root     11841  0.0  0.2 107692  4248 ?        Ss   12:02   0:00 sshd: deployer [priv]
deployer 11889  0.0  0.1 108008  2280 ?        S    12:02   0:00 sshd: deployer@pts/3
deployer 11890  0.0  0.1  19972  2388 pts/3    Ss   12:02   0:00 -bash
root     12007  0.0  0.1  67796  2136 pts/3    S    12:02   0:00 sudo su -
root     12008  0.0  0.0  67376  2016 pts/3    S    12:02   0:00 su -
root     12009  0.0  0.1  18308  2228 pts/3    S+   12:02   0:00 -su
root     12112  0.0  0.1  67796  2136 pts/2    S    12:08   0:00 sudo su -
root     12113  0.0  0.0  67376  2012 pts/2    S    12:08   0:00 su -
root     12114  0.0  0.1  18308  2192 pts/2    S    12:08   0:00 -su
root     12180  0.0  0.0  15568  1160 pts/2    R+   12:09   0:00 ps aux
root     25529  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Jul28   0:09 [kworker/u9:1]
root     28305  0.0  0.0      0     0 ?        S<   Aug05   0:00 [kworker/u9:2]

Uscita Mem PS

Ho anche provato ps_mem.py da https://github.com/pixelb/ps_mem

root@XanBox:~/ps_mem# python ps_mem.py
 Private  +   Shared  =  RAM used   Program

144.0 KiB +   9.5 KiB = 153.5 KiB   acpid
172.0 KiB +  29.5 KiB = 201.5 KiB   atd
248.0 KiB +  35.0 KiB = 283.0 KiB   cron
272.0 KiB +  84.0 KiB = 356.0 KiB   upstart-file-bridge
276.0 KiB +  84.5 KiB = 360.5 KiB   upstart-socket-bridge
280.0 KiB + 102.5 KiB = 382.5 KiB   upstart-udev-bridge
332.0 KiB +  54.5 KiB = 386.5 KiB   rpc.idmapd
368.0 KiB +  91.5 KiB = 459.5 KiB   rpcbind
388.0 KiB + 251.5 KiB = 639.5 KiB   systemd-logind
668.0 KiB +  43.5 KiB = 711.5 KiB   hostapd
576.0 KiB + 157.5 KiB = 733.5 KiB   systemd-udevd
676.0 KiB +  65.5 KiB = 741.5 KiB   rpc.mountd
604.0 KiB + 163.0 KiB = 767.0 KiB   rpc.statd
908.0 KiB +  62.5 KiB = 970.5 KiB   dbus-daemon [updated]
932.0 KiB + 117.0 KiB =   1.0 MiB   getty [updated] (6)
  1.0 MiB +  69.5 KiB =   1.1 MiB   openvpn
  1.0 MiB + 137.0 KiB =   1.2 MiB   polkitd
  1.5 MiB + 202.0 KiB =   1.7 MiB   htop
  1.4 MiB + 306.5 KiB =   1.7 MiB   whoopsie
  1.4 MiB + 279.0 KiB =   1.7 MiB   su (3)
  1.5 MiB + 268.5 KiB =   1.8 MiB   sudo (3)
  2.2 MiB +  11.5 KiB =   2.3 MiB   dhclient
  3.9 MiB + 741.0 KiB =   4.6 MiB   bash (6)
  5.3 MiB + 254.5 KiB =   5.5 MiB   init
  2.7 MiB +   3.3 MiB =   6.1 MiB   sshd (7)
 18.1 MiB +  56.5 KiB =  18.2 MiB   rsyslogd
---------------------------------
                         53.7 MiB
=================================

Uscita Slabtop

Ho anche provato slabtop:

root@XanBox:~# slabtop -sc
 Active / Total Objects (% used)    : 131306 / 137558 (95.5%)
 Active / Total Slabs (% used)      : 3888 / 3888 (100.0%)
 Active / Total Caches (% used)     : 63 / 105 (60.0%)
 Active / Total Size (% used)       : 27419.31K / 29580.53K (92.7%)
 Minimum / Average / Maximum Object : 0.01K / 0.21K / 8.00K

  OBJS ACTIVE  USE OBJ SIZE  SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME
  8288   7975  96%    0.57K    296       28      4736K inode_cache
 14259  12858  90%    0.19K    679       21      2716K dentry
  2384   1943  81%    0.96K    149       16      2384K ext4_inode_cache
 20916  20494  97%    0.11K    581       36      2324K sysfs_dir_cache
   624    554  88%    2.00K     39       16      1248K kmalloc-2048
   195    176  90%    5.98K     39        5      1248K task_struct
  6447   6387  99%    0.19K    307       21      1228K kmalloc-192
  2128   1207  56%    0.55K     76       28      1216K radix_tree_node
   768    761  99%    1.00K     48       16       768K kmalloc-1024
   176    155  88%    4.00K     22        8       704K kmalloc-4096
  1100   1100 100%    0.63K     44       25       704K proc_inode_cache
  1008   1008 100%    0.66K     42       24       672K shmem_inode_cache
  2640   2262  85%    0.25K    165       16       660K kmalloc-256
   300    300 100%    2.06K     20       15       640K sighand_cache
  5967   5967 100%    0.10K    153       39       612K buffer_head
  1152   1053  91%    0.50K     72       16       576K kmalloc-512
  3810   3810 100%    0.13K    127       30       508K ext4_allocation_context
    60     60 100%    8.00K     15        4       480K kmalloc-8192
   225    225 100%    2.06K     15       15       480K idr_layer_cache
  7616   7324  96%    0.06K    119       64       476K kmalloc-64
   700    700 100%    0.62K     28       25       448K sock_inode_cache
   252    252 100%    1.75K     14       18       448K TCP
  8925   8544  95%    0.05K    105       85       420K shared_policy_node
  3072   2351  76%    0.12K     96       32       384K kmalloc-128
   360    360 100%    1.06K     12       30       384K signal_cache
   432    337  78%    0.88K     24       18       384K mm_struct

Altro

Ho anche provato a cercare un rootkit con rkhunter - non ha trovato nulla. E ho provato a sincronizzare e scaricare la cache con:

sync; sync; sync; echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches

Anche non ha fatto differenza.

Ho anche provato a forzare lo scambio o disabilitare lo scambio con:

sudo sysctl -w vm.swappiness=100
sudo swapoff /dev/sda2

Ho anche provato a utilizzare htop e l'ordinamento per memoria e non mostra neanche dove sta andando la memoria. La versione del kernel è Linux 3.13.0-40-generic # 69-Ubuntu SMP.

Uscita Dmesg: http://pastie.org/9558255 uscita smem: http://pastie.org/9558290

Conclusione

Cosa sta succedendo? - Dove sta andando tutto il ricordo? - Come lo scopro?

linux  ubuntu  memory 
— Hackeron
fonte
2
— Colin Pickard,
Stai leggendo l'output errato - La cache IO è solo 65, non 1771 ...
— Hackeron
1
@ user50300: linuxnix.com/2013/05/find-ram-size-in-linuxunix.html Mem usato - (buffer + cache) = ram usato dalle app.
— Frank Thomas,
@FrankThomas Ho provato tutto questo, per favore leggi la mia domanda più attentamente.
— Hackeron,
2
Prova a vedere se qualche processo non ha rilasciato correttamente la memoria:sync && sudo echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches
— Hastur

Risposte:

7

La mia conclusione è che si tratta di una perdita di memoria del kernel da qualche parte nel kernel di Linux, ecco perché nessuno degli strumenti di userspace è in grado di mostrare dove viene fatta trapelare memoria. Forse è collegato a questa domanda: /server/670423/linux-memory-usage-higher-than-sum-of-processes

Ho aggiornato la versione del kernel da 3.13 a 3.19 e sembra che la perdita di memoria si sia fermata! - Riporterò indietro se vedo di nuovo una perdita.

Sarebbe comunque utile avere un modo semplice / più semplice per vedere quanta memoria viene utilizzata per le diverse parti del kernel Linux. È ancora un mistero ciò che stava causando la perdita in 3.13.

— Hackeron
fonte
2

Storia

Posso riprodurre il tuo problema usando ZFS su Linux .

Ecco un server chiamato node51con 20GBRAM. Ho contrassegnato la 16GiBRAM come allocabile alla cache adattiva sostitutiva ZFS (ARC) :

root@node51 [~]# echo 17179869184 > /sys/module/zfs/parameters/zfs_arc_max
root@node51 [~]# grep c_max /proc/spl/kstat/zfs/arcstats
c_max                           4    17179869184

Quindi, ho letto un 45GiBfile usando Pipe Viewer nel mio pool ZFS zeltikper riempire l'ARC:

root@node51 [~]# pv /zeltik/backup-backups/2014.04.11.squashfs > /dev/zero
  45GB 0:01:20 [ 575MB/s] [==================================>] 100%

Ora guarda la memoria libera:

root@node51 [~]# free -m
             total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:         20013      19810        203          1         51         69
-/+ buffers/cache:      19688        324
Swap:         7557          0       7556

Guarda!

51MiBnei buffer
69MiBnella cache
120MiBin entrambi i
19688MiBRAM in uso, inclusi i buffer e la cache
19568MiBdella RAM in uso, esclusi i buffer e la cache

Lo script Python a cui hai fatto riferimento indica che le applicazioni utilizzano solo una piccola quantità di RAM:

root@node51 [~]# python ps_mem.py
 Private  +   Shared  =  RAM used       Program

148.0 KiB +  54.0 KiB = 202.0 KiB       acpid
176.0 KiB +  47.0 KiB = 223.0 KiB       swapspace
184.0 KiB +  51.0 KiB = 235.0 KiB       atd
220.0 KiB +  57.0 KiB = 277.0 KiB       rpc.idmapd
304.0 KiB +  62.0 KiB = 366.0 KiB       irqbalance
312.0 KiB +  64.0 KiB = 376.0 KiB       sftp-server
308.0 KiB +  89.0 KiB = 397.0 KiB       rpcbind
300.0 KiB + 104.5 KiB = 404.5 KiB       cron
368.0 KiB +  99.0 KiB = 467.0 KiB       upstart-socket-bridge
560.0 KiB + 180.0 KiB = 740.0 KiB       systemd-logind
724.0 KiB +  93.0 KiB = 817.0 KiB       dbus-daemon
720.0 KiB + 136.0 KiB = 856.0 KiB       systemd-udevd
912.0 KiB + 118.5 KiB =   1.0 MiB       upstart-udev-bridge
920.0 KiB + 180.0 KiB =   1.1 MiB       rpc.statd (2)
  1.0 MiB + 129.5 KiB =   1.1 MiB       screen
  1.1 MiB +  84.5 KiB =   1.2 MiB       upstart-file-bridge
960.0 KiB + 452.0 KiB =   1.4 MiB       getty (6)
  1.6 MiB + 143.0 KiB =   1.7 MiB       init
  5.1 MiB +   1.5 MiB =   6.5 MiB       bash (3)
  5.7 MiB +   5.2 MiB =  10.9 MiB       sshd (8)
 11.7 MiB + 322.0 KiB =  12.0 MiB       glusterd
 27.3 MiB +  99.0 KiB =  27.4 MiB       rsyslogd
 67.4 MiB + 453.0 KiB =  67.8 MiB       glusterfsd (2)
---------------------------------
                        137.4 MiB
=================================

19568MiB - 137.4MiB ≈ 19431MiB di RAM non contabilizzata

Spiegazione

I 120MiBbuffer e la cache utilizzati che hai visto nella storia sopra spiegano il comportamento efficiente del kernel di memorizzazione nella cache dei dati inviati o ricevuti da un dispositivo esterno.

La prima riga, etichettata Mem , mostra l'utilizzo della memoria fisica, inclusa la quantità di memoria allocata a buffer e cache. Un buffer, chiamato anche memoria buffer , viene generalmente definito come una porzione di memoria che viene messa da parte come luogo di conservazione temporaneo per i dati inviati o ricevuti da un dispositivo esterno, come un disco rigido, una tastiera, una stampante o una rete.

La seconda riga di dati, che inizia con - / + buffer / cache , mostra la quantità di memoria fisica attualmente dedicata alla cache del buffer di sistema . Ciò è particolarmente significativo per quanto riguarda i programmi applicativi, poiché tutti i dati a cui accedono i file sul sistema che vengono eseguiti mediante l'uso delle chiamate di sistema read () e write () passano attraverso questa cache. Questa cache può velocizzare notevolmente l'accesso ai dati riducendo o eliminando la necessità di leggere o scrivere sull'HDD o su un altro disco.

Fonte: http://www.linfo.org/free.html

Ora, come possiamo spiegare i dispersi 19431MiB?

In free -muscita sopra, il 19688MiB" usato " in " - / + buffers / cache " viene da questa formula:

(kb_main_used) - (buffers_plus_cached) =
(kb_main_total - kb_main_free) - (kb_main_buffers + kb_main_cached)

kb_main_total:   MemTotal from /proc/meminfo
kb_main_free:    MemFree  from /proc/meminfo
kb_main_buffers: Buffers  from /proc/meminfo
kb_main_cached:  Cached   from /proc/meminfo

Fonte: procps / free.c e procps / proc / sysinfo.c

(Se fai i numeri in base al mio free -moutput, noterai che 2MiBnon sono stati presi in considerazione, ma ciò è dovuto agli errori di arrotondamento introdotti da questo codice #define S(X) ( ((unsigned long long)(X) << 10) >> shift):)

Nemmeno i numeri si sommano /proc/meminfo(non ho registrato /proc/meminfoquando sono stato eseguito free -m, ma possiamo vedere dalla tua domanda che /proc/meminfonon mostra dove si trova la RAM mancante), quindi possiamo concludere da quanto sopra che /proc/meminfonon racconta tutta la storia.

Nelle mie condizioni di test, so come controllo che ZFS su Linux è responsabile dell'elevato utilizzo della RAM. Ho detto al suo ARC che poteva usare fino alla 16GiBRAM del server.

ZFS su Linux non è un processo. È un modulo del kernel.

Da quello che ho trovato finora, l'utilizzo della RAM di un modulo del kernel non verrebbe mostrato usando gli strumenti di informazioni di processo perché il modulo non è un processo.

Risoluzione dei problemi

Sfortunatamente, non so abbastanza su Linux per offrirti un modo per costruire un elenco di quanti componenti RAM non processati (come il kernel e i suoi moduli) stanno usando.

A questo punto, possiamo speculare, indovinare e controllare.

Hai fornito un dmesgrisultato. Moduli del kernel ben progettati registrerebbero alcuni dei loro dettagli dmesg.

Dopo aver guardato attraverso dmesg, un oggetto mi è emerso:FS-Cache

FS-Cachefa parte del cachefilesmodulo del kernel e si riferisce al pacchetto cachefilesdsu Debian e Red Hat Enterprise Linux.

Forse qualche tempo fa, è stato configurato FS-Cachesu un disco RAM per ridurre l'impatto dell'I / O di rete mentre il server analizza i dati video.

Prova a disabilitare eventuali moduli del kernel sospetti che potrebbero consumare RAM. Probabilmente possono essere disabilitati con blacklistin /etc/modprobe.d/, seguito da un sudo update-initramfs -u(i comandi e le posizioni possono variare a seconda della distribuzione Linux).

Conclusione

Una perdita di memoria sta esaurendo la 8MB/hrtua RAM e non rilascerà la RAM, apparentemente non importa quello che fai. Non sono stato in grado di determinare l'origine della perdita di memoria in base alle informazioni fornite dall'utente, né sono stato in grado di offrire un modo per trovare tale perdita di memoria.

Qualcuno che ha più esperienza con Linux di me dovrà fornire input su come possiamo determinare dove sta andando "l'altro" utilizzo della RAM.

Ho iniziato una generosità su questa domanda per vedere se possiamo ottenere una risposta migliore di "speculare, indovinare e controllare".

— Deltik
fonte
Grazie per quello e grazie per la generosità! Solo una nota, non ho abilitato la memorizzazione nella cache, il flusso video viene analizzato dal vivo e non esiste alcuna memoria di rete (nessun NFS, nessun SMB, FS_Cache non viene utilizzato e non ho cachefilesd installato). Ho provato a guardare tutti i moduli del kernel caricati e scaricare qualcosa di inutilizzato che non mi ha aiutato :( - Sospetto che forse la perdita sia nel driver di rete o qualcosa del genere - ma immagino sia il mio che la tua domanda è come risolvere questo problema al di fuori delle ipotesi .
— Hackeron
1

Modifichi manualmente lo Swapiness del tuo kernel o lo disabiliti?

puoi apprezzare il tuo attuale livello di swap

cat /proc/sys/vm/swappiness

Potresti provare a forzare il tuo kernel a scambiarsi in modo aggressivo

sudo sysctl -w vm.swappiness=100

se questo calo, i problemi riscontrano un valore compreso tra 1 e 100, in base alle proprie esigenze.

— Chris
fonte
lo swappiness non ha nulla a che fare con esso - anche se disattivo completamente lo swap, ho ancora una situazione in cui ho ucciso tutti i processi dell'utente e ancora tutta la memoria è esaurita.
— Hackeron,
-2

Non hai ragione - sì, il tuo comando –m mostra 220 MB gratuiti ma mostra anche che 1771 MB viene utilizzato come buffer. Buffer e cache è la memoria utilizzata dal kernel per ottimizzare l'accesso ai dati ad accesso lento, generalmente dischi. Quindi dovresti considerare tutta la memoria contrassegnata come buffer come memoria libera perché il kernel può recuperarla ogni volta che è necessario.

Vedi: /server/23433/in-linux-what-is-the-difference-b Between - buffers - and - cache - reported - by - the - f

— Paolo
fonte
Ho aggiornato la risposta per tenerne conto. Mi dispiace dire che stai fondamentalmente fraintendendo l'output del comando "free".
— Hackeron,
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