Modello di effetti misti binomiali negativi a zero inflazionati in R


17

Esiste un tale pacchetto che prevede la stima del modello di effetti misti binomiali negativi a zero inflazionati in R?

Con ciò intendo:

  • Inflazione zero in cui è possibile specificare il modello binomiale per l'inflazione zero, come nella funzione zeroinfl nel pacchetto pscl:

    zeroinfl (y ~ X | Z, dist = "negbin")
    dove Z è la formula per il modello di inflazione zero;

  • Distribuzione binomiale negativa per la parte di conteggio del modello;

  • Effetti casuali specificati simili alla funzione lmer del pacchetto lme4.

Capisco che glmmADMB può fare tutto ciò, tranne che la formula per l'inflazione zero non può essere specificata (è solo un'intercettazione, cioè Z è solo 1). Ma ci sono altri pacchetti che possono fare tutto?

Sarò molto grato per il tuo aiuto!


Sto cercando la stessa cosa. Penso che glmmADMB sia quello che voglio, ma non riesco a farlo funzionare.
gregmacfarlane,

Mi chiedo se i pacchetti ZIM o aod possano fare quello che vuoi fare?
Graeme Walsh,

2
Come aggiornamento, il pacchetto glmmTMB di Ben Bolker supporta un modello misto lineare generalizzato a gonfiaggio zero (ZIGLMM).
JWilliman,

Risposte:



1

Il pacchetto pscl prevede un modello Poisson a gonfiaggio zero. Non penso che possa fare un modello binomiale negativo, ma potrebbe essere un punto di partenza. L'articolo JSS collegato tratta anche i pacchetti correlati, che possono portare a ciò che stai cercando.


1
Il pacchetto pscl (ora) consente modelli binomiali negativi usandozeroinfl(..., dist = "negbin", ...)
user2390246

0

A seconda di cosa stai cercando di fare, potresti voler guardare il pacchetto aster . I modelli di aster consentono l'analisi congiunta di più variabili con diverse distribuzioni di probabilità e recentemente sono state aggiornate per consentire effetti casuali . Sono stati progettati per l'analisi della storia della vita e funzioneranno in situazioni in cui è possibile dividere la risposta in parti distinte con diverse distribuzioni, (ad esempio sopravvivenza = Bernoulli, riproduzione = Poisson). Sono in grado di gestire "l'inflazione zero" modellando la maggior parte degli zero come bernoulli e il resto della risposta come binomiale negativo.

Troverai molta documentazione qui:

http://www.stat.umn.edu/geyer/aster/

Utilizzando il nostro sito, riconosci di aver letto e compreso le nostre Informativa sui cookie e Informativa sulla privacy.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.