lme4 e nlme sono pacchetti R utilizzati per il montaggio di modelli di effetti misti lineari, lineari generalizzati e non lineari. Per domande generali sui modelli misti utilizzare il tag [modello misto].
Sto cercando di adattare un modello misto multivariato (ovvero, risposta multipla) R. A parte i pacchetti ASReml-re SabreR(che richiedono software esterno), sembra che ciò sia possibile solo in MCMCglmm. Nel documento che accompagna il MCMCglmmpacchetto (pagg.6), Jarrod Hadfield descrive il processo di adattamento di un modello come il rimodellamento di …
Ho appena (ri) letto il perché di Gelman (di solito) non dobbiamo preoccuparci di confronti multipli . In particolare, la sezione "Risultati multipli e altre sfide" menziona l'uso di un modello gerarchico per situazioni in cui vi sono più misure correlate della stessa persona / unità in tempi / condizioni …
Voglio modellare due diverse variabili temporali, alcune delle quali sono fortemente collineari nei miei dati (età + coorte = periodo). In questo modo mi sono imbattuto in alcuni problemi con ee lmerinterazioni di poly(), ma probabilmente non è limitato a lmer, ho ottenuto gli stessi risultati con nlmeIIRC. Ovviamente manca …
Sto finendo alcune analisi su un ampio set di dati. Vorrei prendere il modello lineare utilizzato nella prima parte del lavoro e rimontarlo utilizzando un modello misto lineare (LME). L'LME sarebbe molto simile con l'eccezione che una delle variabili utilizzate nel modello sarebbe utilizzata come effetto casuale. Questi dati provengono …
Questa è più una domanda concettuale, ma mentre uso Rfarò riferimento ai pacchetti in R. Se l'obiettivo è quello di adattare un modello lineare ai fini della previsione, e quindi fare previsioni in cui gli effetti casuali potrebbero non essere disponibili, ci sono dei vantaggi nell'utilizzare un modello a effetti …
Sto analizzando i dati di tracciamento oculare da un esperimento progettato. Una versione semplificata dei miei dati è simile a questa (Puoi ottenere i dati dput () qui ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 …
Sto analizzando alcuni dati comportamentali usando lme4in R, principalmente seguendo gli eccellenti tutorial di Bodo Winter , ma non capisco se sto gestendo correttamente le interazioni. Peggio ancora, nessun altro coinvolto in questa ricerca utilizza modelli misti, quindi sono un po 'alla deriva quando si tratta di assicurarsi che le …
Qual è la struttura di varianza-covarianza predefinita per gli effetti casuali in glmero lmernel lme4pacchetto? Come si specifica un'altra struttura varianza-covarianza per effetti casuali nel codice? Non sono riuscito a trovare informazioni al riguardo nella lme4documentazione.
Mi sento sopraffatto dopo aver tentato di approfondire la letteratura su come eseguire la mia analisi di modelli misti seguendola con l'utilizzo di AIC per selezionare il modello oi modelli migliori. Non credo che i miei dati siano così complicati, ma sto cercando conferma che ciò che ho fatto sia …
Intro Ho partecipanti che toccano ripetutamente superfici contaminate con E. coli in due condizioni ( A = indossando guanti, B = senza guanti). Voglio sapere se c'è una differenza tra la quantità di batteri sulla punta delle dita con e senza guanti, ma anche tra il numero di contatti. Entrambi …
L'occorrenza non così rara quando si ha a che fare con modelli misti massimi complessi (stimando tutti i possibili effetti casuali per dati e modello dati) è perfetta (+1 o -1) o correlazione quasi perfetta tra alcuni effetti casuali. Ai fini della discussione, osserviamo il seguente modello e riepilogo del …
Ho alcune domande in merito alle specifiche e all'interpretazione dei GLMM. 3 domande sono sicuramente statistiche e 2 sono più specifiche su R. Sto pubblicando qui perché alla fine penso che il problema sia l'interpretazione dei risultati GLMM. Attualmente sto provando a montare un GLMM. Sto usando i dati del …
Sto inserendo un modello di effetti misti con un termine spline in un'applicazione in cui la tendenza nel tempo è nota per essere curvilinea. Tuttavia, ciò che vorrei valutare è se la tendenza curvilinea si verifica a causa della deviazione individuale dalla linearità o è un effetto a livello di …
Sto usando lmer in R per verificare l'effetto di condition ( cond) su alcuni risultati. Ecco alcuni dati inventati, dove s è l'identificatore del soggetto e a, be csono le condizioni. library("tidyr") library("dplyr") set.seed(123) temp <- data.frame(s = paste0("S", 1:30), a = rnorm(30, -2, 1), b = rnorm(30, -3, 1), …
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