Installa R nella mia directory

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Come posso installare una nuova versione di R nella mia directory, ad es /local/data/project/behi.

software-installation not-root-user

— user3925736
fonte

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Potresti riuscire a farlo partendo dalla fonte; ma se devi chiedere, immagino che non lo farai. Comunicaci quale sistema stai utilizzando e perché sei interessato a una nuova versione.

— vonbrand,

L'installazione specifica della versione che utilizza il codice sorgente è molto diversa dall'installazione che utilizza YUM o APT. Dipende dalla versione del sistema operativo e dal numero di dipendenze che devono essere soddisfatte per il completamento dell'installazione. Ho documentato l'installazione di R 3.3.3 su SLES11 SP3 in hashprompt.blogspot.com/2017/06/… Spero che possa esserti utile per l'installazione su sistemi Linux.

— Baban Gaigole il

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Il modo più semplice per farlo è installare R dall'origine :

$ wget http://cran.rstudio.com/src/base/R-3/R-3.4.1.tar.gz
$ tar xvf R-3.4.1.tar.gz
$ cd R-3.4.1
$ ./configure --prefix=$HOME/R
$ make && make install

Il penultimo passo è quello critico. Configura R per l'installazione in una sottodirectory della propria directory home.

Per eseguirlo su Linux, macOS e sistemi simili, aggiungi $HOME/R/binal tuo PATH. Quindi, i comandi della shell gradiranno Re Rscriptfunzioneranno.

Su macOS, hai un'altra alternativa: compilalaR.app e installala nella Applicationscartella privata del tuo utente . È necessario avere Xcode installato per fare questo.

Potresti considerare di dare --prefix=$HOMEinvece. Questo installa R al livello più alto della tua home directory, in modo che i binari Re Rscriptfiniscano $HOME/bin, che è probabilmente già nel tuo utente PATH. Il rovescio della medaglia è che rende più difficile la successiva disinstallazione, poiché R si mescolerebbe tra gli altri $HOMEcontenuti.

(Se questa è la prima cosa su cui hai installato $HOME/bin, potresti dover disconnetterti e riconnetterti per ottenerlo nel tuo PATH, poiché spesso viene aggiunto in modo condizionale solo se $HOME/binesiste al momento dell'accesso.)

Questo schema generale si applica a una grande quantità di software Unix che è possibile installare dal codice sorgente. Se il software ha uno configurescript, probabilmente comprende l' --prefixopzione e, in caso contrario, di solito esiste un'alternativa con lo stesso effetto.

Queste funzionalità sono comuni per una serie di motivi. In ordine decrescente di probabilità, nella mia esperienza:

Il default sicuro ( /usr/local) non è giusto $prefixin tutte le situazioni. Le circostanze potrebbero dettare qualcosa di diverso, come /usr, /opt/$PKGNAMEecc
I sistemi di creazione di pacchetti binari ( RPM , DEB , PKG , Cygport ...) in genere creano e installano il pacchetto in una directory di gestione temporanea speciale, quindi impacchettalo in modo tale che si espanda nella posizione di installazione desiderata.
Il tuo caso, in cui non riesci roota installare il software in una posizione tipica, quindi esegui $HOMEinvece l' installazione .

— Warren Young
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Consiglierei ./configure --prefix=$HOME/R --enable-R-shlibdi compilare la libreria condivisa R. Altrimenti, RStudio si lamenterà.

— akhmed,

Non mi ha funzionato. La sceneggiatura è terminata con

configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.

— ApproachingDarknessFish

@ApproachingDarknessFish: non ha nulla a che fare con questa domanda o la mia risposta. Ti mancano i prerequisiti necessari per costruire R sul tuo sistema con le opzioni scelte. In particolare qui, ti mancano le librerie di sviluppo readline. Se hai più problemi, pubblica una nuova domanda.

— Warren Young,

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È inoltre possibile utilizzare l'applicazione wrapper Renv .

estratto

Gestione versione R semplice: Renv

Renv ti consente di passare facilmente tra più versioni di R. È semplice, discreto e segue la tradizione UNIX di strumenti monouso che fanno bene una cosa.

Renv fa ...

Consente di modificare la versione R globale in base all'utente.

Fornire supporto per le versioni R per progetto.

Consentire di sostituire la versione R con una variabile di ambiente.

— slm
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Costruisci dalla fonte con ./configure --prefix=/local/data/project/behi ; make ; make install

Se stai installando da un pacchetto RPM ed è stato creato trasferibile, puoi usarlo

rpm ... --prefix /local/data/project/behi

Ma non tutti i pacchetti sono compilati con binari rilocabili e non credo che i pacchetti debian abbiano questa opzione (anche se potresti avere successo dpkg --instdir).

— Dani_l
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