Come installare numpy e scipy per Python?

Sono stanco di provare a installare numpy e scipy per phyton 2.7.5, ho bisogno di questa versione di Python perché il mio obiettivo finale è installare class ( http://class-code.net/ ) e montepython ( http: // montepython .net / ).

(Ho Ubuntu 12.04)

Quando ho provato a importare numpy o scipy ricevo ogni volta il seguente errore:

$ phyton2.7
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined        symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

>> import scipy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/__init__.py", line 78, in <module>
  from numpy import show_config as show_numpy_config
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

Per eliminare l'errore avevo provato:

1. Soddisfa i requisiti di Python: $ sudo apt-get install build-essential python-dev gfortran
2. Installa con apt-get: $ sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-matplotlib ipython ipython-notebook python-pandas python-sympy python-nose
3. Requisiti di installazione con pip: $ sudo pip install requests
4. ... e ho provato a installare con pip: $ sudo pip install numpye$ sudo pip install scipy
5. Ho già l'ambiente var: export PYTHONPATH=/usr/lib/python2.7/dist-packages:${PYTHONPATH} l'ultima volta che ho installato numpy e scipy (nella vecchia versione di Ubuntu 10.x) ha funzionato per me.

6. sudo sh -c "wget http://python-distribute.org/distribute_setup.py -O- | python" sudo sh -c "wget https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py -O- | python" e quindi installarli entrambi con pip come in (4)

   Ma ora sembra che il server di python-distribute.org non sia attivo . Ho ricevuto il seguente errore:

   http://python-distribute.org/distribute_setup.py
   Resolving python-distribute.org (python-distribute.org)... failed: Name or service not known.
   wget: unable to resolve host address `python-distribute.org'

7. Avevo anche provato a installare numpy e scipy dal centro software synaptic e Ubuntu

Avevo fallito in ciascuno di questi tentativi e ora non so cosa fare. Mi sto perdendo qualcosa? Come posso ottenere numpy e scipy installati correttamente per Python? Ogni idea sarà apprezzata.

quando io faccio

echo $PYTHONPATH

ottengo

/usr/lib/python2.7/dist-packages

Ok, seguiamo la guida all'installazione :

1. Dice che hai bisogno di Python 2.7 (che hai già):

   $ python --version
   Python 2.7.4

2. Quindi dice che è necessario anche il pacchetto numpy, versione> = 1.4.1:

   politica apt-cache python-numpy
   python-numpy:
   Installato: (nessuno)
   Candidato: 1: 1.7.1-1ubuntu1
   Tabella delle versioni:
    1: 1.7.1-1ubuntu1 0
       500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring / main pacchetti amd64

   Come puoi vedere, ho disponibile la versione numpy 1.7.1, quindi procediamo con l'installazione:

   sudo apt-get install python-numpy

3. Ora dice che abbiamo bisogno di cython, controlliamo se quel pacchetto è disponibile:

   politica di apt-cache cython
   Cython:
   Installato: (nessuno)
   Candidato: 0.17.4-0ubuntu1
   Tabella delle versioni:
    0.17.4-0ubuntu1 0
       500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring / main pacchetti amd64

   Lo abbiamo, lo installiamo:

   sudo apt-get install cython

   Si prega di notare che ci sono altri pacchetti che dipendono anche dall'installazione.

4. Stranamente, abbiamo anche bisogno del modulo scipy:

   sudo apt-get install python-scipy

5. Test . Apri Python in un terminale e digita quanto segue:

   $ python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) 
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> import numpy
   >>> import scipy
   >>> import cython
   >>> exit()

   Quanto sopra, deve essere senza errori. Se qualcosa è andato storto, vai su e leggi di nuovo la guida, hai dimenticato / saltato un passaggio.

6. Scaricando i sorgenti di CLASS dalla loro pagina, vai alla directory nel terminale e decomprimilo e fallo:

   cd dove / the / tar / è
   tar zxf class_v2.0.2.tar.gz
   cd class_v2.0.2
   rendere

   Qui aspetteremo fino al completamento. Una volta fatto questo, andiamo nella directory di Python e iniziamo la magia. Senza spostarti dalle directory esegui questo:

   cd python
   build di python setup.py
   python setup.py install --user

   Ora abbiamo CLASS installato nella nostra directory utente. Dovremmo testarlo!

   python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26)
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> from classy import Class
   >>> exit()

   Fino a qui è tutto bello e avvolgente.

7. Ora è la verità, scarica tarball monthypython nella tua directory di codice:

   cd ~
   codice mkdir
   codice cd
   wget https://www.dropbox.com/s/l7mnhwsktp1m8b5/montepython_v1.2.5.tar.bz2?dl=1 -O montepython_v1.2.5.tar.bz2
   tar jxf montepython_v1.2.5.tar.bz2

   Nelle istruzioni di installazione ci sono alcune note che non sono rilevanti in questo caso particolare (una nuova installazione) ma può essere importante quando aggiorni montepython.

8. Questo cambiamento è importante. Ricordi dove hai installato CLASS? Ora dovresti dire a Monte Python dov'è. Nel mio caso /home/braiam/src/class_v2.0.2/class, il tuo potrebbe essere diverso. Puoi usarlo findper cercarlo:

   find ~ -name class -print

   Bene, ora modifico il default.conffile usando quello che vuoi (userò nano) e modifico il rootpercorso, quindi il file completo sarà simile a:

   # Fill in the relevant path to your personal distribution. 
   # If you create a new file out of this one, please remember to call
   # MontePython.py with the option '-conf my.conf'
   
   # At minimum, this file should contain one line:
   # ** path['cosmo'] =  path to the cosmological code you are using. Note, if you are
   # using a modified version of class, be sure that the path contains the word
   # class, otherwise the code might not recognise it.
   
   # If you want to use a data folder different from the one present in the folder
   # you are executing the code, please also add:
   # ** path['data']  =  /path/to/the/other/data/
   
   root = '/home/braiam/src/class_v2.0.2/'
   
   path['cosmo']           = root+'/class/'

   Salva il file ed esci.

9. Prova montepython! Se tutto andava bene, dovresti essere in grado di eseguire code/MontePython.py --helpnella tua directory montepythong e tutto dovrebbe funzionare:

   ~ / src / montepython $ code / MontePython.py --help
   utilizzo: MontePython.py [-h] [-N numero di passaggi] [-o cartella di output]
                     [-p input param file] [-c input cov matrix]
                     [-j metodo di salto] [-f fattore di salto]
                     [-conf configuration file] [-chain_number chain number]
                     [-r restart from chain] [-bf restart from best fit file]
                     [-info [informazioni di calcolo del file desiderato [informazioni di calcolo del file desiderato ...]]]
                     [-bins numero desiderato di bin, il valore predefinito è 20] [-no_mean]
                     [-comp cartella di confronto]
                     [-extra plot file per esigenze personalizzate] [-noplot] [-all]
                     [-ext extension extension per il file di output]
                     [-fontsize dimensione del carattere desiderata, il valore predefinito è 15]
                     [-ticksize ticksize desiderato, il valore predefinito è 13]
   
   Monte Python, un codice Monte Carlo in Python
   
   
   argomenti opzionali:
   -h, --help mostra questo messaggio di aiuto ed esce
   -N numero di passaggi
   -o cartella di output
   -p file param di input
   -c matrice cov di input
   -j metodo di salto
   -f fattore di salto
   -conf file di configurazione
   -chain_number numero catena
   -r riavvio dalla catena
   -bf si riavvia dal file più adatto
   -info [informazioni di calcolo del file desiderato [informazioni di calcolo del file desiderato ...]]
   -bins numero desiderato di bin, il valore predefinito è 20
   -nessun significato
   -comp cartella di confronto
   -extra trama per esigenze personalizzate
   -noplot
   -tutti
   -ext estensione dell'estensione per il file di output
   -fontsize dimensione del carattere desiderata, il valore predefinito è 15
   -ticksize ticksize desiderato, il valore predefinito è 13

Con questo, hai Montepython installato e pronto a partire!