Confronto fianco a fianco di più di due file contenenti valori numerici


8

Ho tre file contenenti una sequenza ordinata di numeri, uno per riga:

file1

1
2
3

file2

1
3
4

file3

1
5

Voglio "allineare" questi tre file fianco a fianco come il seguente:

file1  file2  file3
1      1      1
2      
3      3
       4
              5

Ho provato con sdiffma funziona solo con 2 file


Test diff3?
Costas,

@Costas diff3non ha quel formato di output.
Kusalananda

@Costas Sì, ho provato con diff3e come affermato correttamente da @Kusalananda, non produce quell'output. Inoltre, sto cercando una soluzione generica (per n file, n> 2)
cheseaux,

Se si confronta riga per riga, perché 5nella quinta riga risulta invece la terza?
Costas,

Non confronto riga per riga
cheseaux l'

Risposte:


6

È possibile elaborare ciascun file e stampare una riga con alcuni caratteri, ad esempio Xper ogni numero mancante nella sequenza 1- max (dove max è l'ultimo numero in quel file), pastei risultati quindi sostituiscono quel carattere con spazio:

paste \
<(awk 'BEGIN{n=1};{while (n<$1) {print "X";n++}};{n=$1+1};1' file1) \
<(awk 'BEGIN{n=1};{while (n<$1) {print "X";n++}};{n=$1+1};1' file2) \
<(awk 'BEGIN{n=1};{while (n<$1) {print "X";n++}};{n=$1+1};1' file3) \
| tr X ' '

Se manca un certo valore da tutti i file, otterrai delle righe vuote nell'output (in realtà non sono vuote, contengono solo spazi).
Per rimuoverli sostituisci tr X ' ' con sed '/[[:digit:]]/!d;s/X/ /g' Inoltre, se hai bisogno di un'intestazione puoi sempre eseguire prima qualcosa del genere:

 printf '\t%s' file1 file2 file3 | cut -c2-

Ho avuto difficoltà a capire cosa significasse la ;1parte alla fine. Sto usando {print $0}invece un IMHO un po 'meno enigmatico. Comunque, grazie ancora
cheseaux il

5

Una soluzione generale con awk: richiede GNU awk

gawk -v level=0 '
    FNR==1 {level++; head[level]=FILENAME}
    !seen[$1]++ { n++; idx[$1] = n }
    { out[idx[$1]][level] = $1 }
    END {
        for (j=1; j<=level; j++) {
            printf "%s\t", head[j]
        }
        print ""
        for (i=1; i<=n; i++) {
            for (j=1; j<=level; j++) {
                printf "%s\t", out[i][j]
            }
            print ""
        }
    }
' file{1,2,3,4}
file1   file2   file3   file4   
1   1   1       
2           2   
3   3           
    4       4   
        5       
            6   

Ha adottato un approccio diverso e più semplice a questo sulla base del commento di Don:

gawk '
    FNR==1 { printf "%s\t", FILENAME }
    { seen[$1][FILENAME] = $1 } 
    END {
        print ""
        PROCINFO["sorted_in"]="@ind_num_asc"
        for (i in seen) {
            for (j=1; j<=ARGC; j++) {
                printf "%s\t", seen[i][ARGV[j]]
            } 
            print ""
        }
    }
' file{1,2,3,4}
file1   file2   file3   file4       
    1   1           
            2       
3   3               
    4       4       
5       5           
            6       
7                   

Fatto. Risposta aggiornata
glenn jackman,

3

Una soluzione con bash, join, paste, e di cattivo gusto:

#! /usr/bin/env bash

if [ $# -lt 3 ]; then exit 1; fi

files=( '' "$@" )

declare -a temps
for ((i=0; i<=$#; i++)); do
    [ $i -eq 0 -o -f "${files[$i]}" ] || exit 1
    temps[$i]=$( mktemp -t "${0##*/}"_$$_XXXXXXXX ) || exit 1
done
trap 'rm -f "${temps[@]}"' EXIT HUP INT QUIT TERM

cat "$@" | sort -u >"${temps[0]}"

TAB=$( printf '\t' )
for ((i=1; i<=$#; i++)); do
    join -j1 -a1 -t"$TAB" "${temps[0]}" <(paste "${files[$i]}" "${files[$i]}") | \
        sed "/^[^$TAB]\$/ s/\$/$TAB/" >"${temps[$i]}"
done

printf '%s' ${files[1]}
for ((i=2; i<=$#; i++)); do
    printf '\t%s' ${files[$i]}
    let j=i-1
    let k=i-2
    join -j1 -t"$TAB" "${temps[$j]}" "${temps[$i]}" >"${temps[$k]}"
    cat "${temps[$k]}" >"${temps[$i]}"
done
printf '\n'

cut -d "$TAB" -f 2- <"${temps[$#]}" | sort -n

Tranne l'ultimo sort -n, tutto questo funziona con qualsiasi elemento di testo anziché con i numeri, purché gli elementi non contengano schede (ma TABpossono essere cambiati in qualsiasi altro separatore). Inoltre, potrebbe essere fatto con solo 3 file temporanei e alcune cose in giro (ma ciò aumenterebbe solo il cattivo gusto).

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