Scienza computazionale libraries

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È comune non usare le librerie per algoritmi numerici standard e perché?

Molti algoritmi numerici (integrazione, differenziazione, interpolazione, funzioni speciali, ecc.) Sono disponibili in librerie di calcolo scientifico come GSL . Ma vedo spesso il codice con implementazioni "manuali" di queste funzioni. Per i piccoli programmi che non sono necessariamente destinati alla distribuzione pubblica, è pratica comune tra gli scienziati computazionali implementare …

54 libraries c

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Librerie matematiche per OpenCL?

Sto cercando informazioni da chiunque abbia tentato di utilizzare OpenCL nel proprio codice scientifico. Qualcuno ha provato (recentemente) ViennaCL ? In tal caso, come si confronta con la cuspide ? Che dire di OCLTools ? È all'altezza della promessa? In tal caso, sarebbe un modo fattibile per iniziare a scrivere …

35 parallel-computing libraries programming-paradigms viennacl opencl

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Differenze di prestazione tra ATLAS e MKL?

ATLAS è un sostituto BLAS / LAPACK gratuito che si sintonizza sulla macchina durante la compilazione. MKL è la libreria commerciale fornita da Intel. Queste due librerie sono comparabili quando si tratta di prestazioni o MKL ha il sopravvento per alcune attività? Se sì, quali?

31 linear-algebra libraries performance intel-mkl

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Librerie per la risoluzione di sistemi lineari sparsi

Esistono diverse librerie che risolvono un sistema di equazioni sparse e lineari, tuttavia trovo difficile capire quali siano le differenze. Per quanto ne so, ci sono tre pacchetti principali: Trilinos , PETSc e Intel MKL . Sono tutti in grado di eseguire soluzioni a matrice sparsa, sono tutti veloci (per …

21 linear-algebra linear-solver libraries

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Libreria tensore C ++ veloce e leggera per codice indipendente dalla dimensione

Sto cercando una libreria tensoriale C ++ che supporti il codice indipendente dalla dimensione. In particolare, devo eseguire operazioni lungo ciascuna dimensione (fino a 3), ad esempio calcolando una somma ponderata. Le dimensioni sono un parametro modello (e quindi una costante di compilazione). Un altro vincolo è che la libreria …

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Esiste una libreria per scopi generici per il perfezionamento della mesh adattativa a griglia strutturata?

Vuoi migliorare questo post? Fornisci risposte dettagliate a questa domanda, comprese le citazioni e una spiegazione del perché la tua risposta è corretta. Le risposte senza dettagli sufficienti possono essere modificate o eliminate. Il raffinamento di maglie adattative (AMR) è una tecnica comune per affrontare il problema delle scale spaziali …

18 pde libraries parallel-computing adaptive-mesh-refinement

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Quali librerie hanno un buon supporto di alto livello per multigrid?

Sto pianificando di utilizzare multigrid per calcolare alcuni autovalori e vettori e ho notato che PETSc ha un supporto di alto livello per multigrid. La documentazione PETSc afferma che questa parte di PETSc non deve essere utilizzata, poiché verrà presto sostituita. Quali altre librerie hanno un supporto di alto livello …

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Esistono implementazioni ILU multilivello inverse basate su più livelli?

Sono rimasto molto colpito dalle prestazioni seriali dei precondizionatori ILU multilivello basati su inverse , in particolare per l' eterogenea Helmholtz , ma sono sorpreso di non riuscire a trovare implementazioni open source. In particolare, ILUPACK rende i binari liberamente disponibili per gli accademici, ma non sembra che rilascino il …

15 pde algorithms linear-solver libraries preconditioning

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C ++ o Python per uno sviluppo della libreria CFD

Quali diresti sarebbero i vantaggi / gli svantaggi di due approcci alla codifica di una libreria generale (volume finito, fem, dg) per la meccanica del calcolo continuo? Questo è il modo in cui vedo le cose in questo momento, quindi per favore fornisci le tue esperienze e non darmi fuoco …

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Sostituendo l'integrazione QuasiMonteCarlo di Mathematica in C ++

Ho un programma Mathematica che esegue alcuni integrali in 3 o 4 dimensioni usando il QuasiMonteCarlometodo. Il problema è che richiede un tempo fastidiosamente lungo per essere eseguito, al punto che alcuni di questi calcoli non possono essere completati nel tempo di lavoro massimo disponibile sul nostro cluster HPC. Quindi …

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Implementazione efficiente dell'algoritmo a matrice tridiagonale

Sto risolvendo un problema fisico usando uno schema numerico implicito. Questo mi porta a risolvere un'equazione lineare con matrice tridiagonale. Ho codificato questo algoritmo da Wikipedia. Mi chiedo se esiste una libreria efficiente che consenta di risolvere questo tipo di equazione in modo ottimizzato. Una nota importante è che la …

12 linear-algebra libraries c++

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Sto cercando una libreria di grafici dinamici paralleli in C ++

Ciao comunità scicomp, Ho lavorato nell'area degli algoritmi grafici usando framework come NetworkX (Python), JUNG e YFiles (Java). Ora sto entrando nell'area dell'informatica parallela e ad alte prestazioni. Per un nuovo progetto, sto cercando una libreria di grafici C ++ con le seguenti funzionalità: ha un'interfaccia intuitiva che consente lo …

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Libreria per trasformata di Fourier su reticolo triangolare

Sto cercando implementazioni ragionevolmente veloci della trasformata discreta di Fourier (DFT) su un reticolo triangolare o esagonale 2D. Gradirei suggerimenti su tali implementazioni (specialmente quelle facilmente utilizzabili da Python o Mathematica), e anche sulle descrizioni di come ridurre questo problema al DFT 1D, che è già integrato in molti sistemi.

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Alla ricerca di Runge-Kutta 8 ° ordine in C / C ++

Vorrei usare il metodo Runge-Kutta dell'8 ° ordine (89) in un'applicazione di meccanica / astrodinamica celeste, scritta in C ++, usando una macchina Windows. Quindi mi chiedo se qualcuno conosce una buona libreria / implementazione documentata e libera da usare? Va bene se è scritto in C, purché non ci …

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Librerie parallele a memoria condivisa basate su attività nel calcolo scientifico

Negli ultimi anni sono apparsi numerosi progetti di biblioteche / software che offrono in qualche modo un parallelismo della memoria condivisa basato sui dati per scopi generici. L'idea principale è che invece di scrivere un codice esplicitamente thread, i programmatori implementano i loro algoritmi come attività interdipendenti che vengono quindi …

10 parallel-computing software hpc libraries multicore

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