Stima della variabilità nel tempo

Ho un set di dati che contiene circa 7.500 esami del sangue da circa 2.500 individui. Sto cercando di scoprire se la variabilità negli esami del sangue aumenta o diminuisce con il tempo tra due test. Ad esempio, prelevo il tuo sangue per il test di base, quindi prelevo immediatamente un secondo campione. Sei mesi dopo, disegno un altro campione. Ci si potrebbe aspettare che la differenza tra il basale e i test di ripetizione immediata sia inferiore alla differenza tra il basale e il test di sei mesi.

Ogni punto sulla trama seguente riflette la differenza tra due test. X è il numero di giorni tra due test; Y è la dimensione della differenza tra i due test. Come puoi vedere, i test non sono distribuiti uniformemente lungo X - lo studio non è stato progettato per rispondere a questa domanda, davvero. Dato che i punti sono così fortemente impilati alla media, ho incluso linee quantiche al 95% (blu) e al 99% (rosso), basate su finestre di 28 giorni. Questi sono ovviamente attratti dai punti più estremi, ma hai l'idea.

testo alternativo http://a.imageshack.us/img175/6595/diffsbydays.png

Mi sembra che la variabilità sia abbastanza stabile. Semmai, è più alto quando il test viene ripetuto in un breve periodo - è terribilmente controintuitivo. Come posso affrontarlo in modo sistematico, tenendo conto della variazione di n in ogni momento (e in alcuni periodi senza test)? Le tue idee sono molto apprezzate.

Solo per riferimento, questa è la distribuzione del numero di giorni tra test e test:

testo alternativo http://a.imageshack.us/img697/6572/testsateachtimepoint.png

repeated-measures variability

— Matt Parker
fonte

+1 per un caso reale interessante! puoi aiutarci a capire cos'è un esame del sangue? (come si calcola)

— Robin Girard

C'era un articolo sulla LFT (test di funzionalità epatica) e su come sembrava variare su base ciclica (in mesi). Penso che fosse in Annals of Internal Medicine.

— Ming K,

Certo, brevemente, è un test per l'infezione da tubercolosi latente. Il sangue viene prelevato dal paziente in tre provette: una che non ha antigeni, una che ha selezionato antigeni TB e una che ha mitogeno. Confrontiamo quindi la quantità di risposta immunologica nella provetta senza antigeni con quella con TB - se hanno un forte aumento della risposta nella provetta TB, possono avere TB latente. (La provetta mitogenica serve come controllo per assicurarsi che la persona sia in grado di produrre una risposta immunologica - la maggior parte delle persone ha reazioni molto forti ad essa)

— Matt Parker

Dalla tua descrizione non vedo alcun motivo per distinguere il "test di base" dal "secondo campione" immediatamente disegnato. Sono semplicemente 2 misurazioni di base e la varianza (alla base) può essere calcolata su quella base. Sarebbe meglio tracciare la media delle due misurazioni di base rispetto al terzo campione "di sei mesi".

Il problema è con il campione di 6 mesi. Poiché a questo punto viene prelevato solo un campione, non è possibile stimare la "variabilità" a questo punto, o meglio separare la variazione di campionamento dalla variazione longitudinale (reale) della lettura della TB.

Se consideriamo questo un problema di analisi dei dati longitudinale, probabilmente sceglieremmo un'intercettazione casuale (TB di base) e una pendenza casuale (per adattarsi alla TB di 6 mesi). La variabilità del campionamento sarebbe stimata dalle due misurazioni di base e dalla pendenza dalla terza misura di 6 mesi. Non possiamo stimare la variabilità a 6 mesi senza forti assunzioni distributive sulla chnage in quei sei mesi, come ipotizzare che non vi siano cambiamenti.

— Thylacoleo
fonte