Una volta installata la libreria geos (C ++ e C), e quindi tentando di installare il pacchetto rgeos (R), segnala la mancanza di geos-config!


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Sapendo che il pacchetto rgeos, dal linguaggio R, richiede una precedente installazione di librerie geos, ho installato sia libgeos che libgeos-c1 (3.2.2), usando il programma di installazione synaptic nella mia macchina Ubuntu 12.04 (32 bit).

Quindi ho provato a installare rgeos direttamente dalla console R, e ha emesso un messaggio nel senso che geos-config non è stato trovato. L'output è il seguente:

> install.packages("rgeos")
Installing package(s) into ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependency ‘sp’

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/sp_1.0-9.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 882102 bytes (861 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 861 Kb

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/rgeos_0.2-19.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 221471 bytes (216 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 216 Kb

* installing *source* package ‘sp’ ...
** package ‘sp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c R    centroid.c -o Rcentroid.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c gcdist.c -o gcdist.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c init.c -o init.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip.c -o pip.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip2.c -o pip2.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c sp_xports.c -o sp_xports.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c surfaceArea.c -o surfaceArea.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c zerodist.c -o zerodist.o
gcc -std=gnu99 -shared -o sp.so Rcentroid.o gcdist.o init.o pip.o pip2.o sp_xports.o surfaceArea.o zerodist.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/sp/libs
** R
** data
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   ‘intro_sp.Rnw’ 
   ‘over.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded

* DONE (sp)
* installing *source* package ‘rgeos’ ...
** package ‘rgeos’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: gcc -std=gnu99
configure: CXX: g++
configure: rgeos: 0.2-17
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 394
checking geos-config usability... 
./configure: line 1385: geos-config: command not found
no
configure: error: geos-config not usable
ERROR: configuration failed for package ‘rgeos’
* removing ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/rgeos’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rgeos’ had non-zero exit status

Perdona la mia ignoranza, ma non so da dove provenga questo file, "geos-config": dovrebbe essere generato dalle compilation gcc sopra o dovrebbe essere installato in precedenza quando le librerie di libgeos sono state installate?

Ho appreso, da un'altra macchina, che "geos-config" è un eseguibile e che dovrebbe essere installato in / usr / bin.

Hai idea di cosa non va nella mia procedura?

Grazie,

-Sergio.

Risposte:


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Installa il pacchetto libgeos-devInstalla libgeos-dev con il tuo gestore pacchetti preferito (o centro software) e avrai /usr/bin/geos-config.

Come ho trovato questo? Ho usato la query geos-configper i file sulla http://packages.ubuntu.com/ pagina web. Questo elencherà il pacchetto necessario ( link query ). Usalo la prossima volta che incontri problemi simili!


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Puoi anche usare il simpatico strumento apt-fileper cercare i file nel repository di Ubuntu. Per esempio. apt-file search geos-configti darà una corrispondenza esatta a libgeos-dev.
ortang

Grazie! Ho fatto come mi hai raccomandato e anche il pacchetto R "rgeos" è stato installato senza problemi.
JulioSergio,

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Poiché l'OP non nomina una distribuzione specifica, ecco la linea di cui avevo bisogno per installare va-config su CENTOS (ad esempio, RHEL e Amazon Linux): yum install -y geos-devel

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