Risposte:
C'è un'opzione -nc( --no-clobber) per wget.
Da wget --help:
....
-i, --input-file=FILE download URLs found in local or external FILE.
....
-nc, --no-clobber skip downloads that would download to
existing files.
-c, --continue resume getting a partially-downloaded file.
....
Ho incluso --continueperché sembra che potrebbe essere utile se stai cercando di recuperare da un download interrotto, ma non ti serve per rispondere alla domanda originale.