Apt gestisce le dipendenze tra i pacchetti installati dai suoi repository o *.debfile. Tuttavia, che dire del software che gli utenti hanno compilato e installato dal sorgente ./configure && make && make installsenza prima creare un .debfile? È possibile che Apt possa rimuovere i pacchetti necessari per tali software? L'installazione del software dalla fonte /opto /usr/localfarebbe la differenza?