Come eseguire MPI-3.0 in modalità di memoria condivisa come OpenMP

Sto parallelizzando il codice per risolvere numericamente un modello di bilancio demografico a 5 dimensioni. Attualmente ho un ottimo codice parallelizzato MPICH2 in FORTRAN ma quando aumentiamo i valori dei parametri gli array diventano troppo grandi per essere eseguiti in modalità di memoria distribuita.

Ho accesso a un cluster con 15 nodi, in cui ogni nodo ha due CPU 8 core e 128 GB di RAM. Voglio scrivere eseguire un programma con MPI-3.0 in modalità memoria condivisa in modo che ogni processo non generi la propria copia di ciascun array.

Prima di poter eseguire qualsiasi cosa sul cluster, devo provarlo su un desktop che esegue Ubuntu. È essenzialmente un blade del cluster in quanto ha due CPU a 8 core e 128 GB di RAM. Scriverò e testerò il mio codice su di esso, quindi per favore orienta le tue risposte verso l'esecuzione di programmi sul computer Ubuntu.

Ho letto che esiste un modo per eseguire MPI-3.0 in modalità di memoria condivisa come OpenMP anziché la sua modalità di memoria distribuita predefinita.

Domande:

1. Come dovrò modificare il mio codice? Devo aggiungere chiamate ad altre funzioni MPI come MPI_WIN_ALLOCATE?

2. Come posso compilare il mio codice per eseguire MPI-3.0 in modalità memoria condivisa? Sarà diverso se si trova su più nodi?

Se possibile, fornire script di compilazione di esempio. Ho anche solo compilatori GNU. Il cluster che utilizzo non supporta i compilatori Intel.

Ho anche trovato questo link su Stack Overflow. Giuro di aver cercato domande come le mie per sempre, ma sembra che il modo migliore per cercare una domanda in overflow dello stack sia iniziare a fare una domanda e suggerirà post simili.

Comunque qui è il link che in effetti dice che è possibile eseguire MPI3.0 + in modalità di memoria condivisa come openmp. Ci sono altre fonti che ho trovato che suggeriscono anche e alcune che affermano che puoi ma non spiegare come o dare risorse per capirlo.

/programming/24797298/mpi-fortran-code-how-to-share-data-on-node-via-openmp

Dopo aver seguito i consigli forniti qui in questo link, ho riscontrato problemi nel mettere USE 'mpi_f08' in cima al mio codice. Sto usando gfortran-4.8 che apparentemente non ha attualmente abbastanza supporto FORTRAN2008 per USARE mpi_f08. Probabilmente la persona in questo link stava usando il compilatore Intel fortran 2008. Puoi usare USE mpi che copre abbastanza bene fino a Fortran2003. Tuttavia, non credo che Fortran 2003 abbia le funzioni Type () necessarie per utilizzare le funzioni di accesso alla memoria remota, come MPI_WIN_ALLOCATE_SHARED, quindi non è possibile utilizzarle senza FORTRAN2008. Ma davvero non ho abbastanza risorse per dirlo con certezza, ma ciò che ho trovato lo suggerisce.