Statistiche e Big Data r

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Interpretazione del dip test di Hartigans

Vorrei trovare un modo per quantificare l'intensità della bimodalità di alcune distribuzioni ottenute empiricamente. Da quello che ho letto, c'è ancora qualche dibattito sul modo di quantificare la bimodalità. Ho scelto di utilizzare il dip test di Hartigans che sembra essere l'unico disponibile su R (documento originale: http://www.stat.washington.edu/wxs/Stat593-s03/Literature/hartigan85a.pdf ). Il …

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Perché la statistica gap per k-medie suggerisce un cluster, anche se ce ne sono ovviamente due?

Sto usando K-means per raggruppare i miei dati e stavo cercando un modo per suggerire un numero di cluster "ottimale". Le statistiche sui gap sembrano essere un modo comune per trovare un buon numero di cluster. Per qualche motivo restituisce 1 come numero di cluster ottimale, ma quando guardo i …

18 r machine-learning clustering k-means

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Rilevamento delle modifiche nelle serie temporali (esempio R)

Vorrei rilevare i cambiamenti nei dati delle serie temporali, che di solito hanno la stessa forma. Finora ho lavorato con il changepointpacchetto per R e le funzioni cpt.mean(), cpt.var()e cpt.meanvar(). cpt.mean()con il metodo PELT funziona bene quando i dati di solito rimangono su un livello. Tuttavia, vorrei anche rilevare i …

18 r time-series change-point structural-change

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Utilizzando bootstrap sotto H0 per eseguire un test per la differenza di due mezzi: sostituzione all'interno dei gruppi o all'interno del campione in pool

Supponiamo che io abbia un dato con due gruppi indipendenti: g1.lengths <- c (112.64, 97.10, 84.18, 106.96, 98.42, 101.66) g2.lengths <- c (84.44, 82.10, 83.26, 81.02, 81.86, 86.80, 85.84, 97.08, 79.64, 83.32, 91.04, 85.92, 73.52, 85.58, 97.70, 89.72, 88.92, 103.72, 105.02, 99.48, 89.50, 81.74) group = rep (c ("g1", "g2"), …

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GLM binomiale negativo vs. trasformazione del log per i dati di conteggio: aumento del tasso di errore di tipo I.

Alcuni di voi potrebbero aver letto questo bel documento: O'Hara RB, Kotze DJ (2010) Non registrare i dati di conteggio della trasformazione. Metodi in Ecologia ed Evoluzione 1: 118-122. Klick . Nel mio campo di ricerca (ecotossicologia) abbiamo a che fare con esperimenti scarsamente replicati e le GLM non sono …

18 r generalized-linear-model simulation negative-binomial type-i-and-ii-errors

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Algoritmi di clustering che operano su matrici di dati sparsi [chiuso]

Chiuso. Questa domanda è fuori tema . Al momento non accetta risposte. Vuoi migliorare questa domanda? Aggiorna la domanda in modo che sia in argomento per Cross Validated. Chiuso 5 anni fa . Sto cercando di compilare un elenco di algoritmi di clustering che sono: Implementato in R Operare su …

18 r clustering sparse

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Qual è la relazione tra la probabilità del profilo e gli intervalli di confidenza?

Per creare questo grafico ho generato campioni casuali di dimensioni diverse da una distribuzione normale con media = 0 e sd = 1. Gli intervalli di confidenza sono stati quindi calcolati utilizzando valori di cut-off alfa compresi tra 0,001 e 0,999 (linea rossa) con la funzione t.test (), la probabilità …

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Regressione lineare con vincolo di pendenza

Voglio eseguire una regressione lineare molto semplice in R. La formula è semplice come . Tuttavia, vorrei che la pendenza ( ) fosse all'interno di un intervallo, diciamo, tra 1.4 e 1.6.y= a x + by=un'X+By = ax + bun'un'a Come si può fare?

18 r regression constrained-regression

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Matrice varianza-covarianza in lmer

So che uno dei vantaggi dei modelli misti è che consentono di specificare la matrice varianza-covarianza per i dati (simmetria composta, autoregressiva, non strutturata, ecc.) Tuttavia, la lmerfunzione in R non consente di specificare facilmente questa matrice. Qualcuno sa quale struttura lmerutilizza per impostazione predefinita e perché non è possibile …

18 r mixed-model lme4-nlme covariance-matrix

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In che modo la foresta casuale estrema differisce dalla foresta casuale?

L'implementazione di ER è più efficiente ( Extreme Gradient Boostingè come aumentare il gradiente) - la differenza è importante dal punto di vista pratico? C'è un pacchetto R che li implementa. È un nuovo algoritmo che supera l'implementazione "generica" (pacchetto RandomForest da R) non solo in termini di efficienza o …

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Distanze Mahalanobis a coppie

Devo calcolare la distanza di Mahalanobis del campione in R tra ogni coppia di osservazioni in una matrice di covariate. Ho bisogno di una soluzione efficiente, ovvero vengono calcolate solo distanze, e preferibilmente implementate in C / RCpp / Fortran ecc. Suppongo che , la matrice di covarianza della popolazione, …

18 r algorithms distance

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Qual è il valore " " dato nel sommario di un modello di coxph in R

Qual è il valore R2R2R^2 dato nel sommario di un modello coxph in R? Per esempio, Rsquare= 0.186 (max possible= 0.991 ) Ho stupidamente incluso un manoscritto come valore R2R2R^2 e il revisore ci ha fatto un balzo dicendo che non era a conoscenza di un analogo della statistica R2R2R^2 …

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Opzioni di analisi dei dati fuori core

Uso SAS da quasi 5 anni. L'ho installato sul mio laptop e spesso devo analizzare set di dati con 1.000-2.000 variabili e centinaia di migliaia di osservazioni. Ho cercato alternative a SAS che mi permettessero di condurre analisi su set di dati di dimensioni simili. Sono curioso di sapere cosa …

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Quali solidi metodi di correlazione sono effettivamente utilizzati?

Ho intenzione di fare uno studio di simulazione in cui metto a confronto le prestazioni di diverse tecniche di correlazione robuste con diverse distribuzioni (inclinate, con valori anomali, ecc.). Con robusto , intendo il caso ideale di essere robusto contro a) distribuzioni distorte, b) valori anomali ec) code pesanti. Insieme …

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Come dovrebbero essere calcolati gli errori standard per le stime del modello di effetti misti?

In particolare, come dovrebbero essere calcolati gli errori standard degli effetti fissi in un modello lineare di effetti misti (in senso frequentista)? Sono stato portato a credere che le stime tipiche ( ), come quelle presentate in Laird e Ware [1982] daranno a SE quello sono sottostimati in termini di …

18 r mixed-model random-effects-model

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