Unix & Linux

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Ho una cartella con molti file (xyz1, xyz2, fino a xyz5025) e ho bisogno di eseguire uno script su ognuno di essi, ottenendo xyz1.faa, xyz2.faa e così via come output. Il comando per un singolo file è: ./transeq xyz1 xyz1.faa -table 11 C'è un modo per farlo automaticamente? Forse una …

19 shell-script text-processing files scripting bioinformatics

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Perché questo script funziona nel terminale ma non da un file?

Ho questo script di shell salvato in un file: fa un po 'di sostituzione di stringa di base. #!/bin/sh html_file=$1 echo "html_file = $html_file" substr=.pdf pdf_file="${html_file/.html/.pdf}" echo "pdf_file = $pdf_file" Se lo incollo nella riga di comando, funziona benissimo: $ html_file="/home/max/for_pauld/test_no_base64.html" echo "html_file = $html_file" substr=.pdf pdf_file="${html_file/.html/.pdf}" echo "pdf_file = …

19 bash string

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come mantenere uno script Python in esecuzione quando chiudo putty

Sto per eseguire uno script Python su Ubuntu su VPS. È un processo di formazione sull'apprendimento automatico, quindi prenditi un sacco di tempo per allenarti. Come posso chiudere lo stucco senza interrompere quel processo.

19 python putty

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Qual è l'ultimo carattere di un file?

Ho appena letto le risposte a "Rimozione di un carattere di nuova riga alla fine di un file" e tutti hanno detto di eliminare l'ultimo carattere. La mia domanda è: non è l'ultimo personaggio?

19 files

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Modo alternativo per uccidere un processo di zombi

Ho appena notato alcuni processi di zombi su CentOS 6.8 (Final), ho provato a ucciderli ma sono ancora lì: [root@host user]# ps -ef | grep git tomcat 746 1 0 Jul18 ? 00:00:00 git clone https://github.com/angular/bower-angular.git -b v1.3.20 --progress . --depth 1 tomcat 747 746 0 Jul18 ? 00:00:00 [git-remote-http] …

19 process kill

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utilizzando più terminali x-windows con una sessione tmux

Di solito lavoro con 2 monitor che non sono perfettamente allineati verticalmente (ho un alimentatore da banco sotto il mio monitor sinistro), ma voglio avere 4 finestre terminali affiancate sui miei schermi che posso scorrere facilmente, in questo modo: Questa disposizione mi rende molto triste perché non riesco facilmente a …

19 terminal tmux

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Perché la "v" in mkfs.vfat?

Ho letto in un articolo di Internet per formattare una partizione in FAT32 con il seguente comando: sudo mkfs.vfat -F 32 /dev/sdXn Ora ho letto la pagina man per mkfs.vfate mostra mkfs.fatcome il nome del comando senza il v. Dopo di che ho provato a formattare una partizione senza ve, …

19 command-line

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Cosa fa `dd if = / dev / zero of = / dev / sda`

Modificato: non eseguirlo per testarlo a meno che non si desideri distruggere i dati. Qualcuno potrebbe aiutarmi a capire cosa ho ottenuto? dd if=/dev/zero of=/dev/sda bs=4096 count=4096 Q: Perché specificamente 4096 per count? dd if=/dev/zero of=/dev/sda bs=512 count=4096 seek=$(expr blockdev --getsz /dev/sda - 4096) D: Cosa fa esattamente questo?

19 udev dd disk

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Bash .hushlogin, mantieni l'ultimo tempo di accesso e host

Nella mia azienda, quando accedo ad alcuni server, vengono visualizzati il mio ultimo accesso e un enorme banner: me@my-laptop$ ssh the-server Last login: Mon Feb 8 18:54:36 2016 from my-laptop.company.com ************************************************************************ * * * C O M P A N Y I N F O R M A T I …

19 bash login motd

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È un approccio sano per "eseguire il backup" della variabile $ IFS?

Sono sempre davvero riluttante a scherzare $IFSperché sta bloccando un globale. Ma spesso rende il caricamento delle stringhe in un array bash piacevole e conciso, e per gli script bash è difficile trovare concisione. Quindi immagino che potrebbe essere meglio di niente se provo a "salvare" il contenuto iniziale $IFSin …

19 bash shell-script

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finestra di ridimensionamento della forza tmux

Di solito mi collego a server Linux remoti da un server Windows specifico (W1). Sul lato Windows, uso Putty e sul lato Linux, avvio TMUX. Occasionalmente, devo usare un server Windows diverso (W2) e connettermi alle stesse sessioni tmux. Problema: se avessi impostato una dimensione per le finestre di stucco …

19 tmux

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bash: come propagare errori nella sostituzione del processo?

Voglio che i miei script di shell falliscano ogni volta che un comando eseguito con loro fallisce. In genere lo faccio con: set -e set -o pipefail (in genere aggiungo set -uanche io ) Il fatto è che nessuna delle precedenti funziona con la sostituzione del processo. Questo codice stampa …

19 bash process-substitution

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Rimontare un disco occupato in modalità di sola lettura

Voglio forzare una partizione del disco in modalità di sola lettura e mantenerla di sola lettura per più di 30 minuti. Cosa ho provato: mount -o remount,ro (partition-identifier) (mount-point) -t (filesystem) Problema : questo dava errore di dispositivo occupato poiché alcuni processi utilizzavano la partizione. Non voglio uccidere i processi …

19 linux filesystems mount readonly

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Come posso replicare le selezioni dei pacchetti installati da un sistema Debian a un altro? (Debian Wheezy)

Sto provando a configurare un ambiente di gestione temporanea in una macchina virtuale, al fine di testare gli aggiornamenti prima di applicarli al mio sistema principale. Per fare ciò, ho fatto un'installazione di base di Debian Wheezy (uguale al sistema principale) nella VM, quindi ho eseguito come root dall'interno della …

19 debian package-management dpkg

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in quale ordine viene analizzata la tabella di percorso?

Sul mio pc devo seguire la seguente tabella di routing: Destination Gateway Genmask Flags MSS Window irtt Iface 0.0.0.0 192.168.1.1 0.0.0.0 UG 0 0 0 wlan0 192.168.1.0 0.0.0.0 255.255.255.0 U 0 0 0 wlan0 Non capisco come viene analizzato, intendo dall'alto verso il basso o dal basso verso l'alto? Se …

19 route table