Personalmente non ho avuto problemi. Ho ridimensionato i miei dischi usando gparted, ntfs e fat32 ed ext4. Circa 8-10 volte fino ad ora. Dovrebbe essere sicuro, altrimenti vedresti problemi come "gparted ha rotto il mio disco" in tutto il web.
A mio modo di vedere, non sarebbe nella distribuzione di Ubuntu se non stesse facendo il suo lavoro al 99%. È un programma consolidato con un buon programmatore, ben mantenuto e supportato regolarmente (chiudendo / correggendo i bug). :)
Naturalmente, se hai paura di perdere i tuoi dati, puoi sempre acquistare o chiedere a qualcuno di prestarti un disco rigido, USB o SATA, in modo da poter prima eseguire il backup dei tuoi dati importanti.
Come menzionato nei commenti, usa un livecd con gparted (es. Ubuntu 12.04 livecd), lascia che faccia il suo lavoro e non interferire. Inoltre, non eseguire molti passaggi come processo batch (non mettere molte cose da fare nella coda gparted). Falli uno per uno e premi applica.
C'è solo una situazione rischiosa, se il potere si abbassa, secondo il commento di Anwar:
Non esiste una garanzia del 99,99%. Un'interruzione improvvisa dell'alimentazione può anche causare una grande piastra metallica, senza usi. Si noti inoltre che: Per quanto ne so, tutti gli strumenti di partizionamento sono pericolosi. Avvertono sempre i loro utenti a riguardo