Quali domande potrebbe porre uno statistico sull'analisi dell'epidemia di E. coli?


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Potresti aver sentito parlare del recente scoppio enteroemorragico di E. coli ( EHEC ) in Germania .
Quali domande potrebbe porre uno statistico sull'analisi EHEC?
Sto pensando a Q + Tra giornalisti / funzionari pubblici ↔ non esperti, diciamo insegnanti e ingegneri con un Diploma / Master ma al massimo una manciata di statistiche.

(È possibile un'immagine, una mappa della terra dell'EHEC che mostri vari ceppi di EHEC e la copertura di vari test?)

Lunedì 20 giugno: ho pensato che l'epidemia di EHEC sarebbe stata un'area in cui le statistiche contano davvero nel mondo in generale: quali sono le prove di varie cause, come possono essere comunicate al pubblico? Quindi, iniziare una taglia.


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Non sono sicuro che dovrebbe essere wiki della comunità in quanto penso che i voti su buone risposte debbano valere per i rappresentanti, e c'è la possibilità che tu ottenga risposte migliori in tal caso.
Jeromy Anglim,

Risposte:


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Se non hai domande scientifiche a priori a cui desideri / hai bisogno di una risposta, esaminerei la distribuzione spaziale dei casi. In particolare, stimerei una sorta di funzione spaziale di "intensità", ovvero una funzione . Affinché non si adattino eccessivamente ai dati, sarebbe opportuno un po 'di livellamento, che "raggrupperebbe" effettivamente le posizioni vicine insieme. L'approccio più semplice sarebbe usare una funzione di stima della densità del kernel (ad esempio la funzione kde2d in R, anche se potrebbe essere necessaria una pre-elaborazione dei dati). Ciò aiuterebbe a identificare i "punti caldi" nella distribuzione spaziale e potrebbe condurre un investigatore a identificare i serbatoi ambientali di E. Coli.f(s)=E(prevalence| you are in location s)

A seconda di quali altri dati disponi, potrebbero essere utilizzati modelli spaziali più sofisticati che si adattano a confonditori noti.


La diagnosi delle varianti EHEC e delle loro possibili fonti sembra difficile, se non impossibile. Come sapete, i funzionari tedeschi prima hanno detto "sono i cetrioli dalla Spagna", poi settimane dopo "sono sicuramente germogli" (semi, acqua ...?) (Mi rendo conto che molte persone vogliono una risposta istantanea e ne viene servita una.) Con chiari sintomi, una mappa può portare a una causa, come nella famosa mappa dell'epidemia di colera a Londra nel 1854 . Ma la mappa delle epidemie EHEC ?
denis,
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