Ho cercato questa domanda e non ho ancora ottenuto una risposta ragionevole. Se sincronizzo una cartella, sincronizzerà un collegamento simbolico? Elaborerà completamente attraverso il collegamento a tutti i file all'interno di quel collegamento simbolico?

Dalle domande frequenti su Ubuntu One :

Ubuntu One supporta collegamenti simbolici o collegamenti reali?

No, Ubuntu One non supporta attualmente collegamenti simbolici o collegamenti reali. Se stai utilizzando Ubuntu 10.04 LTS o superiore, puoi sincronizzare le cartelle all'interno della tua home directory facendo clic con il tasto destro su di esse e selezionando "Sincronizza su Ubuntu One".

Soluzione alternativa: è possibile creare il collegamento reale in una cartella diversa; successivamente sposta questo hard link appena creato nella tua cartella Ubuntu One. Ho provato questo in un terminale e ha funzionato, quindi immagino che tu possa anche scrivere una sceneggiatura e usarla come script nautilus.