C'è qualche vantaggio nella compilazione di LAPACK dal sorgente rispetto all'installazione del pacchetto precompilato da Ubuntu?

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So che ATLAS è in grado di ottimizzarsi per la macchina su cui è compilato e quindi i massimi benefici si ottengono compilando dalla fonte. C'è qualche vantaggio nella compilazione di LAPACK dalla fonte? Sarebbe molto più semplice installare il pacchetto predefinito.

performance lapack

— OSE
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Potrebbe valere la pena provare questa tecnica per capire perché il tempo è trascorso. Ho scoperto che, se sto lavorando molto con matrici non grandi, le routine di libreria impiegano più della metà del loro tempo a classificare i loro flag dei caratteri di input e altre classificazioni di input, quindi potresti ottenere molto speedup aumentando la libreria con alcune routine ben codificate a mano.

— Mike Dunlavey,

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OpenBlas è abbastanza veloce, quindi puoi collegarlo a LAPACK. Hai provato la versione precompilata di LAPACK / BLAS dal tuo fornitore di CPU? Ad esempio AMD ACML (gratuito) o Intel MKL (gratuito su Linux per uso non commerciale e non accademico)? Devi semplicemente decomprimere ed eseguire il file di installazione.

A mio avviso, l'unico vantaggio dell'utilizzo di ATLAS è quando si utilizza una CPU insolita. In caso contrario, utilizzare quello del fornitore della CPU. Inoltre sono disponibili le versioni nVIDIA CUDA e AMD OpenCL che fanno davvero rock.

EDIT: ricorda che puoi sempre creare un pacchetto DEB Ubuntu dal sorgente, che di solito è molto più semplice della compilazione del software dal sorgente.

— Miseria
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Penso che seguirò il tuo suggerimento e installerò MKL. Inoltre, grazie per il suggerimento sulla creazione di pacchetti DEB, non sapevo che fosse possibile.

— OSE,

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Ricorda che devi configurare ld (linker librerie dinamiche per poter trovare quelle librerie). BLAS e LAPACK di Intel MKL si trovano nel libmkl_rt.sofile solitamente collegato usando:-L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_rt

— Misery il

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Va sottolineato che la licenza non commerciale di Intel è diventata sempre più restrittiva con ogni versione, al punto in cui sono ora molto espliciti sul fatto che l'uso accademico non è coperto da essa non appena si ottengono soldi per la propria ricerca.

— Christian Clason,

Vale la pena menzionare. Tuttavia, è possibile testarlo gratuitamente:] E se si rivela utile, non è la cosa più costosa al mondo.

— Miseria,

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Il pacchetto di repository non è sicuro da utilizzare con il threading a causa del modo in cui è stato compilato. Ho segnalato il bug sul forum di Lapack , ma ci vorrà molto tempo perché soluzioni alternative o soluzioni finiscano nel repository. Se lo compili tu stesso, assicurati di aggiungere "-frecursive" a gfortran.

— Victor Liu
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Nella mia esperienza, il modo migliore per usare blas / lapack nelle recenti versioni di Ubuntu è usare gli openblas in pacchetto.

Per quello che vale, uso principalmente blas / lapack tramite python numpy / scipy e l'utilizzo di openblas accelera parte dell'algebra lineare di circa 200x rispetto al valore predefinito. Ho provato ad usare ATLAS personalizzato, ma è stato un grande dolore e non ho dato molto se ho avuto qualche speedup contro openblas, ma avrei potuto sbagliare.

— clipper
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