Statistiche e Big Data lme4-nlme

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Specificare più effetti casuali (separati) in lme [chiuso]

Chiuso. Questa domanda è fuori tema . Al momento non accetta risposte. Vuoi migliorare questa domanda? Aggiorna la domanda in modo che sia in argomento per Cross Validated. Chiuso 6 mesi fa . Stavo lavorando nei pacchetti R nlme e lme4 , cercando di specificare i modelli con molteplici effetti …

25 r random-effects-model lme4-nlme

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Perché lme e aov restituiscono risultati diversi per le misure ripetute ANOVA in R?

Sto cercando di passare dall'uso del ezpacchetto a lmemisure ripetute ANOVA (poiché spero di poter usare contrasti personalizzati con lme). Seguendo i consigli di questo post sul blog sono stato in grado di impostare lo stesso modello usando entrambi aov(come fa ez, quando richiesto) e lme. Tuttavia, mentre nell'esempio riportato …

24 r anova mixed-model repeated-measures lme4-nlme

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Ha senso che un effetto fisso sia nidificato in uno casuale o come codificare misure ripetute in R (aov e lmer)?

Ho esaminato questa panoramica delle formule lm / lmer R di @conjugateprior e mi sono confuso con la seguente voce: Ora supponiamo che A sia casuale, ma B sia fisso e B sia nidificato all'interno di A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Di seguito lmer(Y ~ B + (1 …

23 r anova mixed-model repeated-measures lme4-nlme

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Calcolo delle dimensioni del campione per modelli misti

Mi chiedo se ci sono metodi per calcolare la dimensione del campione in modelli misti? Sto usando lmerin R per adattarsi ai modelli (ho pendenze e intercettazioni casuali).

23 r mixed-model lme4-nlme power-analysis

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Perché ottengo la varianza zero di un effetto casuale nel mio modello misto, nonostante alcune variazioni nei dati?

Abbiamo eseguito una regressione logistica a effetti misti utilizzando la sintassi seguente; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Oggetto e oggetto sono gli effetti casuali. Stiamo ottenendo un risultato dispari che è il coefficiente …

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Correlazione intraclasse (ICC) per un'interazione?

Supponiamo che io abbia delle misurazioni per ogni soggetto in ciascun sito. Due variabili, soggetto e sito, sono interessanti in termini di calcolo dei valori di correlazione intraclasse (ICC). Tipicamente userei la funzione lmerdal pacchetto R lme4, ed eseguivo lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | site), …

22 r lme4-nlme intraclass-correlation

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Come applicare il GLMM binomiale (glmer) alle percentuali piuttosto che ai conteggi sì-no?

Ho un esperimento di misure ripetute in cui la variabile dipendente è una percentuale e ho più fattori come variabili indipendenti. Mi piacerebbe usare glmerdal pacchetto R lme4per trattarlo come un problema di regressione logistica (specificando family=binomial) poiché sembra adattarsi direttamente a questa configurazione. I miei dati si presentano così: …

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Avviso "Il modello non è riuscito a convergere" in lmer ()

Con il seguente set di dati, volevo vedere se la risposta (effetto) cambia in relazione a siti, stagione, durata e loro interazioni. Alcuni forum online sulle statistiche mi hanno suggerito di continuare con i modelli lineari a effetti misti, ma il problema è che, poiché i replicati sono randomizzati all'interno …

21 r mixed-model lme4-nlme

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lme () e lmer () che danno risultati contrastanti

Ho lavorato con alcuni dati che hanno alcuni problemi con misurazioni ripetute. In tal modo ho notato un comportamento molto diverso tra lme()e lmer()utilizzando i miei dati di test e voglio sapere perché. Il set di dati falsi che ho creato ha misurazioni di altezza e peso per 10 soggetti, …

20 r mixed-model lme4-nlme

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Confronti consentiti di modelli di effetti misti (principalmente effetti casuali)

Ho esaminato la modellazione di effetti misti usando il pacchetto lme4 in R. Uso principalmente il lmercomando, quindi porrò la mia domanda attraverso il codice che usa quella sintassi. Suppongo che potrebbe essere una domanda semplice generale, è corretto confrontare due modelli costruiti lmerutilizzando rapporti di probabilità basati su set …

20 r mixed-model lme4-nlme likelihood-ratio

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T-test associato come caso speciale di modellazione lineare ad effetti misti

Sappiamo che un test t accoppiato è solo un caso speciale di ANOVA a misure ripetute a senso unico (o all'interno del soggetto) e modello lineare a effetto misto, che può essere dimostrato con la funzione lme () il pacchetto nlme in R come mostrato di seguito. #response data from …

20 r mixed-model t-test repeated-measures lme4-nlme

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Come scegliere la struttura di effetti casuali e fissi in modelli misti lineari?

Considera i seguenti dati da una progettazione bidirezionale all'interno dei soggetti: df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 Jim …

19 mixed-model repeated-measures model-selection lme4-nlme likelihood-ratio

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Confronto di modelli non nidificati con AIC

Di 'che dobbiamo GLMM mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) Questi modelli non sono nidificati nel solito senso di: a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) b …

19 r mixed-model aic lme4-nlme nested-models

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Lmer () può usare le spline come effetti casuali?

Supponiamo che stiamo lavorando su un modello di effetti casuali di alcuni dati di conteggio nel tempo e che vogliamo controllare alcune tendenze. Normalmente, faresti qualcosa del tipo: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") per includere una forma quadratica per t. È possibile utilizzare alcune tecniche di levigatura più sofisticate …

19 mixed-model lme4-nlme splines

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Interpretazione di tre forme di un "modello misto"

C'è una distinzione che mi fa inciampare con modelli misti, e mi chiedo se potrei avere un po 'di chiarezza su di esso. Supponiamo che tu abbia un modello misto di dati di conteggio. C'è una variabile che sai di voler come effetto fisso (A) e un'altra variabile per il …

19 r mixed-model lme4-nlme

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